292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0941 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0941  putative D-mannonate oxidoreductase protein  100 
 
 		 492 aa  1017    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000798922  hitchhiker  0.00848931 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  52.35 
 
 		 493 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.226304  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4245  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  49.69 
 
 		 486 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.101658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3896  Altronate oxidoreductase  49.9 
 
 		 489 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409973  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0761  mannitol dehydrogenase family protein  47.53 
 
 		 497 aa  477  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.155423  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2118  putative mannitol dehydrogenase family protein  47.85 
 
 		 493 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1271  D-mannonate oxidoreductase  47.78 
 
 		 490 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.291275 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2321  mannitol dehydrogenase family protein  49.27 
 
 		 488 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.312061  hitchhiker  0.00251444 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2768  fructuronate reductase  47.54 
 
 		 488 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.108478  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02102  predicted dehydrogenase, NAD-dependent  48.22 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1485  Mannitol dehydrogenase domain protein  48.22 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0767532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2470  mannitol dehydrogenase family protein  48.43 
 
 		 488 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0192683  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3310  mannitol dehydrogenase family protein  48.22 
 
 		 488 aa  446  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0250871  normal  0.029838 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1475  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  48.22 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0453772  hitchhiker  0.000115044 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2310  mannitol dehydrogenase family protein  48.22 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0175582  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02061  hypothetical protein  48.22 
 
 		 488 aa  445  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2884  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.62 
 
 		 505 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0583  Mannitol dehydrogenase domain  48.02 
 
 		 510 aa  441  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.158785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3239  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.14 
 
 		 493 aa  437  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200005 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2132  fructuronate reductase  51.49 
 
 		 464 aa  435  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.709802 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2405  fructuronate reductase  50.9 
 
 		 459 aa  436  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.398566 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0928  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.44 
 
 		 495 aa  436  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04192  D-mannonate oxidoreductase, NAD-binding  46.11 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3674  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.11 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0480  D-mannonate oxidoreductase  51.16 
 
 		 455 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4022  Mannitol dehydrogenase domain  48.46 
 
 		 485 aa  434  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4791  fructuronate reductase  46.11 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0976  Mannitol dehydrogenase domain protein  46.43 
 
 		 497 aa  435  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04154  hypothetical protein  46.11 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4850  fructuronate reductase  45.89 
 
 		 486 aa  432  1e-120  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1267  Fructuronate reductase  46.95 
 
 		 490 aa  434  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38689  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5829  fructuronate reductase  46.11 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4549  mannitol dehydrogenase family protein  46.11 
 
 		 486 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4921  mannitol dehydrogenase family protein  45.89 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5747  Mannitol dehydrogenase domain  44.56 
 
 		 492 aa  432  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.192537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3481  D-mannonate oxidoreductase  46.12 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3308  D-mannonate oxidoreductase  46.33 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3318  D-mannonate oxidoreductase  46.33 
 
 		 490 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0814111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0693  Mannitol dehydrogenase domain protein  45.85 
 
 		 495 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4721  Mannitol dehydrogenase domain  49.09 
 
 		 496 aa  430  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.821949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3382  D-mannonate oxidoreductase  46.12 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.63605 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1678  D-mannonate oxidoreductase  44.97 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1623  mannitol dehydrogenase family protein  43.94 
 
 		 486 aa  430  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000610622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1664  D-mannonate oxidoreductase  45.17 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.08595  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1610  D-mannonate oxidoreductase  44.97 
 
 		 488 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3388  D-mannonate oxidoreductase  45.91 
 
 		 490 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.270423 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2116  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.53 
 
 		 486 aa  425  1e-118  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000373303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3363  Fructuronate reductase  44.58 
 
 		 498 aa  427  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1619  D-mannonate oxidoreductase  44.97 
 
 		 488 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.59299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1935  fructuronate reductase  45.19 
 
 		 487 aa  425  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2158  mannitol dehydrogenase family protein  43.94 
 
