45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_2296 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  100 
 
 
277 aa  570  1e-161  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  96.03 
 
 
277 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  53.9 
 
 
279 aa  293  1e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  51.55 
 
 
261 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  51.16 
 
 
261 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  51.16 
 
 
261 aa  271  6e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  45.04 
 
 
261 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  44.49 
 
 
259 aa  226  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  44.11 
 
 
259 aa  224  2e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  43.13 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  42.03 
 
 
269 aa  215  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  39.15 
 
 
248 aa  209  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  41.04 
 
 
272 aa  206  4e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  39.93 
 
 
272 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  40.68 
 
 
258 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  35.98 
 
 
243 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  36.13 
 
 
249 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  34.39 
 
 
253 aa  152  5e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  40.4 
 
 
100 aa  97.8  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  33 
 
 
324 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  24.55 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  35.87 
 
 
311 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  40.3 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4687  hypothetical protein  41.67 
 
 
312 aa  51.6  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00986702  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3366  hypothetical protein  31.4 
 
 
292 aa  50.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  29.35 
 
 
152 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  28.28 
 
 
130 aa  49.3  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  27.88 
 
 
123 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  47.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  35.11 
 
 
142 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  32.43 
 
 
304 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4690  Domain of unknown function DUF2382-like protein  35.96 
 
 
301 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  27.66 
 
 
131 aa  46.2  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4955  Domain of unknown function DUF2382-like protein  32.53 
 
 
366 aa  45.8  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.987311  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1454  hypothetical protein  42.37 
 
 
288 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649644  normal  0.0873077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3466  PRC-barrel domain protein  32.67 
 
 
299 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  hitchhiker  0.00773613 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1926  hypothetical protein  31.58 
 
 
207 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4688  hypothetical protein  28.74 
 
 
280 aa  44.3  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0233985  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0277  hypothetical protein  40.68 
 
 
282 aa  43.9  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0810236  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1656  hypothetical protein  34.07 
 
 
281 aa  43.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03600  conserved domain protein, TIGR02271+C111  29.07 
 
 
380 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.67855 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0823  PRC-barrel domain protein  31.52 
 
 
307 aa  42.7  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3480  hypothetical protein  31.08 
 
 
229 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03590  conserved domain protein, TIGR02271+C111  28 
 
 
286 aa  42.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.692647  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0929  PRC-barrel domain-containing protein  28.04 
 
 
122 aa  42.4  0.008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.13635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>