77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3850 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3850  DoxX family protein  100 
 
 
149 aa  293  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3120  hypothetical protein  99.33 
 
 
149 aa  291  1e-78  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3466  DoxX family protein  49.32 
 
 
150 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3598  hypothetical protein  40 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3790  DoxX family protein  36.44 
 
 
181 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459957 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02099  putative membrane DoxD-like family protein  32.14 
 
 
151 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0678079  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02921  hypothetical protein  33.87 
 
 
190 aa  59.7  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2290  hypothetical protein  30.56 
 
 
144 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27070  hypothetical protein  29.86 
 
 
144 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814369  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02881  hypothetical protein  31.82 
 
 
186 aa  57.4  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1790  DoxX  37.7 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.146919  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02871  hypothetical protein  31.06 
 
 
186 aa  56.6  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.714602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0467  DoxX family protein  33.33 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1631  hypothetical protein  32 
 
 
177 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03431  hypothetical protein  32 
 
 
177 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0267  hypothetical protein  30.3 
 
 
186 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3022  DoxX family protein  28.89 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1174  DoxX family protein  29.13 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0907  DoxX family protein  32.12 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1376  DoxX family protein  31.67 
 
 
143 aa  53.5  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.813801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1755  DoxX family protein  31.94 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000356426 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1172  DoxX family protein  39.13 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1058  membrane protein  33.33 
 
 
172 aa  52  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.533713  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02981  hypothetical protein  30.89 
 
 
186 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.925648  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2328  DoxX family protein  32.79 
 
 
137 aa  51.2  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.380358 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1677  DoxX  30.95 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.14324  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0559  DoxX family protein  39.68 
 
 
159 aa  50.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.212401  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4623  DoxX family protein  32.52 
 
 
139 aa  50.4  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000208807  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1915  DoxX family protein  30.99 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0302074  hitchhiker  0.0000000000182197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2401  hypothetical protein  36.27 
 
 
156 aa  50.1  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.717688  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4019  DoxX  32.23 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.394883  normal  0.482629 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1774  DoxD-like family protein  29.13 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2441  DoxX family protein  28.17 
 
 
144 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.630068  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2313  DoxX family protein  30.99 
 
 
145 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332195  hitchhiker  0.000213237 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3679  DoxX  31.41 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.244445  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3658  DoxX family protein  33.59 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1426  hypothetical protein  31.85 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.165574 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4189  DoxX family protein  31.85 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2086  DoxX family protein  30.4 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1770  DoxD-like family protein  29.13 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3456  DoxX family protein  30.99 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000181472 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0614  DoxD-like family  29.85 
 
 
281 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3989  DoxX family protein  31.25 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00241422  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1539  DoxD family protein  29.1 
 
 
281 aa  45.8  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.636212  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15611  hypothetical protein  33.62 
 
 
183 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0237618  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1457  hypothetical protein  32.76 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2411  DoxX-like  34.19 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0456  DoxX family protein  31.2 
 
 
153 aa  45.1  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2112  DoxX family protein  32.52 
 
 
171 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.733626 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0957  membrane protein  33.05 
 
 
172 aa  45.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.699944  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0022  hypothetical protein  32.06 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1744499999999998e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0131  hypothetical protein  32.5 
 
 
185 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1491  DoxX family protein  31.4 
 
 
177 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.301803  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1425  DoxX family protein  32.79 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.305544  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0138  DoxX family protein  36.72 
 
 
147 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07631  hypothetical protein  32.2 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0159355 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15211  hypothetical protein  32.76 
 
 
188 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.869968  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1493  DoxX  30.58 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1515  DoxX family protein  30.58 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0667  DoxX family protein  32.82 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15461  hypothetical protein  32.76 
 
 
183 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.414315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0576  DoxX family protein  34.62 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.468844  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4592  DoxX family protein  32.52 
 
 
174 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2820  DoxX family protein  27.27 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4226  DoxX family protein  38.16 
 
 
173 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1273  DoxX  37.5 
 
 
150 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.346263  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1922  DoxX  28.03 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.439341  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3457  DoxX family protein  34.38 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3521  DoxX family protein  34.38 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34274  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0693  DoxX family protein  28.93 
 
 
138 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2867  DoxX family protein  29.93 
 
 
378 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0883  DoxX family protein  31.11 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0136  hypothetical protein  30.77 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.636829  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0183  DoxX family protein  26.27 
 
 
127 aa  40.4  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.313264  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1621  DoxX family protein  31.09 
 
 
138 aa  40.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000382951  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1803  integral membrane protein  26.45 
 
 
144 aa  40  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000242993  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4811  DoxX family protein  31.17 
 
 
161 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>