 		 486 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000417107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1698  mannitol dehydrogenase family protein  43.94 
 
 		 486 aa  427  1e-118  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000693484  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01501  predicted mannonate dehydrogenase  43.53 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000347408  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1751  mannitol dehydrogenase family protein  43.74 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158855  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2103  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.74 
 
 		 486 aa  423  1e-117  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000135615  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1830  D-mannonate oxidoreductase  44.97 
 
 		 488 aa  425  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0851993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4352  Mannitol dehydrogenase domain proteiin  47.6 
 
 		 484 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000397508 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4497  mannitol dehydrogenase-like  46.09 
 
 		 478 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01512  hypothetical protein  43.53 
 
 		 486 aa  422  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000296924  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1632  mannitol dehydrogenase family protein  43.53 
 
 		 486 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000913055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3560  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  44.58 
 
 		 509 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3566  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  46.2 
 
 		 490 aa  418  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0132  D-mannonate oxidoreductase NAD-binding  44.06 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.59872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2638  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.94 
 
 		 490 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2779  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.71 
 
 		 490 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2702  mannitol dehydrogenase family protein  43.71 
 
 		 490 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1039  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.55 
 
 		 488 aa  409  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0905  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.72 
 
 		 493 aa  410  1e-113  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0805  Mannitol dehydrogenase domain protein  43.04 
 
 		 488 aa  404  1e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.391687  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0643  mannitol dehydrogenase-like protein  41.46 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.319971  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27360  Mannitol dehydrogenase  40.61 
 
 		 491 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0779  mannitol dehydrogenase-like  42.68 
 
 		 500 aa  388  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.648413  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3524  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.66 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3678  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  45.66 
 
 		 460 aa  386  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.880723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1282  Mannitol dehydrogenase domain protein  40.6 
 
 		 528 aa  379  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.91311  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2979  mannitol dehydrogenase-like protein  44.74 
 
 		 485 aa  377  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34360  mannitol dehydrogenase  39.04 
 
 		 491 aa  375  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00481887  normal  0.467115 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4543  Mannitol dehydrogenase domain protein  39.96 
 
 		 494 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0508  mannitol dehydrogenase family protein  43.48 
 
 		 498 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.184612  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5134  fructuronate reductase  43.53 
 
 		 491 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1006  Mannitol dehydrogenase domain protein  44.62 
 
 		 493 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.128088 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4601  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  43.16 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0872414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2094  mannitol dehydrogenase family protein  43.48 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1999  mannitol dehydrogenase family protein  43.48 
 
 		 489 aa  372  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492206  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0768  mannitol dehydrogenase family protein  43.25 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2436  mannitol dehydrogenase  38.26 
 
 		 493 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114445  hitchhiker  0.00481039 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0581  mannitol dehydrogenase family protein  43.25 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.372441  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0692  mannitol dehydrogenase family protein  43.25 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.340318  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07170  mannitol-1-phosphate/altronate dehydrogenase  44.47 
 
 		 451 aa  370  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.564088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1646  mannitol dehydrogenase family protein  43.25 
 
 		 489 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2703  D-mannonate oxidoreductase  38.9 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00357534  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3302  mannitol dehydrogenase  42.02 
 
 		 490 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.059304 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1753  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  41.98 
 
 		 485 aa  364  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2921  mannitol dehydrogenase  39.46 
 
 		 491 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.487469  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1903  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  40 
 
 		 506 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.267485  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2866  mannitol dehydrogenase-like  40.59 
 
 		 503 aa  362  6e-99  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.540651  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2037  mannitol dehydrogenase domain-containing protein  38.4 
 
 		 491 aa  362  8e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.548675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3047  mannitol dehydrogenase-like protein  46.98 
 
 		 430 aa  362  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116808 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4472  fructuronate reductase  39.26 
 
 		 491 aa  361  2e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.194992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2636  mannitol dehydrogenase  38.62 
 
 		 490 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>