More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2286 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  100 
 
 		 145 aa  301  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  93.79 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  215  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  69.66 
 
 		 145 aa  213  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  67.59 
 
 		 145 aa  212  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  65.52 
 
 		 148 aa  204  4e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  64.83 
 
 		 145 aa  202  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  62.76 
 
 		 145 aa  197  5e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 		 148 aa  192  9e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 		 148 aa  191  2e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  62.94 
 
 		 147 aa  190  5e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  60.14 
 
 		 147 aa  188  2e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 		 143 aa  183  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  58.04 
 
 		 158 aa  177  4e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 144 aa  177  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000419018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  177  4.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  56.43 
 
 		 142 aa  176  7e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 144 aa  176  8e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  58.87 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  176  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 146 aa  175  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 		 144 aa  176  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4120  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.954115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  58.16 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  57.25 
 
 		 148 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  52.82 
 
 		 146 aa  174  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 147 aa  174  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  55.63 
 
 		 144 aa  174  4e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4426  ribosomal protein L13  59.56 
 
 		 142 aa  174  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 147 aa  174  5e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2876  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 143 aa  173  6e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  173  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  54.29 
 
 		 150 aa  173  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1014  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00728449  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  172  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 149 aa  171  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0103  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000123224  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3497  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 150 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000146493  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  54.61 
 
 		 142 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  54.61 
 
 		 145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  53.15 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  56.83 
 
 		 151 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0880  ribosomal protein L13  57.66 
 
 		 147 aa  171  3.9999999999999995e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57590  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000544643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 144 aa  170  5e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1032  50S ribosomal protein L13  52.9 
 
 		 163 aa  170  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.108398  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2400  50S ribosomal protein L13  56.2 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.767077  normal  0.0664641 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23291  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 150 aa  170  5e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0299  50S ribosomal protein L13  56.03 
 
 		 142 aa  170  5e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000151129  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03091  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000630317  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0475  ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000038374  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3537  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000244686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3608  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000171486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3714  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000482392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0475  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000136634  normal  0.174588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5005  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00170298  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03042  hypothetical protein  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000311613  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3420  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.0043600000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3536  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000942951  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3705  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000756717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3527  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000295186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3643  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000310969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4548  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  170  5.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000032614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0110  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  169  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00100259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 		 144 aa  169  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 147 aa  169  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  54.55 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000100491  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  53.19 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3545  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.43146e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  51.8 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  55.24 
 
 		 149 aa  169  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  55.32 
 
 		 142 aa  169  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  55.86 
 
 		 148 aa  169  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  52.11 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1103  50S ribosomal protein L13  53.85 
 
 		 150 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.698543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>