More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3474 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3474  glucose 1-dehydrogenase  100 
 
 
92 aa  177  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0865  short chain dehydrogenase  98.89 
 
 
254 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0890  short chain dehydrogenase  98.89 
 
 
254 aa  174  5e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3471  short chain dehydrogenase  97.78 
 
 
254 aa  171  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1518  short chain dehydrogenase  87.78 
 
 
254 aa  155  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.570528  normal  0.0138518 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3234  short chain dehydrogenase  67.82 
 
 
257 aa  110  5e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.458923  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2039  short chain dehydrogenase  64.44 
 
 
255 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0111409  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4356  short chain dehydrogenase  65.56 
 
 
254 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146165 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1494  short chain dehydrogenase  64.04 
 
 
255 aa  107  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000180405  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2263  short chain dehydrogenase  61.11 
 
 
255 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00829126  normal  0.0703688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4626  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 
254 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130325  normal  0.180414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  62.07 
 
 
258 aa  105  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1220  short chain dehydrogenase  64.44 
 
 
254 aa  104  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0140677 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  61.11 
 
 
254 aa  100  6e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2690  short chain dehydrogenase  60 
 
 
255 aa  100  7e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2587  short chain dehydrogenase  66.67 
 
 
257 aa  94  7e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  55.56 
 
 
249 aa  91.3  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0747  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.33 
 
 
239 aa  91.3  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.785555  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4584  short chain dehydrogenase  56.32 
 
 
252 aa  87.4  6e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.170316 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.32 
 
 
258 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0925  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  54.02 
 
 
251 aa  82  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.568448  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1315  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.17 
 
 
258 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.17 
 
 
258 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2225  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
267 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.801106 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3492  short chain dehydrogenase  56.67 
 
 
256 aa  80.9  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4469  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.57 
 
 
293 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.02 
 
 
258 aa  80.1  0.000000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0109  short chain dehydrogenase  51.14 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2517  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.87 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.401645  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.67 
 
 
239 aa  79  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420603  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  50.57 
 
 
253 aa  79  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1575  short chain dehydrogenase  48.31 
 
 
249 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.1 
 
 
260 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.65 
 
 
249 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.94 
 
 
250 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
261 aa  77.8  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  47.06 
 
 
255 aa  77  0.00000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1481  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
239 aa  77  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.175599  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_11085  conserved hypothetical protein  51.61 
 
 
271 aa  76.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1734  short chain dehydrogenase  52.22 
 
 
249 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.747593  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.19 
 
 
317 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2307  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.59 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381228  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2192  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.73 
 
 
256 aa  74.7  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.11 
 
 
251 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2614  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
257 aa  73.9  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.042976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.07 
 
 
253 aa  73.6  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2695  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00727931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
248 aa  73.2  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 
251 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
258 aa  72  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
332 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.755346  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.43 
 
 
330 aa  72.8  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1861  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.63 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3318  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
334 aa  72  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.496064  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0644  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.33 
 
 
252 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  45.12 
 
 
336 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3941  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
258 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
287 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4249  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
258 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.33 
 
 
247 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.57 
 
 
245 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.553727  normal  0.0273902 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.62 
 
 
334 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.223195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
262 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4084  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
262 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3865  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
247 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.269971  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4157  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
258 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212799  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4051  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
258 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.67 
 
 
244 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4486  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.05 
 
 
292 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0684702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
248 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3474  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 
285 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
248 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2783  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.02 
 
 
249 aa  70.1  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.28 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.41 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3131  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.45 
 
 
340 aa  70.1  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.395332  normal  0.413116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.68 
 
 
287 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4725  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.98 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.91 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5076  short chain dehydrogenase  49.37 
 
 
339 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.5503 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  48.75 
 
 
544 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2567  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.43 
 
 
251 aa  70.1  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00491372 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3773  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  40.23 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1207  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
251 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0607199 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1241  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.28 
 
 
262 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.675718  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.83 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4345  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.98 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.108758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1525  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.53 
 
 
283 aa  68.9  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.623157  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0416  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.88 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4431  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.98 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.564431  normal  0.112699 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4636  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
254 aa  68.6  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8706  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.99 
 
 
255 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.13 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.35 
 
 
251 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1101  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  38.64 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.845922 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4828  glucose-1-dehydrogenase  43.68 
 
 
261 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>