More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A0354 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  99.51 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  100 
 
 		 204 aa  422  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  99.02 
 
 		 204 aa  419  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  98.53 
 
 		 204 aa  417  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  81.09 
 
 		 204 aa  344  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  81.59 
 
 		 204 aa  342  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  81.59 
 
 		 204 aa  342  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  81.09 
 
 		 204 aa  340  7e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  80.59 
 
 		 178 aa  291  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  82.72 
 
 		 166 aa  283  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  82.72 
 
 		 166 aa  283  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  80.25 
 
 		 166 aa  279  2e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  63.86 
 
 		 207 aa  268  5e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  61.39 
 
 		 207 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  60.59 
 
 		 207 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  61.58 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  53.47 
 
 		 204 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  42.79 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  38.6 
 
 		 248 aa  155  3e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  41.5 
 
 		 199 aa  154  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  35.82 
 
 		 229 aa  150  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  40.61 
 
 		 219 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  40.21 
 
 		 202 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  34.78 
 
 		 210 aa  138  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  41.75 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  36.27 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  41.35 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_509  peptide chain release factor 2  33 
 
 		 357 aa  89.4  3e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231762  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1151  peptide chain release factor 2  33.17 
 
 		 381 aa  88.6  6e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0230  peptide chain release factor 2  36.13 
 
 		 330 aa  87.4  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.413245  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0570  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  33.52 
 
 		 362 aa  87  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000011559  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  32.74 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0544  peptide chain release factor 2  35 
 
 		 356 aa  86.7  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00703964  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1471  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 349 aa  86.7  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2570  peptide chain release factor 2  30.69 
 
 		 417 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0324776  normal  0.0245297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1030  peptide chain release factor 2 protein  31.02 
 
 		 300 aa  85.1  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.235991  normal  0.771675 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2758  peptide chain release factor 2  32.5 
 
 		 367 aa  85.1  7e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2248  hypothetical protein  32.5 
 
 		 367 aa  85.1  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0921  peptide chain release factor 2  31.55 
 
 		 349 aa  84.7  8e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.181333  normal  0.893084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0960  hypothetical protein  32.14 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0655613 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3265  peptide chain release factor 2  33.12 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.337928  hitchhiker  0.000000190914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0895  hypothetical protein  32.14 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0852209 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0486  peptide chain release factor 2  32.14 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.289866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1072  peptide chain release factor 2  29.73 
 
 		 357 aa  83.6  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1449  peptide chain release factor 2  30.27 
 
 		 359 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.768033 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  30.77 
 
 		 367 aa  83.6  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0075  peptide chain release factor 2  30.14 
 
 		 282 aa  83.2  0.000000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00578068  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1036  peptide chain release factor 2  29.73 
 
 		 357 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.178506 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1847  peptide chain release factor 2  31.87 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  38.57 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0467  PE-PGRS family protein  35.48 
 
 		 377 aa  83.2  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  30.48 
 
 		 391 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1069  peptide chain release factor 2  32.02 
 
 		 347 aa  82.8  0.000000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.624401 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16430  peptide chain release factor 2  44.79 
 
 		 331 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000953459  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  30.48 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1732  peptide chain release factor 2  43.48 
 
 		 369 aa  82.8  0.000000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  30.48 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  32.22 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  30.48 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  30.48 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  36.02 
 
 		 366 aa  82  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  32.22 
 
 		 349 aa  82  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2154  peptide chain release factor 2  29.95 
 
 		 406 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0694962  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  29.41 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1242  peptide chain release factor 2  30.22 
 
 		 367 aa  81.6  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00779593  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0922  peptide chain release factor 1  45.68 
 
 		 363 aa  81.6  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.276919  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  29.41 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1444  peptide chain release factor 1  56.96 
 
 		 357 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  29.41 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  29.41 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1409  peptide chain release factor 2  30.77 
 
 		 330 aa  81.3  0.000000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0056831  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  29.41 
 
 		 248 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0949  peptide chain release factor 1  45.83 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0365  peptide chain release factor 2  29.15 
 
 		 357 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  36.17 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2103  hypothetical protein  28.57 
 
 		 372 aa  81.3  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.117234  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0791  peptide chain release factor 2  44.14 
 
 		 378 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1699  peptide chain release factor 2  29.41 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822154  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1451  peptide chain release factor 2  42.61 
 
 		 372 aa  80.1  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0981  peptide chain release factor 2  43.36 
 
 		 373 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.454282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  34.29 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2590  peptide chain release factor 2, programmed  29.41 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1799  peptide chain release factor 2  35.33 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1303  LigA  30.05 
 
 		 365 aa  80.5  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.082327 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  29.41 
 
 		 367 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2029  peptide chain release factor 1  30.43 
 
 		 358 aa  80.1  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1549  peptide chain release factor 2  29.67 
 
 		 369 aa  79.7  0.00000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.168139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1884  peptide chain release factor 2  33.09 
 
 		 459 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.344526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1786  peptide chain release factor 2  33.57 
 
 		 317 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000314162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0961  peptide chain release factor 2  34.73 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.379105  hitchhiker  0.00626958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3791  hypothetical protein  32.3 
 
 		 367 aa  79.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.914403  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3970  peptide chain release factor 2  31.61 
 
 		 366 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000632573  unclonable  0.000000000161468 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_23862  predicted protein  52.7 
 
 		 283 aa  79  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2901  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 360 aa  79  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1756  peptide chain release factor 1  50 
 
 		 362 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000801734  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3077  peptide chain release factor 2  35.71 
 
 		 332 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00097655  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3146  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 360 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0205917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3044  peptide chain release factor 1  44.9 
 
 		 360 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2798  peptide chain release factor 1  47.56 
 
 		 360 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>