More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2845 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2845  dihydroorotase, multifunctional complex type  100 
 
 		 454 aa  903    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  58.07 
 
 		 461 aa  491  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1388  allantoinase  57.83 
 
 		 448 aa  478  1e-133  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00418936  normal  0.12526 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2609  allantoinase  55.51 
 
 		 449 aa  467  9.999999999999999e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1177  allantoinase  47.56 
 
 		 449 aa  436  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  44.84 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  44.84 
 
 		 453 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  44.62 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  45.05 
 
 		 453 aa  405  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  44.84 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  44.62 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  44.18 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  44.62 
 
 		 453 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  44.18 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  44.18 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  44.18 
 
 		 453 aa  399  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0775  allantoinase  42.6 
 
 		 458 aa  371  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.257845 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1178  allantoinase  39.6 
 
 		 452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6769  allantoinase  39.29 
 
 		 448 aa  306  7e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2590  allantoinase  43.11 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.247318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4856  allantoinase  39.02 
 
 		 446 aa  288  1e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2784  allantoinase  41.11 
 
 		 468 aa  279  6e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.766165  hitchhiker  0.000087789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2550  allantoinase  40.42 
 
 		 435 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0293487  normal  0.265015 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0714  allantoinase  41.87 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.866042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4726  allantoinase  41.94 
 
 		 443 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2026  allantoinase  38.63 
 
 		 449 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3169  allantoinase  37.42 
 
 		 455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.45812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2841  allantoinase  40.18 
 
 		 450 aa  267  4e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08130  allantoinase  38.89 
 
 		 503 aa  265  2e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2778  allantoinase  42.09 
 
 		 457 aa  263  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3440  allantoinase  38.17 
 
 		 447 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4867  putative allantoinase  36.25 
 
 		 473 aa  260  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.53 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3693  allantoinase  37.42 
 
 		 447 aa  256  8e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5703  amidohydrolase  43.62 
 
 		 454 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0693398  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.47 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04603  allantoinase (Eurofung)  35.29 
 
 		 506 aa  247  3e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0105503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  36.14 
 
 		 454 aa  236  6e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5681  allantoinase  37.94 
 
 		 480 aa  236  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.642788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2544  amidohydrolase  39.37 
 
 		 459 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0235  allantoinase  38.42 
 
 		 442 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0839  allantoinase  39.16 
 
 		 453 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  36.92 
 
 		 458 aa  234  3e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  41.01 
 
 		 569 aa  233  6e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2077  Allantoinase  40.04 
 
 		 473 aa  222  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2641  amidohydrolase  35.84 
 
 		 452 aa  222  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  35.48 
 
 		 432 aa  219  8.999999999999998e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3038  dihydroorotase  37.5 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0322135  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5328  dihydroorotase  37.5 
 
 		 456 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1099  dihydroorotase  34.82 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND00740  allantoinase, putative  34.38 
 
 		 481 aa  213  4.9999999999999996e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.260502  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0713  dihydroorotase  35.49 
 
 		 440 aa  212  9e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.777934 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4128  dihydroorotase  33.91 
 
 		 462 aa  210  3e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4940  dihydroorotase  37.28 
 
 		 456 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.536764  normal  0.361909 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3951  amidohydrolase  35.43 
 
 		 445 aa  207  2e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.825589  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6048  amidohydrolase  36.56 
 
 		 448 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.235771  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  34.48 
 
 		 474 aa  204  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  34.06 
 
 		 459 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  35.59 
 
 		 467 aa  203  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  33.83 
 
 		 471 aa  202  7e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3013  amidohydrolase  34.72 
 
 		 461 aa  202  8e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.680754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4364  Allantoinase  34.49 
 
 		 459 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00228036 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0320  dihydroorotase  37 
 
 		 458 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.971418  normal  0.883655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0750  dihydroorotase  33.72 
 
 		 445 aa  200  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1103  dihydroorotase  36.83 
 
 		 465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498208  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0357  dihydropyrimidinase  32.29 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.990091  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  32.06 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6385  D-hydantoinase  31.68 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2746  phenylhydantoinase  33.41 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6216  dihydropyrimidinase  31.68 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6618  dihydropyrimidinase  31.68 
 
 		 475 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1257  dihydroorotase  34.82 
 
 		 444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.106304  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5170  dihydropyrimidinase  35.04 
 
 		 469 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.72 
 
 		 429 aa  196  8.000000000000001e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  36.53 
 
 		 475 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6542  phenylhydantoinase  33.55 
 
 		 467 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.517189 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2703  dihydroorotase  33.56 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0353543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2737  dihydroorotase  36.07 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.634212  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3514  allantoinase  35.27 
 
 		 460 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4616  phenylhydantoinase  34.41 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4330  dihydroorotase  33.78 
 
 		 444 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.436145 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0725  dihydropyrimidinase  33.68 
 
 		 484 aa  193  6e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2077  dihydroorotase  35.78 
 
 		 440 aa  192  1e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.133238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2983  dihydropyrimidinase  33.99 
 
 		 477 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1239  dihydroorotase  33.85 
 
 		 444 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.851425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3987  amidohydrolase  33.04 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  34.2 
 
 		 485 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  33.98 
 
 		 485 aa  191  2e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2376  dihydroorotase  34.07 
 
 		 444 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  34.13 
 
 		 479 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5601  dihydropyrimidinase  32.71 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0814  dihydroorotase  33.63 
 
 		 445 aa  191  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000170879 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1112  phenylhydantoinase  32.17 
 
 		 489 aa  191  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.728125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  34.2 
 
 		 485 aa  190  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0358  dihydropyrimidinase  32.29 
 
 		 483 aa  190  5e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  31.13 
 
 		 474 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  32.68 
 
 		 472 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1753  dihydroorotase  34.51 
 
 		 446 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5687  dihydropyrimidinase  31.18 
 
 		 477 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0293921  normal  0.131902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  34.05 
 
 		 496 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>