More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0661 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0661  sodium:dicarboxylate symporter  100 
 
 		 441 aa  862    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0107528  normal  0.201117 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0909  sodium:dicarboxylate symporter  60.19 
 
 		 432 aa  476  1e-133  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3229  sodium:dicarboxylate symporter  58.96 
 
 		 439 aa  474  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1033  proton glutamate symport protein  59.72 
 
 		 432 aa  473  1e-132  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.207746  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02342  proton glutamate symport protein  61.37 
 
 		 409 aa  457  1e-127  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2948  sodium:dicarboxylate symporter  48.79 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00484228  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3042  sodium:dicarboxylate symporter  48.79 
 
 		 424 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113396  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2861  Sodium/dicarboxylate symporter  49.28 
 
 		 424 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2790  sodium:dicarboxylate symporter  46.88 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255988  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2261  sodium:dicarboxylate symporter  41.28 
 
 		 488 aa  316  7e-85  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.606229  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1319  sodium:dicarboxylate symporter  35.85 
 
 		 437 aa  249  7e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0460332  normal  0.366599 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0052  proton/glutamate symporter  35.58 
 
 		 433 aa  249  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1281  sodium/dicarboxylate symporter  36.96 
 
 		 434 aa  247  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.14269  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2227  sodium:dicarboxylate symporter  34.47 
 
 		 439 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.49503  hitchhiker  0.00495377 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0956  sodium:dicarboxylate symporter  37.63 
 
 		 437 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001114  proton/glutamate symporter  35.12 
 
 		 434 aa  241  1e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.602578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11810  Na+/H+ dicarboxylate symporter  33.72 
 
 		 440 aa  240  2.9999999999999997e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0215347 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2844  sodium:dicarboxylate symporter  34.2 
 
 		 436 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000693951  decreased coverage  0.00000000285663 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0863  sodium:dicarboxylate symporter  32.53 
 
 		 443 aa  236  4e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3549  sodium:dicarboxylate symporter  36.29 
 
 		 444 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0768  sodium:dicarboxylate symporter  36.29 
 
 		 444 aa  236  6e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04867  glutamate-aspartate symport protein  34.42 
 
 		 434 aa  236  6e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3480  sodium:dicarboxylate symporter  36.03 
 
 		 444 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3671  sodium:dicarboxylate symporter  36.29 
 
 		 444 aa  235  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.154898 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2768  proton/glutamate symporter  33.49 
 
 		 430 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0233  proton/glutamate symporter  32.54 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1800  sodium:dicarboxylate symporter  32.78 
 
 		 436 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0926897  hitchhiker  0.00000253529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6400  sodium:dicarboxylate symporter  36.3 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0042  glutamate/aspartate:proton symporter  34.2 
 
 		 443 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.192783  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3259  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 440 aa  233  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3362  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 440 aa  233  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0775  sodium:dicarboxylate symporter  33.89 
 
 		 432 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0764  sodium:dicarboxylate symporter  33.33 
 
 		 435 aa  233  7.000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1582  sodium:dicarboxylate symporter  34.29 
 
 		 437 aa  232  9e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.147509 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1726  sodium:dicarboxylate symporter  33.81 
 
 		 437 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.172911 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1532  sodium:dicarboxylate symporter  32.63 
 
 		 442 aa  231  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000132104  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1657  sodium:dicarboxylate symporter  34.05 
 
 		 437 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.188605  hitchhiker  0.000269021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0922  proton/glutamate symporter  33.09 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2359  sodium:dicarboxylate symporter  33.71 
 
 		 449 aa  231  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0747418  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0743  sodium:dicarboxylate symporter  33.01 
 
 		 433 aa  230  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2349  sodium:dicarboxylate symporter  32.03 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0174  glutamate/aspartate:proton symporter  32.3 
 
 		 443 aa  229  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2492  sodium:dicarboxylate symporter  33.81 
 
 		 440 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.574734  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1852  sodium:dicarboxylate symporter  33.81 
 
 		 440 aa  229  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000496305 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6277  glutamate/aspartate:proton symporter  32.54 
 
 		 444 aa  229  1e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2499  sodium:dicarboxylate symporter  33.81 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.625769  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2481  sodium:dicarboxylate symporter  32.24 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72340  glutamate/aspartate:proton symporter  32.54 
 
