More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0139 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  100 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  99.34 
 
 		 304 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  96.05 
 
 		 304 aa  529  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  73.68 
 
 		 303 aa  452  1.0000000000000001e-126  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  71.88 
 
 		 306 aa  397  1e-109  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  67.87 
 
 		 303 aa  386  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  67.23 
 
 		 311 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  50.84 
 
 		 302 aa  292  4e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  49.83 
 
 		 306 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  51.75 
 
 		 317 aa  287  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  49.16 
 
 		 306 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  50.5 
 
 		 302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  47.83 
 
 		 306 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  47.32 
 
 		 305 aa  276  4e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  52.08 
 
 		 302 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  47.14 
 
 		 312 aa  262  6e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  48.64 
 
 		 315 aa  258  9e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  46.31 
 
 		 305 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  48.47 
 
 		 338 aa  256  3e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  48 
 
 		 300 aa  255  5e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  47.75 
 
 		 326 aa  255  7e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  45.97 
 
 		 324 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  47.73 
 
 		 306 aa  253  3e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  45.97 
 
 		 329 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  47.39 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  48.36 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  43.89 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  42.81 
 
 		 324 aa  246  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  47 
 
 		 302 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  46.67 
 
 		 302 aa  245  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  46.56 
 
 		 304 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  41.1 
 
 		 330 aa  242  7e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  41.78 
 
 		 324 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  42.52 
 
 		 334 aa  240  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  44.22 
 
 		 336 aa  239  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  48.56 
 
 		 307 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  43.25 
 
 		 311 aa  229  4e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  43.86 
 
 		 301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  40.35 
 
 		 282 aa  189  4e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  40 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  42.86 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  42.86 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  37.54 
 
 		 290 aa  177  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  38.73 
 
 		 282 aa  177  1e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  36.84 
 
 		 290 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  36.36 
 
 		 290 aa  172  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.22 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  38.08 
 
 		 282 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  38.08 
 
 		 282 aa  171  9e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  36.07 
 
 		 293 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  36.14 
 
 		 287 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  36.24 
 
 		 281 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  37.06 
 
 		 289 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  35.54 
 
 		 281 aa  169  6e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  34.33 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  37.54 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  36.27 
 
 		 280 aa  165  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  34.74 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  35.29 
 
 		 290 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  39.08 
 
 		 282 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  37.41 
 
 		 289 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  34 
 
 		 302 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  38.08 
 
 		 282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  34.74 
 
 		 290 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  36.59 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  34.51 
 
 		 280 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  38.03 
 
 		 301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  38.03 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  38.03 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  35.79 
 
 		 289 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.72 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  34.04 
 
 		 290 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  35.09 
 
 		 286 aa  161  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  32.91 
 
 		 326 aa  160  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  37.68 
 
 		 918 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  33.91 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  32.51 
 
 		 287 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  34.42 
 
 		 302 aa  156  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  33.33 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  35.13 
 
 		 290 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  32.01 
 
 		 341 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  32.88 
 
 		 291 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2469  thioredoxin  34.42 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.744001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2848  thioredoxin, putative  34.42 
 
 		 289 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.126765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0664  Thioredoxin domain protein  34.54 
 
 		 282 aa  149  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000362321  hitchhiker  0.00000255831 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  32.97 
 
 		 274 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  30.31 
 
 		 287 aa  146  5e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  33.68 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  32.98 
 
 		 286 aa  145  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  30.88 
 
 		 289 aa  143  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  33.33 
 
 		 318 aa  143  4e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1052  Thioredoxin domain protein  32.63 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.846317  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1331  putative thioredoxin  30.4 
 
 		 285 aa  142  7e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1307  thioredoxin  31.94 
 
 		 286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.334323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  36.33 
 
 		 337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  34.97 
 
 		 280 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  32.76 
 
 		 286 aa  140  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1374  thioredoxin  31.23 
 
 		 286 aa  139  3.9999999999999997e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>