47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2686 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  100 
 
 		 173 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  55.32 
 
 		 151 aa  151  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  59.66 
 
 		 146 aa  150  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  60.8 
 
 		 146 aa  149  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  51.7 
 
 		 151 aa  144  4.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  59.5 
 
 		 187 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  54.1 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  54.1 
 
 		 152 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  51.03 
 
 		 144 aa  140  9e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  57.85 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  52.07 
 
 		 163 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  50 
 
 		 147 aa  134  6.0000000000000005e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  51.69 
 
 		 146 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  54.24 
 
 		 144 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  52.34 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  51.26 
 
 		 146 aa  127  5.0000000000000004e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  51.26 
 
 		 168 aa  128  5.0000000000000004e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  48.18 
 
 		 147 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  49.66 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  44.68 
 
 		 150 aa  124  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  56.7 
 
 		 141 aa  123  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  52.94 
 
 		 157 aa  122  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  52.54 
 
 		 146 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  51.2 
 
 		 148 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  51.75 
 
 		 143 aa  118  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  42.48 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  44.53 
 
 		 152 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  42.45 
 
 		 152 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  45.07 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  54.9 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  51.09 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  37.19 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  32.5 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  35.54 
 
 		 119 aa  50.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  30.28 
 
 		 255 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  28.18 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  28.12 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  26.92 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  33.7 
 
 		 347 aa  43.5  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  29.21 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  27.13 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  33.33 
 
 		 126 aa  42.4  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  27.84 
 
 		 209 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  33.33 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  29.35 
 
 		 136 aa  41.2  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  33.33 
 
 		 119 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  28.87 
 
 		 160 aa  41.2  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>