105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0769 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_0769  CopY family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  304  3e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.585714  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0825  penicillinase repressor  81.12 
 
 		 144 aa  214  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118786 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2916  transcriptional regulator  67.83 
 
 		 154 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.214905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4332  transcriptional repressor, CopY family  61.98 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.781234 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37280  predicted transcriptional regulator  62.39 
 
 		 127 aa  130  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.122249 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0951  transcriptional repressor, CopY family  58.12 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.778736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0684  transcriptional repressor, CopY family  57.26 
 
 		 133 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0255  CopY family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 185 aa  113  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0490  CopY family transcriptional repressor  58.88 
 
 		 107 aa  110  6e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.817157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0305  transcriptional repressor, CopY family  56.1 
 
 		 129 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3766  transcriptional repressor, CopY family  56.25 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0962354  normal  0.434319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4544  transcriptional repressor, CopY family  52.59 
 
 		 125 aa  104  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0241416  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2313  transcriptional repressor, CopY family  50.38 
 
 		 129 aa  101  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11874  transcriptional regulator  51.49 
 
 		 138 aa  100  1e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0126364  normal  0.333827 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5639  transcriptional repressor, CopY family  45.74 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0388648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4479  CopY family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 141 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.565601 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1643  transcriptional repressor, CopY family  57.41 
 
 		 131 aa  95.5  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.460191  normal  0.0845343 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01860  predicted transcriptional regulator  48.28 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2619  Penicillinase repressor  47.86 
 
 		 123 aa  94.7  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3357  CopY family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 138 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.58823 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3087  CopY family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 138 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.449228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2810  CopY family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0321603  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2854  CopY family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2837  CopY family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 138 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2760  Penicillinase repressor  51.67 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0602236  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4563  CopY family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 120 aa  89  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.673989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4974  transcriptional repressor, CopY family  46.72 
 
 		 118 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1615  transcriptional repressor, CopY family  46.09 
 
 		 127 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000186217 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1621  CopY family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 128 aa  87.4  7e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00707917  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5668  CopY family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4514  CopY family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 129 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5343  CopY family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.813895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2606  Penicillinase repressor  45.3 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4231  Penicillinase repressor  45.3 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4745  transcriptional repressor, CopY family  49.57 
 
 		 118 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.603775  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2816  CopY family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 128 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3706  CopY family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 166 aa  84.3  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.450993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0896  CopY family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 139 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6581  CopY family transcriptional regulator  51.15 
 
 		 182 aa  84  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0567  regulator  41.03 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5379  CopY family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4145  transcriptional repressor, CopY family  42.74 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00725866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0024  transcriptional repressor, CopY family  41.41 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0474358  normal  0.79806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5737  CopY family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5717  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.679694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5291  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3655  CopY family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3630  transcriptional repressor, CopY family  48.51 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.336227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3609  transcriptional repressor, CopY family  45.24 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0225174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1441  CopY family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1459  CopY family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1350  transcriptional repressor, CopY family  42.74 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5556  CopY family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.223258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4517  CopY family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 141 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3680  transcriptional repressor, CopY family  36.67 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2853  CopY family transcriptional regulator  43.84 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3667  transcriptional repressor, CopY family  44.29 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0532  CopY family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9018  transcriptional repressor, CopY family  37.61 
 
 		 119 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1285  CopY family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.237344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4494  CopY family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1605  transcriptional repressor, CopY family  38.37 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.809154  normal  0.110502 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1663  transcriptional repressor, CopY family  36.11 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000951511  normal  0.067843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3494  transcriptional repressor, CopY family  34.48 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2622  transcriptional repressor, CopY family  34.48 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0170436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4282  transcriptional repressor, CopY family  33.33 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2840  CopY family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.941683  normal  0.299487 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0498  CopY family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.584865 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2523  transcriptional repressor, CopY family protein  37.35 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2994  CopY family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3889  CopY family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 133 aa  48.1  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.976085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3999  transcriptional regulator, TrmB  33.73 
 
 		 125 aa  48.1  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4311  transcriptional repressor, CopY family  36.28 
 
 		 141 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.972476  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1017  Penicillinase repressor  41.46 
 
 		 123 aa  48.1  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1645  hypothetical protein  29.49 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00404196  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1624  hypothetical protein  29.49 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0362739  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1594  hypothetical protein  29.49 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000464586  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1776  hypothetical protein  29.49 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.990968  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3225  transcriptional repressor, CopY family  37.97 
 
 		 121 aa  47.8  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.182385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1826  hypothetical protein  29.49 
 
 		 137 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1849  hypothetical protein  29.49 
 
 		 137 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0126264  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1790  hypothetical protein  29.49 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1902  hypothetical protein  29.49 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000462364  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3767  CopY family transcriptional repressor  34.25 
 
 		 139 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164667  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4716  transcriptional repressor, CopY family  38.27 
 
 		 153 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0722064  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2564  CopY family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1882  CopY family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.128581  normal  0.417671 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4388  transcriptional regulator, TrmB  34.57 
 
 		 125 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.503101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3554  hypothetical protein  27.85 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.404562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0967  transcriptional repressor, CopY family  35.71 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.624579  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2556  transcriptional repressor, CopY family  43.21 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000130945  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2483  transcriptional repressor, CopY family  44.23 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.481913  normal  0.156772 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3296  CopY family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1644  CopY family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.204301  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02324  transcriptional regulator BlaI family  37.5 
 
 		 121 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.29109  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4290  transcriptional repressor, CopY family  37.66 
 
 		 132 aa  44.3  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4382  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5186  transcriptional repressor, CopY family  38.36 
 
 		 121 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2186  transcriptional regulator, putative  28.26 
 
 		 111 aa  42  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31060  hypothetical protein  33.75 
 
 		 205 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000454841  unclonable  1.93653e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>