More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2660 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2477  aminotransferase, class I and II  86.05 
 
 		 439 aa  722    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.055447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2660  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 439 aa  879    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220468  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4591  putative transcriptional regulator, GntR family  62.56 
 
 		 431 aa  520  1e-146  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.374822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1742  putative transcriptional regulator, GntR family  54.59 
 
 		 430 aa  475  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3266  putative transcriptional regulator, GntR family  54.61 
 
 		 426 aa  435  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2452  aminotransferase, class I and II  49.65 
 
 		 441 aa  375  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410489  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3064  putative transcriptional regulator, GntR family  40.9 
 
 		 449 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.725277  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1964  GntR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 409 aa  170  4e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39710  transcriptional regulator with HTH domain protein and aminotransferase domain protein  32.39 
 
 		 446 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5405  putative transcriptional regulator, GntR family  32.58 
 
 		 446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5940  putative transcriptional regulator, GntR family  31.54 
 
 		 463 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1434  putative transcriptional regulator, GntR family  29.58 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3812  putative transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7090  putative transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 438 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.635615  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2152  aminotransferase, class I and II  33 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2328  aminotransferase, class I and II  30.75 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4022  aminotransferase, class I and II  30.86 
 
 		 433 aa  160  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3370  putative transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 611 aa  159  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0532019  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2120  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 401 aa  159  1e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.265686 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9379  putative transcriptional regulator, GntR family  33.58 
 
 		 441 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.938507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0093  putative transcriptional regulator, GntR family  30.42 
 
 		 425 aa  158  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9047  putative transcriptional regulator, GntR family  31.13 
 
 		 437 aa  157  3e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.779817  normal  0.283217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2549  putative transcriptional regulator, GntR family  30.75 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.49034  normal  0.185545 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4975  putative transcriptional regulator, GntR family  32.69 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10910  putative transcriptional regulator, GntR family  28.68 
 
 		 394 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1080  putative transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1028  GntR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000302984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5087  putative transcriptional regulator, GntR family  30.27 
 
 		 454 aa  152  8e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1659  2-aminoadipate aminotransferase  31.05 
 
 		 399 aa  152  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0665896 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1532  GntR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 399 aa  151  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.192742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4690  aminotransferase, class I and II  31.02 
 
 		 439 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2237  putative transcriptional regulator, GntR family  30.62 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0384062  normal  0.194146 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37960  transcriptional regulator with HTH domain and aminotransferase domain  30.75 
 
 		 436 aa  149  9e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0985  aminotransferase protein  29.03 
 
 		 406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0572002  normal  0.184063 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0318  putative transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 432 aa  148  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.024163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0421  GntR family transcriptional regulator  26.93 
 
 		 403 aa  147  3e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.493071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2616  putative transcriptional regulator, GntR family  26.65 
 
 		 395 aa  147  5e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.791152  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1466  GntR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 386 aa  147  5e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.677019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2905  GntR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 340 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0310  GntR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 397 aa  146  9e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000040274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5545  putative transcriptional regulator, GntR family  32.01 
 
 		 367 aa  146  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.97296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1902  aromatic amino acid aminotransferase / 2-aminoadipate aminotransferase  29.07 
 
 		 397 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0846  putative transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0129506  normal  0.750819 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0915  putative transcriptional regulator, GntR family  28.96 
 
 		 396 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.262681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4214  putative transcriptional regulator, GntR family  30.99 
 
 		 438 aa  143  6e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1641  valine-pyruvate aminotransferase  30.96 
 
 		 440 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.320192  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4583  aminotransferase, class I and II  30.96 
 
 		 437 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000597747 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00093  valine-pyruvate aminotransferase  30.15 
 
 		 417 aa  140  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.947467  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6427  putative transcriptional regulator, GntR family  29.4 
 
 		 414 aa  139  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.93178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5101  GntR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 437 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000307944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  27.87 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2231  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2350  aminotransferase, class I and II  28.9 
 
 		 394 aa  137  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2521  aminotransferase  30.77 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0766  GntR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 383 aa  137  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2122  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 473 aa  137  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2372  GntR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1739  aminotransferase, class I and II  30.11 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2351  aminotransferase, class I and II  30.11 
 
 		 393 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.654815  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2513  aminotransferase  27.39 
 
 		 404 aa  136  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.111112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1336  aminotransferase, class I  30.34 
 
 		 410 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.102288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6710  GntR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.614277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3364  transcriptional regulator  30.66 
 
 		 498 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1378  aminotransferase, class I  30.34 
 
 		 410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3867  putative transcriptional regulator, GntR family  28.32 
 
 		 394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0593  GntR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 450 aa  135  1.9999999999999998e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2387  aminotransferase, class I and II  29.69 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462658  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0115  putative transcriptional regulator, GntR family  25.89 
 
 		 396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2269  GntR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 393 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0865  putative transcriptional regulator, GntR family  25.58 
 
 		 404 aa  134  3e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000909191  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0928  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 393 aa  134  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.511381  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2117  GntR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 398 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.483945  normal  0.104969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4054  putative transcriptional regulator, GntR family  27.81 
 
 		 394 aa  134  3e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1469  GntR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 413 aa  134  5e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1213  putative transcriptional regulator, GntR family  28.33 
 
 		 398 aa  133  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0411  aminotransferase  25.41 
 
 		 405 aa  133  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.894171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5690  aminotransferase, class I and II  29.19 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0081  putative transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 402 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1337  transcriptional regulator, GntR family with aminotransferase domain  32.84 
 
 		 487 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1887  GntR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3332  putative aminotransferase  28 
 
 		 398 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.381382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0073  putative transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3369  putative transcriptional regulator, GntR family  32.82 
 
 		 402 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0184281  normal  0.0139033 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6594  putative transcriptional regulator, GntR family  28.8 
 
 		 398 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.394989  normal  0.110882 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0924  GntR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554993 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3581  putative GntR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 441 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0233  GntR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 395 aa  130  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.511167 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1108  GntR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1670  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 395 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.868104 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1584  GntR family transcriptional regulator  26.65 
 
 		 393 aa  129  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0064  aminotransferase, class I  27.71 
 
 		 397 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1580  GntR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 395 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.136638  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5809  transcriptional regulator  31.64 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1154  aminotransferase, class I/II  28.93 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2446  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3874  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4495  GntR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1815  GntR family transcriptional regulator  29.4 
 
 		 410 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0068  putative transcriptional regulator, GntR family  27.2 
 
 		 397 aa  128  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1095  GntR family transcriptional regulator  25 
 
 		 395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.435284  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>