More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0693 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0693  triosephosphate isomerase  100 
 
 		 257 aa  533  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.444699  unclonable  0.0000000042345 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1767  triosephosphate isomerase  45.6 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.91306  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0984  Triose-phosphate isomerase  42.52 
 
 		 253 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1972  triosephosphate isomerase  45.34 
 
 		 250 aa  216  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0120273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1966  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 256 aa  215  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000820066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2566  triosephosphate isomerase  43.78 
 
 		 250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.566971  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2544  triosephosphate isomerase  42.74 
 
 		 250 aa  215  5.9999999999999996e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1615  triosephosphate isomerase  48.35 
 
 		 255 aa  214  9.999999999999999e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1476  triosephosphate isomerase  43.9 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1003  triosephosphate isomerase  44.09 
 
 		 260 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0343606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3421  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000876569  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1124  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000121721  unclonable  0.00000000000528037 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1122  triosephosphate isomerase  44.58 
 
 		 251 aa  211  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000274179  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3284  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371764  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3243  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000257421  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2838  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  211  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000084878  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1022  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  209  3e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178614  hitchhiker  0.000431545 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1200  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1087  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059681  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1026  triosephosphate isomerase  43.7 
 
 		 260 aa  209  5e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000672651  hitchhiker  0.0000521404 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0957  triosephosphate isomerase  43.19 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0345759  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2831  triosephosphate isomerase  43.58 
 
 		 260 aa  208  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000042953  hitchhiker  0.00389109 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3393  triosephosphate isomerase  43.53 
 
 		 260 aa  208  8e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000164415  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3565  triosephosphate isomerase  43.58 
 
 		 260 aa  207  9e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.147919  hitchhiker  0.00000496067 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3064  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 260 aa  207  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000137173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1574  triosephosphate isomerase  45.12 
 
 		 249 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0183532  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0986  triosephosphate isomerase  43.31 
 
 		 260 aa  206  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000192621  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1089  triosephosphate isomerase  41.8 
 
 		 253 aa  206  4e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0264  triosephosphate isomerase  43.15 
 
 		 249 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0927  triosephosphate isomerase  41.53 
 
 		 250 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0497  triosephosphate isomerase  43.6 
 
 		 252 aa  204  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49910  triosephosphate isomerase  44.66 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.258147  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0815  triosephosphate isomerase  43.53 
 
 		 253 aa  202  3e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000244559  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3825  Triose-phosphate isomerase  42.23 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0712505  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0706  triosephosphate isomerase  45.23 
 
 		 255 aa  203  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.423457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1885  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 255 aa  202  6e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000744734  normal  0.534473 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2089  triosephosphate isomerase  41.06 
 
 		 271 aa  201  9e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.19012  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1991  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.262032  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3135  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 253 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2059  Triose-phosphate isomerase  41.73 
 
 		 254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1923  triosephosphate isomerase  40.08 
 
 		 250 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1133  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1852  triosephosphate isomerase  42.57 
 
 		 249 aa  199  3e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3448  triosephosphate isomerase  41.67 
 
 		 256 aa  199  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2049  triosephosphate isomerase  43.08 
 
 		 257 aa  199  3.9999999999999996e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1053  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 252 aa  199  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3813  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1356  triosephosphate isomerase  44.44 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.688667  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0947  triosephosphate isomerase  41.34 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.144972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1779  triosephosphate isomerase  41.2 
 
 		 251 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.906694  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1830  Triose-phosphate isomerase  39.85 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136952 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13483  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 250 aa  196  3e-49  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.943567  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2003  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 256 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0534929  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0241  Triose-phosphate isomerase  47.55 
 
 		 243 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0875  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 253 aa  195  6e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476682  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3352  Triose-phosphate isomerase  43.03 
 
 		 252 aa  195  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2960  triosephosphate isomerase  39.68 
 
 		 253 aa  195  7e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00129734  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0169  triosephosphate isomerase  42.86 
 
 		 255 aa  194  8.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.543601  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0991  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0674  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 250 aa  194  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.260735  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1444  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  44.02 
 
 		 655 aa  194  9e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2011  triosephosphate isomerase  40.73 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000187443  normal  0.448479 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2200  triosephosphate isomerase  42.46 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000236653  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1341  triosephosphate isomerase  40.77 
 
 		 259 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000463974  normal  0.0307092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0154  triosephosphate isomerase  43.25 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1621  triosephosphate isomerase  41.09 
 
 		 255 aa  194  1e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0703383  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0623  triosephosphate isomerase  41.94 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.524933 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0908  triosephosphate isomerase  40.56 
 
 		 250 aa  193  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.842553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0239  Triose-phosphate isomerase  47.06 
 
 		 243 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2838  triosephosphate isomerase  41.87 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2707  triosephosphate isomerase  41.87 
 
 		 249 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0542  triosephosphate isomerase  40.77 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1333  triosephosphate isomerase  39.44 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000254673  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1520  triosephosphate isomerase  41.04 
 
 		 272 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0128427  decreased coverage  0.0000834169 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_7124  predicted protein  42.15 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000122567  normal  0.0110543 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1464  triosephosphate isomerase  42.11 
 
 		 250 aa  192  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.11594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1058  triosephosphate isomerase  43.48 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00483785  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2275  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000308196  normal  0.102184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1639  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000200734  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3277  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1670  triosephosphate isomerase  44.27 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.895843  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2251  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 251 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000102764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1308  triosephosphate isomerase  41.3 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3216  triosephosphate isomerase  40.7 
 
 		 258 aa  192  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00012954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0562  Triose-phosphate isomerase  41.83 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.525761 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2717  triosephosphate isomerase  42.4 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0490631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1550  triosephosphate isomerase  41.02 
 
 		 261 aa  192  6e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2280  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815023  normal  0.394565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4716  triosephosphate isomerase  42.06 
 
 		 251 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4715  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.151784  hitchhiker  0.00871946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4581  triosephosphate isomerase  41.43 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.299699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5579  triosephosphate isomerase  40.32 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000123744  normal  0.0751441 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10130  triosephosphate isomerase  40.48 
 
 		 256 aa  191  9e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.734824  hitchhiker  0.000000544988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6036  triose-phosphate isomerase  42.52 
 
 		 261 aa  191  9e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.783409 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0794  triosephosphate isomerase  41.83 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1591  triosephosphate isomerase  42.91 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2216  triosephosphate isomerase  43.67 
 
 		 248 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.596842 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0672  triosephosphate isomerase  42.97 
 
 		 253 aa  191  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.649878  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0959  triosephosphate isomerase  41.15 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138148  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0169  triosephosphate isomerase  43.03 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>