51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3596 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3596  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000122587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3356  hypothetical protein  91.02 
 
 
245 aa  431  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1674  protein of unknown function DUF164  48.58 
 
 
247 aa  202  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4816  hypothetical protein  48.37 
 
 
245 aa  202  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0246614  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6816  Zn-ribbon protein possibly nucleic acid-binding- like protein  47.39 
 
 
246 aa  202  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587405  normal  0.0465772 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2312  hypothetical protein  48.78 
 
 
246 aa  201  8e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.30327 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0880  protein of unknown function DUF164  45.31 
 
 
245 aa  191  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3461  protein of unknown function DUF164  49.59 
 
 
246 aa  191  7e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3275  protein of unknown function DUF164  48.33 
 
 
242 aa  182  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000167925  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2711  protein of unknown function DUF164  43.67 
 
 
246 aa  176  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.176281  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07190  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  41.63 
 
 
245 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.274676  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5890  protein of unknown function DUF164  43.67 
 
 
255 aa  174  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.498958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1954  hypothetical protein  43.32 
 
 
247 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0901  hypothetical protein  45.57 
 
 
237 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0250071  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2904  protein of unknown function DUF164  43.82 
 
 
253 aa  169  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0926675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3335  protein of unknown function DUF164  47.37 
 
 
247 aa  167  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0424877  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1437  hypothetical protein  43.7 
 
 
247 aa  160  1e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.133563  normal  0.0750661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5075  hypothetical protein  46.15 
 
 
247 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.0143061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2084  protein of unknown function DUF164  41.15 
 
 
245 aa  149  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0876658  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1497  protein of unknown function DUF164  41.35 
 
 
242 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.551565  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3095  protein of unknown function DUF164  39.68 
 
 
245 aa  143  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0336723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2014  hypothetical protein  43.83 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0138572  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2142  protein of unknown function DUF164  43.85 
 
 
244 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.38876  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3354  hypothetical protein  40.5 
 
 
245 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.339087 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3343  hypothetical protein  40.5 
 
 
245 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3405  hypothetical protein  40.5 
 
 
245 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.146705 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12258  hypothetical protein  38.91 
 
 
245 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.779709  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2891  hypothetical protein  37.3 
 
 
245 aa  131  9e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.340776  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14950  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  39.83 
 
 
249 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3619  hypothetical protein  37.65 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.392544  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2192  protein of unknown function DUF164  36.51 
 
 
245 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000158316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1829  hypothetical protein  40.08 
 
 
246 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.14591  normal  0.0297669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2443  hypothetical protein  35.22 
 
 
245 aa  118  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0111287  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0428  hypothetical protein  26.52 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.891303 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09480  Zn-ribbon protein, possibly nucleic acid-binding  34.98 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0574  protein of unknown function DUF164  27.9 
 
 
239 aa  59.3  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4769  hypothetical protein  25.11 
 
 
244 aa  57  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0153569  hitchhiker  0.00905768 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3124  protein of unknown function DUF164  28.34 
 
 
251 aa  55.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2442  protein of unknown function DUF164  29.61 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0191344  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0735  hypothetical protein  23.38 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0064  hypothetical protein  28.95 
 
 
245 aa  48.5  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.604985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0595  chromosome segregation ATPases-like  28.57 
 
 
1675 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.401487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6895  protein of unknown function DUF164  24.9 
 
 
250 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13301  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1350  protein of unknown function DUF164  25.79 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000260914  normal  0.479391 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1000  conserved hypothetical protein (DUF164 domain protein)  20.87 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1653  protein of unknown function DUF164  24.31 
 
 
239 aa  43.5  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00645027  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0025  protein of unknown function DUF164  25.69 
 
 
240 aa  43.5  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1624  hypothetical protein  23.15 
 
 
247 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5146  protein of unknown function DUF164  25.2 
 
 
248 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0341  hypothetical protein  27.57 
 
 
231 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0359  hypothetical protein  24.35 
 
 
231 aa  42  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>