152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1181 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
478 aa  953    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  50.21 
 
 
499 aa  490  1e-137  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  51.97 
 
 
499 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.22 
 
 
262 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  27.87 
 
 
569 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24 
 
 
307 aa  81.6  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.06 
 
 
312 aa  81.3  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.16 
 
 
558 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0752  hypothetical protein  25.18 
 
 
268 aa  75.9  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0829  hypothetical protein  24.82 
 
 
268 aa  72.8  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  26.74 
 
 
531 aa  70.5  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0869  hypothetical protein  24.21 
 
 
377 aa  70.1  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.543973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  28.68 
 
 
274 aa  70.1  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  24.41 
 
 
1967 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1685  hypothetical protein  27.24 
 
 
268 aa  67  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385005  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1331  hypothetical protein  26.26 
 
 
291 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0250532  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.7 
 
 
278 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2738  sulfatase  33.75 
 
 
427 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.15562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.46 
 
 
321 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  27.17 
 
 
274 aa  65.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3879  hypothetical protein  26.49 
 
 
287 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.31 
 
 
273 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  25.65 
 
 
350 aa  63.9  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07049  GPI ethanolamine phosphate transferase 1 (EC 2.-.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXD1]  22.91 
 
 
930 aa  62.4  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.350863  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1625  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.5 
 
 
431 aa  62.4  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.018842  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1367  phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  23.5 
 
 
431 aa  62  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37402  predicted protein  25.33 
 
 
890 aa  61.2  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.174724  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.87 
 
 
268 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  24.89 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  24.89 
 
 
433 aa  60.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.08 
 
 
456 aa  60.5  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.579511 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1028  hypothetical protein  24.64 
 
 
268 aa  60.5  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21940  hypothetical protein  27.1 
 
 
269 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000158953 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0368  type I phosphodiesterase  34.34 
 
 
437 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000500368  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.22 
 
 
519 aa  57.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.62 
 
 
629 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0438  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  34.34 
 
 
437 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_86507  major facilitator superfamily involved in the attachment of glycosylphosphatidylinositol (GPI) anchors to proteins  23.38 
 
 
901 aa  57.4  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0578339 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1605  hypothetical protein  25.19 
 
 
268 aa  57  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0824779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.07 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  25.2 
 
 
428 aa  56.2  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1708  sulfatase  35.25 
 
 
449 aa  56.6  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.57 
 
 
687 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.62 
 
 
268 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  21.49 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0508  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.07 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.350178  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4865  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.07 
 
 
437 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  33.33 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0361814  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0371  type I phosphodiesterase  33.33 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00015541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0394  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  33.33 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.143254  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  23.16 
 
 
641 aa  55.8  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.07 
 
 
437 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000352443  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1398  hypothetical protein  25.85 
 
 
261 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.975132  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000662  hypothetical protein  22.55 
 
 
274 aa  54.7  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.281992  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4487  hypothetical protein  26.14 
 
 
265 aa  54.7  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.954296  normal  0.620728 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.57 
 
 
280 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0374  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  19.83 
 
 
437 aa  54.3  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00616587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2459  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  48.39 
 
 
434 aa  53.9  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.94 
 
 
489 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0380  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  18.81 
 
 
437 aa  53.5  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000974575  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  27.78 
 
 
262 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06496  transferase (Gpi7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05260)  23.01 
 
 
847 aa  52.4  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000895802 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2266  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  31.34 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00280  phosphoglycerate mutase, putative  33.64 
 
 
532 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.04 
 
 
558 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3481  hypothetical protein  23.74 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3574  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.88 
 
 
426 aa  52.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1874  hypothetical protein  25.95 
 
 
269 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1587  phosphoglyceromutase  33.83 
 
 
522 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.264731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4617  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.14 
 
 
422 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0622  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate- independent  29.85 
 
 
507 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  20.2 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0333  metalloenzyme domain protein  26.75 
 
 
515 aa  51.6  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.134718  normal  0.059537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  22.12 
 
 
417 aa  51.2  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1627  sulfatase  30.28 
 
 
657 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  24.78 
 
 
422 aa  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0987  metalloenzyme domain-containing protein  33.33 
 
 
428 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28180  arylsulfatase A family protein  31.82 
 
 
480 aa  50.1  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0859  phosphonoacetate hydrolase  36.11 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00908421  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3720  Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  28.79 
 
 
434 aa  49.7  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.758068  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1904  phosphonoacetate hydrolase  36.11 
 
 
413 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0323955  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3900  sulfatase  31.86 
 
 
489 aa  49.7  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1762  phosphonoacetate hydrolase  36.11 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0171992  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2216  phosphonoacetate hydrolase  36.11 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00367205  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0491  phosphonoacetate hydrolase  36.11 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0900  phosphonoacetate hydrolase  36.11 
 
 
423 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00296594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5561  sulfatase  34.82 
 
 
797 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02580  phosphoethanolamine N-methyltransferase, putative  20.71 
 
 
1037 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2050  phosphonoacetate hydrolase  34.72 
 
 
413 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000305441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0585  sulfatase domain-containing protein  22.94 
 
 
614 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3820  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.24 
 
 
398 aa  48.5  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.965003  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66043  predicted protein  21.16 
 
 
1009 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3526  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.29 
 
 
455 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.34184  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1624  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.97 
 
 
416 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000105277 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.15 
 
 
279 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1630  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  26.03 
 
 
372 aa  48.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00347347  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0588  phosphonoacetate hydrolase  34.72 
 
 
423 aa  48.5  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00143624  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1492  phosphoglyceromutase  29.85 
 
 
522 aa  48.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  21.23 
 
 
400 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0329  sulfatase  23.42 
 
 
370 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>