More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2433 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2433  oxidoreductase domain-containing protein  100 
 
 
341 aa  669    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.116249 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2174  oxidoreductase domain-containing protein  84.16 
 
 
341 aa  528  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193543  decreased coverage  0.00937505 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0522  putative oxidoreductase  83.87 
 
 
341 aa  509  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5577  oxidoreductase domain protein  60.06 
 
 
342 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.275125 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3885  oxidoreductase domain-containing protein  61.19 
 
 
341 aa  367  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.037176  normal  0.810555 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2785  oxidoreductase-like  58.7 
 
 
348 aa  353  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2535  oxidoreductase domain protein  52.47 
 
 
333 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000664622 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1686  oxidoreductase domain protein  53.27 
 
 
333 aa  340  2e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1063  oxidoreductase-like protein  55.66 
 
 
337 aa  309  5e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1122  oxidoreductase domain protein  55.66 
 
 
337 aa  307  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.11444  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1191  oxidoreductase domain protein  55.66 
 
 
337 aa  308  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.662876  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3219  oxidoreductase domain-containing protein  56.25 
 
 
338 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3206  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 
369 aa  131  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0446  oxidoreductase domain protein  29.81 
 
 
364 aa  119  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1074  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3684  oxidoreductase domain-containing protein  30.32 
 
 
367 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  30 
 
 
353 aa  107  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1569  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
374 aa  106  6e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2159  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 
351 aa  105  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.473931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3572  oxidoreductase domain-containing protein  37.3 
 
 
359 aa  103  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.573102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1365  oxidoreductase domain-containing protein  37.84 
 
 
355 aa  102  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0344  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
347 aa  102  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1925  oxidoreductase domain protein  31.14 
 
 
340 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2951  oxidoreductase domain protein  29.79 
 
 
359 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1190  oxidoreductase domain-containing protein  29.44 
 
 
356 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1960  gfo/idh/mocA family protein  27.78 
 
 
351 aa  100  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.430175  normal  0.910454 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0817  oxidoreductase domain-containing protein  31.98 
 
 
358 aa  100  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01292  predicted oxidoreductase, NADH-binding  27.78 
 
 
351 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2331  oxidoreductase domain protein  27.78 
 
 
351 aa  99  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.318532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2310  oxidoreductase domain-containing protein  27.78 
 
 
351 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01303  hypothetical protein  27.78 
 
 
351 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1430  gfo/idh/mocA family protein  27.78 
 
 
351 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1525  gfo/idh/mocA family protein  27.78 
 
 
351 aa  99  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1807  gfo/idh/mocA family protein  27.78 
 
 
347 aa  99  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0431  oxidoreductase domain-containing protein  28.47 
 
 
377 aa  97.8  2e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4124  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
369 aa  96.7  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3350  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 
383 aa  96.3  7e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.564289  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24600  predicted dehydrogenase  30.2 
 
 
366 aa  96.3  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.178343  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0425  oxidoreductase domain protein  32.86 
 
 
369 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1808  oxidoreductase domain protein  31.96 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1537  oxidoreductase domain protein  27.61 
 
 
356 aa  94.4  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2154  oxidoreductase domain protein  26.48 
 
 
347 aa  94  3e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.273291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3383  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
342 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2269  oxidoreductase domain protein  30.24 
 
 
354 aa  92.8  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.416383  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3364  oxidoreductase domain protein  31.73 
 
 
366 aa  92.8  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.310163  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1529  oxidoreductase domain protein  25.87 
 
 
348 aa  91.3  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3315  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0394409 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1190  oxidoreductase domain-containing protein  27.57 
 
 
371 aa  90.5  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0186482  hitchhiker  0.000025969 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2967  oxidoreductase domain protein  30.77 
 
 
353 aa  90.1  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4172  oxidoreductase domain-containing protein  27.83 
 
 
451 aa  89.7  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2681  oxidoreductase domain-containing protein  34.96 
 
 
349 aa  89.4  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5816  oxidoreductase domain protein  29.89 
 
 
397 aa  89.4  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.510371  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0978  oxidoreductase domain-containing protein  29.38 
 
 
378 aa  89.4  8e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  28.67 
 
 
388 aa  89.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4668  oxidoreductase domain protein  25.65 
 
 
357 aa  89  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0217  oxidoreductase domain protein  30.19 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2424  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 
342 aa  89  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.865581  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1156  oxidoreductase domain protein  29.02 
 
 
396 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.741439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1851  oxidoreductase domain protein  31.66 
 
 
355 aa  87.8  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2653  oxidoreductase domain protein  32.5 
 
 
330 aa  86.7  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.150642  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2125  oxidoreductase domain protein  34.4 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0009  oxidoreductase domain protein  27.64 
 
 
355 aa  86.3  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  27.22 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0406  oxidoreductase domain protein  30.89 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1780  oxidoreductase domain-containing protein  29.11 
 
 
360 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3335  oxidoreductase domain-containing protein  30.81 
 
 
429 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0558  oxidoreductase domain protein  24.54 
 
 
359 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2320  inositol 2-dehydrogenase  31.42 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3282  oxidoreductase domain-containing protein  34.83 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1242  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.225329  normal  0.0194042 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03130  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 
366 aa  82.4  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.835174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00390  predicted dehydrogenase  30.52 
 
 
344 aa  82  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  35.64 
 
 
380 aa  82  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05984  NAD binding Rossmann fold oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G10240)  29.81 
 
 
355 aa  81.3  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0766488 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1577  oxidoreductase domain protein  35.58 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06820  conserved hypothetical protein  28.06 
 
 
366 aa  81.6  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2325  oxidoreductase domain-containing protein  27.91 
 
 
327 aa  81.3  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.144088  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2066  oxidoreductase-like  31.82 
 
 
358 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0142  oxidoreductase-like  31.09 
 
 
348 aa  81.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1263  oxidoreductase domain protein  28.25 
 
 
348 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.616753  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1073  oxidoreductase domain-containing protein  27.14 
 
 
362 aa  80.5  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4502  oxidoreductase domain protein  29.87 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2339  oxidoreductase domain-containing protein  28.93 
 
 
344 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.445673 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06850  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 
361 aa  79.7  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0423295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4438  oxidoreductase domain protein  28.41 
 
 
401 aa  79.7  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0434  oxidoreductase domain-containing protein  31.94 
 
 
356 aa  79.7  0.00000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3041  oxidoreductase-like  25.71 
 
 
350 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1704  oxidoreductase domain-containing protein  32.67 
 
 
344 aa  79.3  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4052  oxidoreductase domain protein  26.72 
 
 
383 aa  79.3  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1138  myo-inositol 2-dehydrogenase  25.11 
 
 
312 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0639  oxidoreductase domain protein  28.27 
 
 
321 aa  79  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.215253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0790  oxidoreductase domain protein  33.19 
 
 
467 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0510551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2603  oxidoreductase domain protein  31.25 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0779  oxidoreductase domain protein  33.63 
 
 
335 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0607814 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2602  oxidoreductase domain protein  34.08 
 
 
334 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  31.6 
 
 
369 aa  78.2  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2513  oxidoreductase domain-containing protein  33.52 
 
 
399 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.591176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1423  oxidoreductase-like  28.92 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000181743  normal  0.713997 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1660  oxidoreductase domain protein  38.36 
 
 
346 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.278393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0615  oxidoreductase domain-containing protein  23.91 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.537783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>