More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2943 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2943  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 232 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.723084  normal  0.121071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1083  two component transcriptional regulator  79.4 
 
 		 233 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2746  two component transcriptional regulator  79.4 
 
 		 233 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.396444  normal  0.898138 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0655  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 242 aa  175  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.379452 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3025  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 270 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3029  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 238 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6320  two component transcriptional regulator  38.63 
 
 		 239 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.506454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65880  putative two-component response regulator  39.24 
 
 		 244 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0780512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3219  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.699117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2473  two component transcriptional regulator  37.39 
 
 		 251 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.682013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5717  putative two-component response regulator  38.82 
 
 		 245 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6216  two component transcriptional regulator  36.68 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1282  two component transcriptional regulator  35.84 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2033  two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  151  7e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.649752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3772  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3045  two component transcriptional regulator  39.11 
 
 		 232 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2983  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000906081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3286  two component transcriptional regulator  37.28 
 
 		 239 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0994211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6165  two component transcriptional regulator, winged helix family  40 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.362427  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1874  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2176  two component transcriptional regulator  37.45 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2107  two-component response regulator  36.8 
 
 		 245 aa  149  3e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3730  winged helix family two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 238 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1375  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  35.65 
 
 		 236 aa  149  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1511  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 250 aa  149  4e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.030435  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 240 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4123  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 242 aa  148  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4597  osmolarity response regulator  38.26 
 
 		 240 aa  147  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0545  two component transcriptional regulator  36.21 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2803  DNA-binding transcriptional regulator TorR  38.14 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131566 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0079  transcriptional regulatory protein  36.36 
 
 		 245 aa  146  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.747625  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1278  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.07 
 
 		 239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3772  response regulator receiver  37.99 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0950932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4066  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.99 
 
 		 241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4089  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.68 
 
 		 240 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.404092  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0373  two component transcriptional regulator  38.86 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.873901 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3439  two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 239 aa  146  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5286  two component transcriptional regulator  34.98 
 
 		 240 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.498861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0359  osmolarity response regulator  38.7 
 
 		 245 aa  145  6e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5813  two component transcriptional regulator  38.79 
 
 		 253 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548874 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3646  two component transcriptional regulator  37.23 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1813  two component transcriptional regulator, winged helix family  37 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.106078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2155  two component transcriptional regulator  38.39 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102637  normal  0.128892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1374  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.39 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287257  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4027  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.55 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.886848  normal  0.528233 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2473  DNA-binding response regulator  34.93 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1290  DNA-binding response regulator  37.5 
 
 		 245 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05120  osmolarity response regulator  38.1 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0852  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0805  two component transcriptional regulator  39.13 
 
 		 229 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03947  osmolarity response regulator  38.26 
 
 		 240 aa  142  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2546  osmolarity response regulator  38.36 
 
 		 245 aa  142  3e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3403  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3566  two component transcriptional regulator  39.06 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.291783  normal  0.121657 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2179  two component transcriptional regulator  35.5 
 
 		 262 aa  142  4e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.134486  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0200  two component transcriptional regulator  36.09 
 
 		 243 aa  142  5e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6199  OmpR family two component response transcriptional regulator  37.28 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.59766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1150  DNA-binding transcriptional regulator TorR  37.82 
 
 		 236 aa  142  6e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.202106 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  37.82 
 
 		 236 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2423  two component transcriptional regulator  37.18 
 
 		 240 aa  141  7e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3356  DNA-binding transcriptional regulator TorR  37.82 
 
 		 236 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3217  DNA-binding transcriptional regulator TorR  37.82 
 
 		 236 aa  142  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0562  two-component response regulator  32.33 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2052  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 242 aa  141  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.293024  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0225  osmolarity response regulator  36.68 
 
 		 240 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1895  osmolarity response regulator  38.7 
 
 		 244 aa  141  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0546897 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1961  two component transcriptional regulator  35.37 
 
 		 240 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.326957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4949  two-component response regulator  32.33 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2582  osmolarity response regulator  37.83 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.121294  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  39.57 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1111  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  37.07 
 
 		 245 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.53214 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5944  osmolarity response regulator  38.6 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2589  two component transcriptional regulator  37.34 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.521157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0815  two-component response regulator  32.03 
 
 		 239 aa  139  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000717024  decreased coverage  0.00000744043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0758  two component transcriptional regulator  35.34 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.885545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2852  osmolarity response regulator  38.26 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0218  osmolarity response regulator  36.96 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68700  osmolarity response regulator  38.6 
 
 		 247 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3510  osmolarity response regulator  38.1 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4956  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.211871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0772  DNA-binding response regulator  34.78 
 
 		 243 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4849  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0271183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3762  two-component response regulator  32.03 
 
 		 239 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0487627  decreased coverage  0.0000265862 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C5008  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.80206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  37.72 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2713  osmolarity response regulator  37.93 
 
 		 245 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394419  normal  0.0259821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5012  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0537303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4922  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000490343  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3596  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.9 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.895542  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4637  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0297029  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4952  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.198521  normal  0.89803 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4654  two component transcriptional regulator  34.91 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.651298 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0533  two-component response regulator  32.03 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5000  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3655  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5916  two-component response regulator  31.9 
 
 		 238 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.284367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0983  DNA-binding transcriptional regulator TorR  38.75 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.291581 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>