More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0411 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  100 
 
 		 335 aa  681    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  74.59 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  72.31 
 
 		 326 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  56.74 
 
 		 336 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  55.28 
 
 		 333 aa  336  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  56.45 
 
 		 320 aa  334  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  56.8 
 
 		 319 aa  319  3e-86  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  53.09 
 
 		 318 aa  311  1e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  51.4 
 
 		 319 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  50.81 
 
 		 321 aa  291  1e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  48.08 
 
 		 319 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  48.23 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  47.3 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  46.62 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  47.44 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  47.44 
 
 		 306 aa  263  4e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  44.41 
 
 		 320 aa  261  8.999999999999999e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  44.94 
 
 		 305 aa  261  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  44.94 
 
 		 305 aa  259  4e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  47.57 
 
 		 321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  46.67 
 
 		 343 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  47.32 
 
 		 321 aa  258  1e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  44.44 
 
 		 309 aa  258  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  44.05 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  44.79 
 
 		 310 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  46.6 
 
 		 316 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  43.31 
 
 		 319 aa  255  6e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  45.54 
 
 		 302 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  46.45 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  44.9 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  46.6 
 
 		 316 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0120  ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 		 305 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.695477  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  44.44 
 
 		 308 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  43.73 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  44.48 
 
 		 310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  43.41 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  45.71 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  50 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  48.06 
 
 		 309 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  44.59 
 
 		 310 aa  252  8.000000000000001e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  45.08 
 
 		 308 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  46.93 
 
 		 321 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  43.09 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  46.01 
 
 		 298 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  43.63 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 308 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  43.31 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  44.76 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  45.08 
 
 		 313 aa  249  4e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3144  ABC transporter related  43.14 
 
 		 312 aa  249  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  41.88 
 
 		 311 aa  249  4e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0794  ABC transporter related  42.81 
 
 		 312 aa  249  5e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  45.89 
 
 		 309 aa  249  6e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  43.31 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0823  ABC transporter related  42.81 
 
 		 312 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  44.76 
 
 		 308 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  45.02 
 
 		 308 aa  248  7e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  42.81 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  44.44 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  43.49 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  46.82 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002557  ABC-type multidrug transport system ATPase component  43.23 
 
 		 305 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  41.8 
 
 		 310 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.69 
 
 		 304 aa  246  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02791  ABC transporter ATP-binding protein  42.63 
 
 		 331 aa  245  9e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2615  ABC transporter, ATP-binding protein  43.23 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.762057  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  41.9 
 
 		 320 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  44.95 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3589  ABC transporter related  41.81 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0104822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  41.48 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3712  ABC transporter related  41.81 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  43.45 
 
 		 309 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  43.81 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  44.07 
 
 		 308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3520  ABC transporter related  41.81 
 
 		 312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.12948  hitchhiker  0.00888857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3802  ABC transporter, ATP-binding protein  41.81 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  44.13 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0722  ABC transporter related  41.81 
 
 		 312 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.446377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  44 
 
 		 308 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2136  ABC transporter related  42.72 
 
 		 304 aa  242  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00658879  normal  0.0667998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3880  ABC transporter related  41.41 
 
 		 322 aa  242  7.999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555039  normal  0.729872 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  42.95 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  43.28 
 
 		 309 aa  241  9e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  42.95 
 
 		 304 aa  241  9e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0196  ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 		 308 aa  241  1e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.879775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  43.34 
 
 		 319 aa  241  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3996  ABC transporter-related protein  42.04 
 
 		 307 aa  241  1e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  42.99 
 
 		 297 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3817  ABC transporter related  44.6 
 
 		 326 aa  241  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.806511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  42.95 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0689  ABC transporter related  43.39 
 
 		 314 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0204  ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 		 308 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  42.72 
 
 		 307 aa  240  2e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0188  ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.608048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0187  ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 		 308 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0680915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>