35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3244 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3244  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  336  9.999999999999999e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.978613 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0449  putative transcriptional regulator  69.59 
 
 		 171 aa  229  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0395  divergent AAA region  65.56 
 
 		 167 aa  224  3e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0367  divergent AAA region  66.23 
 
 		 167 aa  224  5.0000000000000005e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3577  putative transcriptional regulator  64.74 
 
 		 167 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.535476  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0396  putative transcriptional regulator  66.89 
 
 		 167 aa  215  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00892545  normal  0.277026 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0397  putative transcriptional regulator  66.89 
 
 		 167 aa  216  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3628  putative transcriptional regulator  66.89 
 
 		 167 aa  215  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000786438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4084  putative transcriptional regulator  64.74 
 
 		 167 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4303  hypothetical protein  64.9 
 
 		 167 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3968  putative transcriptional regulator  64.74 
 
 		 167 aa  209  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.553588  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3891  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 167 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390825 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3990  putative transcriptional regulator  64.1 
 
 		 167 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4173  putative transcriptional regulator  39.33 
 
 		 663 aa  122  2e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.219897  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0052  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 656 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0048  putative transcriptional regulator  38 
 
 		 656 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5660  putative transcriptional regulator  42.07 
 
 		 643 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0490  putative transcriptional regulator  37.09 
 
 		 504 aa  112  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0362004 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0538  putative transcriptional regulator  37.06 
 
 		 622 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.141611  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0904  divergent AAA domain protein  34.87 
 
 		 543 aa  100  8e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1961  putative transcriptional regulator  32.91 
 
 		 515 aa  94.7  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1179  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 620 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.379581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3556  putative transcriptional regulator  32 
 
 		 620 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2888  putative transcriptional regulator  24.36 
 
 		 602 aa  57.8  0.00000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7144  putative transcriptional regulator  26.72 
 
 		 582 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0482  divergent AAA ATP  26.36 
 
 		 475 aa  52.4  0.000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1448  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 499 aa  47.4  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0864  putative transcriptional regulator  30.2 
 
 		 433 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2681  transcriptional regulator  29.93 
 
 		 634 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2855  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 		 572 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0636  putative transcriptional regulator  25.95 
 
 		 492 aa  44.3  0.0007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.242248  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0085  putative transcriptional regulator  31.97 
 
 		 641 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1157  transcriptional regulator  24.67 
 
 		 687 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.033832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0081  putative transcriptional regulator  27.52 
 
 		 485 aa  42.7  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2841  putative transcriptional regulator  24.5 
 
 		 458 aa  40.8  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>