More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0717 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0717  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  100 
 
 
266 aa  544  1e-154  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00506919  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1118  amino acid ABC transporter periplasmic protein  64.96 
 
 
277 aa  318  3.9999999999999996e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1134  extracellular solute-binding protein family 3  43.5 
 
 
274 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0309695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1043  extracellular solute-binding protein family 3  40.51 
 
 
278 aa  190  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0928  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  41.3 
 
 
259 aa  184  9e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0467601  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0999  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  41.7 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1164  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  41.67 
 
 
264 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00378552  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0893  bifunctional adhesin/ABC transporter aspartate/glutamate-binding protein  40.89 
 
 
259 aa  182  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.144905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1476  extracellular solute-binding protein family 3  37.39 
 
 
286 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2806  extracellular solute-binding protein family 3  37.55 
 
 
281 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0527  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.27 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000799284  normal  0.37581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0769  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.87 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0553  extracellular solute-binding protein  32.23 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0676  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.87 
 
 
276 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4662  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.5 
 
 
276 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.257219  hitchhiker  2.83751e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0607  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.5 
 
 
276 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.510404  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0552  glutamine ABC transporter substrate-binding protein  31.5 
 
 
276 aa  122  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.368136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0640  amino acid ABC transporter amino acid-binding protein  31.5 
 
 
276 aa  122  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0697  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.5 
 
 
276 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0708  amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  31.5 
 
 
276 aa  122  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0551  glytamine ABC transporter substrate-binding protein  31.5 
 
 
276 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1512  extracellular solute-binding protein  33.07 
 
 
276 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0541  extracellular solute-binding protein  31.72 
 
 
275 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2153  extracellular solute-binding protein family 3  29.57 
 
 
273 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0684055 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0529  amino acid ABC transporter periplasmic protein  32.77 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.488243  hitchhiker  0.00197621 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4039  extracellular solute-binding protein family 3  34.18 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3925  extracellular solute-binding protein family 3  34.18 
 
 
295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1429  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
271 aa  113  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1633  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.58 
 
 
287 aa  112  8.000000000000001e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3062  extracellular solute-binding protein family 3  27.67 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000243689 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1051  extracellular solute-binding protein family 3  33.85 
 
 
257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.310082  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1779  extracellular solute-binding protein  32.49 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00357898 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4004  extracellular solute-binding protein family 3  30.65 
 
 
278 aa  109  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1621  extracellular solute-binding protein  31.12 
 
 
271 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0810697  normal  0.181323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3508  extracellular solute-binding protein family 3  27.62 
 
 
319 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0021  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.16 
 
 
279 aa  107  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.43972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1515  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
271 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1137  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
271 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1617  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
271 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1593  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
271 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.227678  normal  0.74753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3152  extracellular solute-binding protein family 3  28.02 
 
 
271 aa  106  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0865808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1538  extracellular solute-binding protein  30.29 
 
 
292 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.133709  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2813  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 
319 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.243067  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1497  extracellular solute-binding protein family 3  29.66 
 
 
305 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4591  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 
278 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4271  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 
278 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2009  cystine transporter subunit  28.46 
 
 
265 aa  103  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.163072  decreased coverage  0.0074335 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3746  extracellular solute-binding protein  29.79 
 
 
266 aa  103  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2787  extracellular solute-binding protein family 3  29.96 
 
 
275 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4213  extracellular solute-binding protein family 3  29.06 
 
 
278 aa  102  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1489  extracellular solute-binding protein  28.98 
 
 
268 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.334737  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0787  extracellular solute-binding protein  28.52 
 
 
277 aa  102  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4942  extracellular solute-binding protein  27.41 
 
 
341 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.997084 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4762  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  29.46 
 
 
271 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.739753  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0520  amino acid  30.98 
 
 
270 aa  102  8e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1624  extracellular solute-binding protein family 3  31.03 
 
 
344 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.467611  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2218  extracellular solute-binding protein  31.62 
 
 
275 aa  102  9e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.120709  normal  0.459989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3086  putative ABC transporter binding protein subunit  28.93 
 
 
268 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.054532  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1449  extracellular solute-binding protein family 3  30.04 
 
 
295 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2450  extracellular solute-binding protein  28.81 
 
 
271 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1550  extracellular solute-binding protein family 3  28.75 
 
 
294 aa  101  1e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.82369  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0326  polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein  28.39 
 
 
271 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178009  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0835  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
271 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.447071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2051  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
271 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0325389  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4191  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.13 
 
 
284 aa  100  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0122303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4165  polar amino acid ABC transporter periplasmic amino acid-binding protein  30.13 
 
 
284 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1883  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.39 
 
 
271 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4237  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 
284 aa  100  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1895  putative amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  28.39 
 
 
271 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.299924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0201  extracellular solute-binding protein  29.31 
 
 
324 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1670  extracellular solute-binding protein  28.39 
 
 
271 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.720486  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3496  extracellular solute-binding protein  28.91 
 
 
258 aa  100  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0836  ABC amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  30.2 
 
 
266 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0996489 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4248  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
266 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0312845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1760  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  31.32 
 
 
341 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186199  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0468  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000361301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0244  cystine transporter subunit  29.41 
 
 
266 aa  99.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.136857  normal  0.712908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4887  extracellular solute-binding protein family 3  30.91 
 
 
315 aa  99.8  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.363546  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0017  extracellular solute-binding protein  29.22 
 
 
279 aa  99.8  5e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.822209  normal  0.141798 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4772  extracellular solute-binding protein  30.33 
 
 
266 aa  99.4  5e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1563  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  30.3 
 
 
341 aa  99.8  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.519908  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1590  extracellular solute-binding protein family 3  25.67 
 
 
282 aa  99.4  6e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000563013  normal  0.528565 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1124  extracellular solute-binding protein family 3  29.17 
 
 
289 aa  99.4  6e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.901238  normal  0.221919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2257  amino-acid-binding periplasmic ABC transporter protein  26.25 
 
 
284 aa  99  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.780862  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1056  extracellular solute-binding protein  29.13 
 
 
250 aa  98.6  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133402  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0127  polar amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.52 
 
 
272 aa  98.6  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0704  extracellular solute-binding protein  28.88 
 
 
332 aa  98.6  9e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.721157  normal  0.0331446 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2802  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 
294 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.228556  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0917  extracellular solute-binding protein  28.63 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3014  extracellular solute-binding protein  28.38 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569959  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0324  extracellular solute-binding protein  30.41 
 
 
246 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2969  extracellular solute-binding protein  29.82 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87246  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2936  cystine transporter subunit  28.68 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1224  extracellular solute-binding protein  28.51 
 
 
323 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0342  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 
246 aa  97.4  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6801  extracellular solute-binding protein family 3  25.85 
 
 
275 aa  97.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3417  extracellular solute-binding protein family 3  29.75 
 
 
268 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2694  cystine transporter subunit  29.87 
 
 
266 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.520163  normal  0.0574677 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1935  amino acid ABC transporter periplasmic protein  30.19 
 
 
288 aa  96.7  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1048  cystine transporter subunit  29.87 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.202301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>