48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0320 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 125 aa  242  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1384  general secretion pathway protein I  41.07 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  40.59 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  36.08 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  34.02 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  38.24 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  29.36 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  32.08 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  32.08 
 
 		 117 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  35.19 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  31.63 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  35.11 
 
 		 125 aa  51.2  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  34.48 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  37.93 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  34.48 
 
 		 122 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  34.07 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 		 123 aa  50.8  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  35.29 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  35.05 
 
 		 121 aa  50.1  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  31.31 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  31.78 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  29.79 
 
 		 132 aa  48.1  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  32.67 
 
 		 126 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3039  hypothetical protein  38.98 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.430738  normal  0.140833 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  31.63 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  39.24 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  29.09 
 
 		 130 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  32.29 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  29.73 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  29.29 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  29.29 
 
 		 121 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  30.19 
 
 		 131 aa  44.3  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  32.56 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  30.61 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  32.18 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  27.85 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  30.77 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  40 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3253  PilD-dependent protein  33.9 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  25.96 
 
 		 134 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>