93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3221 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3221  cyclase family protein  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3004  cyclase family protein  84.43 
 
 
237 aa  289  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0209001  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2580  putative cyclase  52.08 
 
 
219 aa  180  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.450576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1418  hypothetical protein  56.55 
 
 
222 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.822292  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5044  cyclase family protein  51.72 
 
 
219 aa  158  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.250627  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1971  cyclase family protein  45.81 
 
 
294 aa  155  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.674736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5193  cyclase family protein  46.02 
 
 
295 aa  151  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.98741  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3116  cyclase family protein  50.33 
 
 
218 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1511  putative cyclase  53.42 
 
 
217 aa  148  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.3685  normal  0.674616 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0374  putative cyclase  38.83 
 
 
228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1500  cyclase family protein  46.54 
 
 
238 aa  134  9e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.256572  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2549  cyclase family protein  48.95 
 
 
216 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.564227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2854  cyclase family protein  32.65 
 
 
213 aa  75.1  0.0000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1005  cyclase family protein  35.62 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.319318  normal  0.15577 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2444  cyclase family protein  35.76 
 
 
214 aa  70.5  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1367  cyclase family protein  33.78 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0951074 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4034  putative cyclase  35.53 
 
 
377 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.368561  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1870  putative cyclase  32.57 
 
 
217 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0124068  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1936  hypothetical protein  32.89 
 
 
215 aa  65.5  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0130  cyclase family protein  31.97 
 
 
216 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0142  cyclase family protein  25.85 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000000166569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3365  cyclase family protein  37.24 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0151561  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0623  cyclase family protein  30.61 
 
 
220 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0986  hypothetical protein  29.14 
 
 
219 aa  60.1  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.428694  normal  0.859391 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4339  cyclase family protein  30.41 
 
 
217 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0530585  decreased coverage  0.000845413 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1902  putative cyclase  31.95 
 
 
280 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1354  cyclase family protein  32.26 
 
 
229 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2218  cyclase family protein  31.58 
 
 
219 aa  56.6  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1761  cyclase family protein  25.66 
 
 
213 aa  56.2  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2609  cyclase family protein  31.72 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1863  cyclase family protein  31.29 
 
 
212 aa  56.2  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.171593  normal  0.0594978 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1663  cyclase family protein  29.87 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.673184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0329  cyclase  26.21 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0332  cyclase  26.21 
 
 
210 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0461  hypothetical protein  26.21 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0456  putative cyclase  26.21 
 
 
210 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4064  cyclase family protein  29.75 
 
 
231 aa  55.1  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2083  hypothetical protein  30.57 
 
 
217 aa  55.1  0.0000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0361  hypothetical protein  26.21 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0346  hypothetical protein  26.21 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0408  putative cyclase  26.21 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0395  putative cyclase  26.21 
 
 
210 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4071  cyclase family protein  34.25 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.65145  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0103  cyclase family protein  30.41 
 
 
211 aa  53.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2003  cyclase family protein  29.73 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.134376  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0341  cyclase family protein  25.52 
 
 
210 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4910  putative cyclase  26.21 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2361  cyclase family protein  34.15 
 
 
253 aa  52  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0286338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2035  cyclase family protein  29.24 
 
 
273 aa  51.6  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.968158  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0956  cyclase family protein  27.33 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.161877  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13480  cyclase family protein  22.29 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0322742  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2761  cyclase family protein  29.37 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2527  arylformamidase  27.66 
 
 
209 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001519 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3915  cyclase family protein  26.55 
 
 
249 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1012  cyclase family protein  32 
 
 
224 aa  49.3  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3771  cyclase family protein  29.87 
 
 
233 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.465631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2272  putative cyclase  33.11 
 
 
260 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0573  cyclase family protein  23.68 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0489129  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2262  cyclase family protein  21.43 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3029  cyclase family protein  26.92 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.297763  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3383  hypothetical protein  26.92 
 
 
272 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2674  cyclase family protein  33.06 
 
 
257 aa  47.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000430104  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2760  arylformamidase  25.81 
 
 
209 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000607358 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1902  cyclase family protein  28.8 
 
 
209 aa  47  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.258214  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3370  cyclase family protein  29.87 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.380631  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11731  hypothetical protein  25.29 
 
 
276 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000634695  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2765  arylformamidase  26.8 
 
 
209 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.820064  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3295  Extracellular ligand-binding receptor  27.34 
 
 
249 aa  45.4  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0741916 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1749  twin-arginine translocation pathway signal  26 
 
 
272 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.651596  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0915  cyclase family protein  24.34 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0937  cyclase family protein  24.34 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.227142  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0378  cyclase family protein  31.62 
 
 
262 aa  45.1  0.0009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2558  cyclase family protein  25.77 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2487  metal-dependent hydrolase  25.81 
 
 
209 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0373  hypothetical protein  22.22 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000249402  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0317  cyclase family protein  25.32 
 
 
210 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.555056  normal  0.951673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2566  hypothetical protein  25.81 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2522  metal-dependent hydrolase  25.81 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.220374  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2752  hypothetical protein  25.81 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3555  cyclase family protein  23.61 
 
 
226 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3051  hypothetical protein  33.33 
 
 
257 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.550945 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1973  cyclase family protein  28.92 
 
 
280 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.720532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3853  cyclase family protein  35.48 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00415586  normal  0.0437489 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2786  hypothetical protein  25.27 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00465023  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2807  arylformamidase  25.27 
 
 
209 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.227395  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1077  cyclase family protein  28.67 
 
 
210 aa  42.4  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.323976  normal  0.0992095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1722  hypothetical protein  29.66 
 
 
201 aa  42.4  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.990715  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1641  cyclase family protein  28.14 
 
 
254 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1205  cyclase family protein  27.78 
 
 
210 aa  42  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3859  hypothetical protein  32.14 
 
 
269 aa  42  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.912715 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5495  cyclase  26.26 
 
 
258 aa  42  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.245157  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5908  putative cyclase  34.44 
 
 
213 aa  42  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0613  cyclase family protein  30.86 
 
 
209 aa  41.6  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>