More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2928 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2928  transcriptional regulator, TrmB  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 125 aa  136  7.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  46 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  38.53 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 109 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0502  transcriptional regulator, ArsR family  32.04 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1508  regulatory protein ArsR  37.89 
 
 		 112 aa  74.3  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.531192 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4431  ArsR family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.653801  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 116 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  40.21 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3896  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3904  ArsR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.53534 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  39.42 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19620  transcriptional regulator, ArsR family  36.52 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00139009  normal  0.0620554 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1244  regulatory protein, ArsR  40.7 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2205  ArsR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.273096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5393  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497989 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  39.77 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  39.77 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  36 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1568  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00153678  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2650  regulatory protein ArsR  45.21 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10842  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.67021e-19  hitchhiker  0.000000379454 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2331  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4475  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4306  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4206  ArsR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.938952  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3243  regulatory protein, ArsR  38.1 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3640  regulatory protein, ArsR  35.83 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1827  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 93 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1667  ArsR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 117 aa  61.2  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.214813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2865  regulatory protein, ArsR  38.68 
 
 		 138 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5370  regulatory protein, ArsR  37.62 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.56529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  35.44 
 
 		 95 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0315  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0516242  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25840  transcriptional regulator, ArsR family  36.59 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1005  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0103223  normal  0.0233709 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5742  ArsR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0605  regulatory protein, ArsR  45.21 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.208863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  38.71 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3178  regulatory protein, ArsR  45.21 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.150405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2653  regulatory protein ArsR  38.95 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.696132  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  43.75 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1801  ArsR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 108 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0506  regulatory protein, ArsR  50.77 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5412  regulatory protein, ArsR  50.77 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257152 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0769  regulatory protein, ArsR  36.56 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5392  regulatory protein, ArsR  50.77 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5293  ArsR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1408  transcriptional regulator, ArsR family  34.04 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  39.76 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000457227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1161  regulatory protein, ArsR  36.56 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.358448  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3817  ArsR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 101 aa  57.4  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0450751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2609  regulatory protein ArsR  49.23 
 
 		 127 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1541  cadmium efflux system accessory protein  36.56 
 
 		 125 aa  57  0.00000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.558701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 121 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0236  transcriptional regulator, ArsR family  34.41 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000016781  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1220  regulatory protein, ArsR  34.29 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  42.5 
 
 		 119 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3047  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1675  regulatory protein, ArsR  38 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1747  regulatory protein, ArsR  37.37 
 
 		 108 aa  57  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000191079  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0245  regulatory protein, ArsR  38.16 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25780  transcriptional regulator, ArsR family  36.19 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  43.66 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 111 aa  55.5  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0487  ArsR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2209  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03333  predicted transcriptional regulator  42.67 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1942  ArsR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 129 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2202  ArsR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 117 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.975415  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0925  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000939466  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1275  regulatory protein, ArsR  40 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0149892  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1644  ArsR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 297 aa  54.7  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1613  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2335  ArsR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0758735 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0758  ArsR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3820  regulatory protein, ArsR  33.94 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1546  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0234857  normal  0.041632 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0517  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 122 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2884  ArsR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.301684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0646  rhodanese domain-containing protein  38.04 
 
 		 218 aa  54.3  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2973  transcriptional regulator, ArsR family  34.15 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  34.62 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1207  transcriptional regulator, ArsR family  36.56 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112354 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  41.03 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0491  regulatory protein, ArsR  34.62 
 
 		 114 aa  54.3  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0771  regulatory protein ArsR  35.96 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00625866  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3637  transcriptional regulator of ArsR family protein  41.79 
 
 		 115 aa  53.9  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 123 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0131  transcriptional regulator, ArsR family  38.37 
 
 		 122 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000586793  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>