47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2413 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2413  glycoside hydrolase 15-related  100 
 
 		 412 aa  764    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.798846  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4222  glycoside hydrolase 15-related protein  53.79 
 
 		 484 aa  322  6e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31600  glycosyl hydrolase, glucoamylase  40.36 
 
 		 549 aa  207  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.618775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0219  glycoside hydrolase 15-related  44.41 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0997463  hitchhiker  0.0053447 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0817  glycoside hydrolase 15-related protein  39.46 
 
 		 472 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.47489 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0688  glycoside hydrolase 15-related protein  40.29 
 
 		 487 aa  173  5e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0389398  hitchhiker  0.0000253307 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0187  glucoamylase-related glycosyl hydrolase-like protein  34.62 
 
 		 485 aa  137  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10260  hypothetical protein  36.75 
 
 		 466 aa  116  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0277  glycoside hydrolase 15-related protein  26.37 
 
 		 615 aa  103  5e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.70107  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0090  glycoside hydrolase 15-related  26.35 
 
 		 604 aa  97.8  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.33989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1047  glycoside hydrolase 15-related  29.87 
 
 		 663 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.425062  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1503  glycoside hydrolase 15-related  29.56 
 
 		 649 aa  93.6  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.227839  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1787  glycoside hydrolase 15-related  23.8 
 
 		 644 aa  93.2  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.26438  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0602  glycoside hydrolase 15-related  23.65 
 
 		 621 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0335  glycoside hydrolase 15-related  25.61 
 
 		 644 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0202  glycoside hydrolase 15-related protein  29.52 
 
 		 668 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2939  glycoside hydrolase 15-related  25.61 
 
 		 642 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0165547  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1916  glucan 1,4-alpha-glucosidase  26.21 
 
 		 569 aa  83.6  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0537  glycoside hydrolase 15-related  25.07 
 
 		 621 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0301  glycoside hydrolase 15-related  24.15 
 
 		 621 aa  82.4  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.394812  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0010  glycoside hydrolase 15-related  23.86 
 
 		 627 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.148558  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1382  glycoside hydrolase 15-related  24.43 
 
 		 621 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.245584  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1420  glycoside hydrolase 15-related  23.48 
 
 		 615 aa  75.5  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0134624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3601  glycoside hydrolase 15-related  25.99 
 
 		 670 aa  69.7  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0649  glycoside hydrolase 15-related protein  32.37 
 
 		 610 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1968  glycoside hydrolase 15-related protein  21.28 
 
 		 622 aa  67  0.0000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0709  glycoside hydrolase 15-related  22.45 
 
 		 647 aa  65.9  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0526  glycoside hydrolase 15-related  23.2 
 
 		 645 aa  66.2  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1626  glycoside hydrolase 15-related  22.72 
 
 		 622 aa  62  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0120463  normal  0.415513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0431  glycoside hydrolase 15-related protein  28.65 
 
 		 650 aa  62  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0395513  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0228  glycoside hydrolase 15-related  23.3 
 
 		 611 aa  60.1  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.159353  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0438  glycoside hydrolase 15-related protein  25.23 
 
 		 647 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.719432  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0540  glucoamylase  23.48 
 
 		 673 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3332  carbohydrate-binding family 6 protein  31.12 
 
 		 870 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0651  glycoside hydrolase 15-like protein  31.4 
 
 		 602 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253524  hitchhiker  0.0000870842 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4874  glycoside hydrolase 15-related  28.88 
 
 		 598 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0766872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0304  glycoside hydrolase 15-related protein  27.11 
 
 		 636 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3431  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.25 
 
 		 715 aa  45.8  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.37344  normal  0.185198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9017  glycoside hydrolase  30.51 
 
 		 639 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0995  glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.97 
 
 		 800 aa  45.4  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.690706  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3141  Glucan 1,4-alpha-glucosidase  31.65 
 
 		 761 aa  45.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.136567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1555  glycoside hydrolase 15-related protein  29.95 
 
 		 645 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.541945 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3494  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.34 
 
 		 803 aa  45.1  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2590  glucan 1,4-alpha-glucosidase  29.94 
 
 		 802 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.767497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3593  hypothetical protein  40.45 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0130  glycoside hydrolase 15-related  29.08 
 
 		 636 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322371  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2156  glycoside hydrolase 15-related  26.45 
 
 		 624 aa  43.1  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.168386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>