More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2048 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 711 aa  1421    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3440  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.07 
 
 		 708 aa  468  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.184047  normal  0.328768 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0949  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 		 706 aa  391  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.317535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0198  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 		 693 aa  361  3e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.828483 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2672  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 		 659 aa  349  1e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0528368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2497  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.28 
 
 		 688 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2437  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 704 aa  333  7.000000000000001e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.166276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0158  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 684 aa  331  3e-89  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1598  histidine kinase  36.96 
 
 		 689 aa  329  8e-89  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3103  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.3 
 
 		 688 aa  319  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0703  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.89 
 
 		 703 aa  312  1e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 712 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1534  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 688 aa  296  8e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.887236  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2399  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 694 aa  294  4e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1998  Signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 694 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.689731  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0750  signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 680 aa  257  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0429  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 		 690 aa  248  2e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0815441 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3296  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 672 aa  247  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.593293  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2957  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.32 
 
 		 697 aa  247  6e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.445047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1806  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 690 aa  227  5.0000000000000005e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2444  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 695 aa  223  7e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03285  sensor histidine kinase  29.93 
 
 		 675 aa  223  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1993  histidine kinase  28.74 
 
 		 696 aa  221  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.124604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5031  sensor histidine kinase  28.76 
 
 		 677 aa  213  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2439  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 690 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1941  sensor histidine kinase  29.38 
 
 		 677 aa  187  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2325  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 		 681 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.136199  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2196  histidine kinase  27.12 
 
 		 684 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0849  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 701 aa  160  6e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.732792  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0661  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.08 
 
 		 686 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3043  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 678 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.546021  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  33.19 
 
 		 581 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 581 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  31.45 
 
 		 1347 aa  94  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4629  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 		 841 aa  93.6  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0247  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 870 aa  92.4  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136851  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 		 987 aa  91.3  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.15 
 
 		 627 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288914  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1826  histidine kinase  23.88 
 
 		 418 aa  87.8  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.778764  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1768  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 576 aa  86.7  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.14 
 
 		 621 aa  86.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1255  histidine kinase  27.95 
 
 		 402 aa  86.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 970 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 689 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.135812 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 		 492 aa  85.9  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4355  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201871  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4378  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.33 
 
 		 627 aa  84.7  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.055155  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 498 aa  84.3  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3951  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.14171 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1392  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 396 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1455  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.693151  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1256  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1229  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1231  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  27.31 
 
 		 391 aa  82.8  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1356  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 581 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 594 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1429  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000732404 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3433  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 503 aa  83.2  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.812028  normal  0.0364545 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.62 
 
 		 546 aa  82.4  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 595 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1495  sporulation kinase B  27.07 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0591081  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2426  sporulation kinase B  23.42 
 
 		 422 aa  81.3  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 488 aa  81.3  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3327  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.26559  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 		 893 aa  80.9  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 763 aa  81.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3374  two-component sensor kinase CbrA  25.86 
 
 		 1000 aa  80.9  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.694338  normal  0.111505 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  28.27 
 
 		 611 aa  80.9  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3671  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.4 
 
 		 1034 aa  81.3  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0515  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 		 689 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.92 
 
 		 679 aa  80.9  0.00000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  38.71 
 
 		 555 aa  80.1  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0447  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 1527 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3129  histidine kinase  23.35 
 
 		 418 aa  80.1  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.591825  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2532  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.71 
 
 		 794 aa  80.1  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.108241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2387  histidine kinase  32.3 
 
 		 400 aa  80.5  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0912587 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4893  sporulation kinase  27 
 
 		 406 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2844  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 657 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 399 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4603  histidine kinase  25.94 
 
 		 405 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04306  histidine kinase-response regulator hybrid protein  26.89 
 
 		 500 aa  79.3  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.717782  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 		 763 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2387  sporulation kinase B  22.97 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0102161  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2455  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 430 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 395 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7127  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 782 aa  79.7  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.612446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  41.12 
 
 		 573 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.47 
 
 		 983 aa  79.7  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2669  sporulation kinase B  21.21 
 
 		 389 aa  79.3  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.70932  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1960  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 525 aa  79.3  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0347  sporulation kinase  27.5 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 763 aa  79  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 		 734 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 488 aa  79  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>