 		 444 aa  227  3e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2612  sodium:dicarboxylate symporter  33.57 
 
 		 440 aa  227  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.821757  normal  0.0122814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0137  glutamate/aspartate:proton symporter  32.78 
 
 		 442 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.926861 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1338  proton/glutamate symporter  32.56 
 
 		 445 aa  226  7e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1836  sodium/proton:dicarboxylate (glutamate) symporter  33.25 
 
 		 457 aa  226  8e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0862  sodium:dicarboxylate symporter  31.12 
 
 		 449 aa  226  9e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03949  glutamate/aspartate:proton symporter  31.86 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4322  glutamate/aspartate:proton symporter  31.86 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4633  glutamate/aspartate:proton symporter  31.86 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03909  hypothetical protein  31.86 
 
 		 437 aa  225  1e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3915  sodium:dicarboxylate symporter  31.86 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1097  sodium:dicarboxylate symporter  34.76 
 
 		 452 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0366  sodium:dicarboxylate symporter  34.47 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538008  hitchhiker  0.000704417 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4598  glutamate/aspartate:proton symporter  31.86 
 
 		 437 aa  225  2e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5583  glutamate/aspartate:proton symporter  31.86 
 
 		 437 aa  225  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2121  sodium:dicarboxylate symporter  33.5 
 
 		 457 aa  224  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.343777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4540  glutamate/aspartate:proton symporter  31.86 
 
 		 437 aa  225  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3950  glutamate/aspartate:proton symporter  31.86 
 
 		 437 aa  225  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2253  sodium:dicarboxylate symporter  34.05 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0129  sodium:dicarboxylate symporter  35.29 
 
 		 417 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.957581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0368  glutamate-aspartate symport protein  29.72 
 
 		 425 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5090  glutamate/aspartate:proton symporter  33.02 
 
 		 442 aa  224  4e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  0.123213 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1441  proton/glutamate symporter family protein  32.55 
 
 		 411 aa  222  9e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1920  proton/sodium-glutamate symporter  34.47 
 
 		 423 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4677  glutamate/aspartate:proton symporter  31.13 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.844872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1904  sodium:dicarboxylate symporter  31.46 
 
 		 409 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.27759  normal  0.374206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4628  glutamate/aspartate:proton symporter  31.13 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4543  glutamate/aspartate:proton symporter  31.13 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.707717  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4628  glutamate/aspartate:proton symporter  31.13 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.740703 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4537  glutamate/aspartate:proton symporter  31.13 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.94288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0153  glutamate/aspartate:proton symporter  32.23 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.886104 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1810  proton/sodium-glutamate symporter  34.23 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1311  sodium:dicarboxylate symporter  33.02 
 
 		 411 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3531  proton/sodium-glutamate symporter  34.23 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1664  sodium:dicarboxylate symporter  34.47 
 
 		 423 aa  220  5e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0155  glutamate/aspartate:proton symporter  32.78 
 
 		 442 aa  220  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3835  excitatory amino acid transporter  34.51 
 
 		 425 aa  220  5e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3902  proton/glutamate symporter family protein  32.31 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1948  sodium:dicarboxylate symporter family protein  32.38 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1508  proton/glutamate symporter family protein  31.84 
 
 		 411 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1846  proton/sodium-glutamate symporter  33.65 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00724946 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1648  proton/sodium-glutamate symport protein  33.99 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1613  proton/sodium-glutamate symport protein  33.65 
 
 		 423 aa  218  2e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1547  proton/glutamate symporter family protein  31.6 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0277859  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1114  sodium:dicarboxylate symporter  32.45 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.819191  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11013  proton/glutamate symporter  31.64 
 
 		 481 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0298  sodium:dicarboxylate symporter  31.55 
 
 		 438 aa  216  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000430577 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1666  proton/sodium-glutamate symporter  33.41 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1799  proton/sodium-glutamate symporter  33.41 
 
 		 423 aa  216  7e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1395  glutamate/aspartate:proton symporter  30.15 
 
 		 438 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2904  sodium:dicarboxylate symporter  31.71 
 
 		 451 aa  215  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.555878  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1002  sodium:dicarboxylate symporter  33.26 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.541825 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1274  sodium:dicarboxylate symporter family protein  31.37 
 
 		 411 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>