More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2476 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2476  major facilitator transporter  100 
 
 		 443 aa  858    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.12451  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3554  major facilitator superfamily MFS_1  60.21 
 
 		 424 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2617  major facilitator transporter  57.35 
 
 		 436 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0674  major facilitator transporter  54.29 
 
 		 437 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0231526  normal  0.492835 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9121  MFS permease  53.48 
 
 		 432 aa  431  1e-119  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2084  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 437 aa  430  1e-119  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2176  major facilitator transporter  55.26 
 
 		 439 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  hitchhiker  0.0000538541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2330  major facilitator transporter  55.99 
 
 		 434 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5147  major facilitator superfamily MFS_1  51.55 
 
 		 440 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.444921  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1093  major facilitator superfamily MFS_1  55.01 
 
 		 439 aa  428  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6784  d-galactonate transporter  53.83 
 
 		 432 aa  426  1e-118  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3403  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  55.01 
 
 		 439 aa  425  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5566  MFS family transporter  54.33 
 
 		 432 aa  428  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.728294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1135  major facilitator transporter  51.89 
 
 		 440 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.470492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2465  major facilitator transporter  55.75 
 
 		 434 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.5574  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2352  permease transmembrane protein  57.56 
 
 		 442 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.789866  normal  0.830422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2568  major facilitator superfamily MFS_1  56.59 
 
 		 444 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5747  major facilitator transporter  55.99 
 
 		 434 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00807229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2424  major facilitator transporter  55.99 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.382269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0475  major facilitator transporter  48.96 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.301419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1808  major facilitator transporter  55.99 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.665713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2420  major facilitator transporter  55.99 
 
 		 434 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0112517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2813  major facilitator transporter  51.44 
 
 		 443 aa  417  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.330975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2213  MFS family transporter  52.95 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal  0.657304 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1424  major facilitator transporter  48.58 
 
 		 454 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412908  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5121  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.857883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4553  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2163  major facilitator superfamily MFS_1  56.23 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.115579  normal  0.634324 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5158  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0208308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1926  major facilitator transporter  53.64 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.145333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3209  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5076  major facilitator transporter  49.15 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.374373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3497  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 441 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0999576  normal  0.231487 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5652  D-galactonate transporter  49.88 
 
 		 433 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0875  major facilitator family transporter  55.61 
 
 		 435 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1838  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0185712  normal  0.0754586 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0510  major facilitator superfamily MFS_1  53.68 
 
 		 440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170937  normal  0.137967 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4657  d-galactonate transporter  50.35 
 
 		 432 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0993  major facilitator transporter  49.89 
 
 		 442 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3735  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2174  major facilitator transporter  48.41 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.128006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4121  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3412  major facilitator superfamily MFS_1  50.36 
 
 		 441 aa  402  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1903  major facilitator transporter  51.08 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00105167  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2015  major facilitator transporter  51.08 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.140886  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0872  major facilitator transporter  55.75 
 
 		 434 aa  404  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.739762  normal  0.91668 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2245  major facilitator transporter  51.44 
 
 		 436 aa  402  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00928711  normal  0.230459 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2081  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.802613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1460  major facilitator superfamily MFS_1  48.93 
 
 		 433 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4426  major facilitator transporter  47.85 
 
 		 445 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.669348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1446  major facilitator transporter  54.66 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.72061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1923  anion:cation symporter (ACS) family protein  48.4 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.258877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0574  major facilitator family transporter  48.4 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4536  major facilitator transporter  49.63 
 
 		 443 aa  398  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0441  major facilitator family transporter  48.4 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0974  major facilitator family transporter  48.64 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1860  major facilitator family transporter  48.4 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4914  major facilitator transporter  51.8 
 
 		 441 aa  395  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  0.122753 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0709  major facilitator transporter  45.74 
 
 		 462 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.143915 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2016  putative transmembrane permease transporter  48.4 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0893  major facilitator family transporter  48.4 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3264  major facilitator transporter  49.88 
 
 		 439 aa  392  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.527134  normal  0.0678153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4776  major facilitator transporter  48.46 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3036  major facilitator superfamily MFS_1  47.39 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.391657  normal  0.013727 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1028  major facilitator transporter  51.64 
 
 		 437 aa  395  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.834344 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4631  D-galactonate transporter  54.34 
 
 		 437 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5876  major facilitator transporter  48.67 
 
 		 442 aa  395  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5400  major facilitator superfamily MFS_1  53.63 
 
 		 430 aa  392  1e-108  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5346  major facilitator superfamily MFS_1  53.49 
 
 		 444 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2120  major facilitator transporter  51.31 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143784 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6659  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0733  major facilitator family transporter  55.37 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3004  anion:cation symporter (ACS) family protein  55.37 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1233  major facilitator family transporter  55.13 
 
 		 435 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0497  major facilitator superfamily MFS_1  53.19 
 
 		 440 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.672228  normal  0.425922 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1593  anion:cation symporter (ACS) family protein  55.37 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4861  major facilitator transporter  52.71 
 
 		 444 aa  390  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2936  major facilitator transporter  51.42 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.26738  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2280  anion:cation symporter (ACS) family protein  55.37 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6424  major facilitator transporter  50.73 
 
 		 441 aa  389  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1081  anion:cation symporter (ACS) family protein  55.37 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2720  general substrate transporter  47.13 
 
 		 451 aa  387  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1444  major facilitator superfamily MFS_1  52.27 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945143  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1075  major facilitator superfamily permease  55.37 
 
 		 435 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4932  major facilitator transporter  50 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.459954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4413  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 441 aa  388  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0685808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4250  major facilitator transporter  51.28 
 
 		 440 aa  382  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.469976  normal  0.49085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5141  major facilitator transporter  48.88 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0295107  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6257  major facilitator transporter  50.49 
 
 		 441 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5928  major facilitator superfamily MFS_1  48.52 
 
 		 445 aa  385  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3117  MFS family transporter  50 
 
 		 445 aa  384  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1877  major facilitator transporter  50.69 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4989  major facilitator transporter  49.39 
 
 		 442 aa  380  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4926  major facilitator transporter  48.09 
 
 		 437 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.813496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6799  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4685  major facilitator superfamily MFS_1  49.4 
 
 		 439 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.645829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1526  major facilitator superfamily tartrate/H(+) symporter  51.1 
 
 		 456 aa  375  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5277  major facilitator transporter  48.33 
 
 		 433 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6296  major facilitator transporter  46.79 
 
 		 448 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2014  major facilitator superfamily MFS_1  48.83 
 
 		 450 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.083692 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>