More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1304 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1304  protein of unknown function UPF0047  100 
 
 		 137 aa  283  4e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.184846  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0080  hypothetical protein  67.65 
 
 		 136 aa  207  6e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0017  hypothetical protein  64.71 
 
 		 136 aa  199  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00239143  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0831  hypothetical protein  60.58 
 
 		 137 aa  184  5e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1394  hypothetical protein  62.5 
 
 		 137 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.722362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2751  hypothetical protein  59.72 
 
 		 145 aa  180  7e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.444584  normal  0.760506 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1450  protein of unknown function UPF0047  55.88 
 
 		 137 aa  179  1e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.713066  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2077  hypothetical protein  60.29 
 
 		 137 aa  178  2e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00188003  hitchhiker  0.000638573 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1445  hypothetical protein  56.93 
 
 		 138 aa  172  9.999999999999999e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0875053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3485  hypothetical protein  60.14 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.666502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2157  hypothetical protein  60.14 
 
 		 139 aa  168  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0204  hypothetical protein  59.42 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3634  protein of unknown function UPF0047  57.97 
 
 		 139 aa  166  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2728  protein of unknown function UPF0047  57.66 
 
 		 138 aa  165  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0206  hypothetical protein  59.42 
 
 		 139 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1191  hypothetical protein  57.25 
 
 		 139 aa  163  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0254  protein of unknown function UPF0047  54.68 
 
 		 140 aa  163  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2363  hypothetical protein  55.07 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100491  normal  0.704799 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3144  hypothetical protein  56.52 
 
 		 139 aa  162  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.531685  normal  0.493173 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1685  hypothetical protein  54.35 
 
 		 139 aa  162  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0111  hypothetical protein  55.07 
 
 		 150 aa  161  3e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000308533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2329  hypothetical protein  54.35 
 
 		 157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.561757  normal  0.383888 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1152  hypothetical protein  53.62 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3409  hypothetical protein  57.25 
 
 		 139 aa  160  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.000525529  normal  0.0925547 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2183  hypothetical protein  53.62 
 
 		 139 aa  159  9e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0456  hypothetical protein  57.25 
 
 		 138 aa  159  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000105947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0976  protein of unknown function UPF0047  54.74 
 
 		 138 aa  159  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.394936  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1857  hypothetical protein  57.25 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3230  hypothetical protein  55.8 
 
 		 139 aa  158  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0680  protein of unknown function UPF0047  57.25 
 
 		 138 aa  158  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000327687  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0608  polynucleotide adenylyltransferase/metal dependent phosphohydrolase  56.52 
 
 		 584 aa  157  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0225  hypothetical protein  52.9 
 
 		 139 aa  155  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2666  protein of unknown function UPF0047  53.62 
 
 		 138 aa  155  1e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.262754 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0225  hypothetical protein  52.17 
 
 		 139 aa  155  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1520  protein of unknown function UPF0047  52.17 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0913014  normal  0.716267 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0833  hypothetical protein  52.9 
 
 		 139 aa  154  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.236299  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3072  hypothetical protein  52.9 
 
 		 138 aa  153  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.455097  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3284  protein of unknown function UPF0047  53.28 
 
 		 138 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0570  hypothetical protein  52.9 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0955  protein of unknown function UPF0047  52.9 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0812583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0290  protein of unknown function UPF0047  55.47 
 
 		 138 aa  152  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.444924  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1956  hypothetical protein  53.62 
 
 		 139 aa  152  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0266366  normal  0.0623064 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2359  protein of unknown function UPF0047  51.09 
 
 		 138 aa  151  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2106  hypothetical protein  54.01 
 
 		 138 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2109  protein of unknown function UPF0047  50 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0609464 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1344  hypothetical protein  51.82 
 
 		 138 aa  150  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1410  hypothetical protein  52.9 
 
 		 139 aa  150  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.360992 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2067  protein of unknown function UPF0047  52.9 
 
 		 138 aa  150  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0515  protein of unknown function UPF0047  52.55 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0221734  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1065  hypothetical protein  50.72 
 
 		 138 aa  149  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00346486  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2631  hypothetical protein  53.28 
 
 		 138 aa  148  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0114  protein of unknown function UPF0047  51.45 
 
 		 139 aa  149  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627412  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0920  protein of unknown function UPF0047  51.45 
 
 		 139 aa  148  2e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1739  protein of unknown function UPF0047  54.74 
 
 		 138 aa  147  7e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0655  hypothetical protein  39.71 
 
 		 139 aa  110  6e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22360  hypothetical protein  54.26 
 
 		 95 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0603  hypothetical protein  38.69 
 
 		 143 aa  107  5e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1612  hypothetical protein  38.69 
 
 		 137 aa  105  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1204  hypothetical protein  41.13 
 
 		 136 aa  102  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0183  hypothetical protein  39.2 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.7709 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0947  hypothetical protein  38.17 
 
 		 132 aa  100  5e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0925  hypothetical protein  37.4 
 
 		 132 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000978518  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0167  hypothetical protein  38.24 
 
 		 136 aa  98.6  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0339  protein of unknown function UPF0047  37.23 
 
 		 137 aa  97.4  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1056  hypothetical protein  33.59 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.858147  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0301  hypothetical protein  41.13 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.157186 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3771  protein of unknown function UPF0047  37.98 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0008  hypothetical protein  39.69 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000191173  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0783  protein of unknown function UPF0047  38.76 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0451  hypothetical protein  37.78 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0826  hypothetical protein  37.3 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0262  hypothetical protein  37.5 
 
 		 132 aa  94  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.016516  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0693  hypothetical protein  34.62 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221984  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0264  protein of unknown function UPF0047  39.52 
 
 		 140 aa  93.6  7e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.846801  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0672  hypothetical protein  36.57 
 
 		 141 aa  93.6  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2150  hypothetical protein  31.82 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000319689  hitchhiker  0.000345758 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0620  protein of unknown function UPF0047  37.4 
 
 		 132 aa  92.8  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.17685e-35 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0463  hypothetical protein  38.71 
 
 		 142 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.822173  normal  0.159097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1211  protein of unknown function UPF0047  36.43 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0943  hypothetical protein  37.8 
 
 		 130 aa  90.5  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0606  protein of unknown function UPF0047  36.64 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2221  protein of unknown function UPF0047  36.88 
 
 		 141 aa  90.5  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0065  hypothetical protein  34.53 
 
 		 139 aa  89.4  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1526  hypothetical protein  32.28 
 
 		 133 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.183474 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03800  conserved hypothetical protein TIGR00149  36.44 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0727  hypothetical protein  33.59 
 
 		 143 aa  88.6  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0718399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1000  protein of unknown function UPF0047  34.85 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.606508  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1728  protein of unknown function UPF0047  37.82 
 
 		 141 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1417  hypothetical protein  35.46 
 
 		 141 aa  87  7e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0452  hypothetical protein  32.81 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.430845  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0103  hypothetical protein  34.38 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2112  hypothetical protein  31.78 
 
 		 132 aa  85.1  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000735836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1967  hypothetical protein  35.66 
 
 		 132 aa  84.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.990431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3648  hypothetical protein  33.59 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1825  protein of unknown function UPF0047  36.3 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.47523 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1685  protein of unknown function UPF0047  34.81 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1649  hypothetical protein  30.6 
 
 		 161 aa  84.3  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.64557  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0251  hypothetical protein  34.29 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.33287  normal  0.163984 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0431  hypothetical protein  36.51 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0277947  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0126  protein of unknown function UPF0047  31.01 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>