165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1483 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1483  phosphatidylglycerophosphatase A  100 
 
 		 165 aa  321  2e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1461  phosphatidylglycerophosphatase A  85.45 
 
 		 165 aa  266  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.150858  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2834  putative phosphatidylglycerophosphatase A  84.24 
 
 		 165 aa  245  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1365  phosphatidylglycerophosphatase  49.67 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.695464  normal  0.742084 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2234  phosphatidylglycerophosphatase  50.94 
 
 		 161 aa  136  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1578  putative phosphatidylglycerophosphatase A  49.69 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0267471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3666  phosphatidylglycerophosphatase A  47.06 
 
 		 166 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1710  phosphatidylglycerophosphatase A  38.89 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0994  phosphatidylglycerophosphatase A  37.91 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0405  phosphatidylglycerophosphatase A  39.31 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1730  phosphatidylglycerophosphatase A  36.9 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2142  phosphatidylglycerophosphatase  37.5 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11950  phosphatidylglycerophosphatase  32.65 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000545487  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0176  phosphatidylglycerophosphatase A  41.29 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0857853 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2395  phosphatidylglycerophosphatase A  35.98 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1910  phosphatidylglycerophosphatase A  41.22 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40182  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01172  phosphatidylglycerophosphatase A  34.38 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0905  phosphatidylglycerophosphatase A  32.03 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1687  phosphatidylglycerophosphatase A  33.79 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.997135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0199  phosphatidylglycerophosphatase A  34.9 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3133  phosphatidylglycerophosphatase A  36.42 
 
 		 166 aa  69.7  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.648626  normal  0.707275 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1964  phosphatidylglycerophosphatase A  34.01 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  39.13 
 
 		 164 aa  68.2  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1464  phosphatidylglycerophosphatase A  36.42 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1782  phosphatidylglycerophosphatase A  34.01 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2282  phosphatidylglycerophosphatase A  37.66 
 
 		 207 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0131844 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004259  phosphatidylglycerophosphatase A  33.74 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.348305  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1597  phosphatidylglycerophosphatase A  34.01 
 
 		 166 aa  67  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2223  phosphatidylglycerophosphatase A  37.32 
 
 		 158 aa  67  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1827  phosphatidylglycerophosphatase A  34.97 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.712757 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1661  phosphatidylglycerophosphatase A  31.03 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000848394  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0670  phosphatidylglycerophosphatase  32.45 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.470142  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0645  phosphatidylglycerophosphatase A  32.11 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.162264  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1490  phosphatidylglycerophosphatase A  37.24 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2413  phosphatidylglycerophosphatase A  33.54 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0130875  normal  0.238987 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3167  phosphatidylglycerophosphatase A  32.89 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0566  phosphatidylglycerophosphatase A  37.18 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3254  phosphatidylglycerophosphatase A  32.89 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.021985  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0555  phosphatidylglycerophosphatase A  37.18 
 
 		 167 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3113  phosphatidylglycerophosphatase A  32.89 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0641  phosphatidylglycerophosphatase  36.14 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0520  phosphatidylglycerophosphatase A  37.18 
 
 		 167 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1022  phosphatidylglycerophosphatase  38.78 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.438058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5013  phosphatidylglycerophosphatase  37.25 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0242  phosphatidylglycerophosphatase A  33.11 
 
 		 163 aa  61.2  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0573  phosphatidylglycerophosphatase A  35.9 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1317  phosphatidylglycerophosphatase  36.05 
 
 		 162 aa  60.8  0.000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0605  phosphatidylglycerophosphatase  31.58 
 
 		 168 aa  60.8  0.000000009  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.11714  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0795  phosphatidylglycerophosphatase A  32.64 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0766  phosphatidylglycerophosphatase A  31.94 
 
 		 160 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3851  phosphatidylglycerophosphatase  37.25 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.990071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0014  phosphatidylglycerophosphatase A  36.24 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2072  phosphatidylglycerophosphatase  34.87 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0848  phosphatidylglycerophosphatase  35.33 
 
 		 174 aa  58.9  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.723724  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1051  phosphatidylglycerophosphatase A  34.9 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1678  Phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.98152 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11470  phosphatidylglycerophosphatase A  34.9 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.200521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2401  phosphatidylglycerophosphatase A  30.7 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.235781  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0292  phosphatidylglycerophosphatase A  32.08 
 
 		 169 aa  57.8  0.00000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0833  phosphatidylglycerophosphatase  30.52 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000936686  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1418  phosphatidylglycerophosphatase A  35.67 
 
 		 152 aa  57.4  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1076  phosphatidylglycerophosphatase A  33.77 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3463  phosphatidylglycerophosphatase A  34.16 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06780  Phosphatidylglycerophosphatase A  35.06 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.47557  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1582  phosphatidylglycerophosphatase A  34.64 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.693216 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0497  phosphatidylglycerophosphatase A  34.48 
 
 		 156 aa  57  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0530  phosphatidylglycerophosphatase A  30.07 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0597  phosphatidylglycerophosphatase A  31.47 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499318  normal  0.310706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1265  phosphatidylglycerophosphatase A  33.55 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0127281  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1170  phosphatidylglycerophosphatase A  30.46 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1193  phosphatidylglycerophosphatase  37.58 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3744  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_002978  WD0730  phosphatidylglycerophosphatase A, putative  30 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0514338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0560  phosphatidylglycerophosphatase A  35.44 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.848912  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0572  phosphatidylglycerophosphatase  36 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.235405 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0146  phosphatidylglycerophosphatase A  31.47 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0629  phosphatidylglycerophosphatase A  31.47 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00366  phosphatidylglycerophosphatase A  32.43 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.828756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3191  phosphatidylglycerophosphatase A  32.43 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3215  phosphatidylglycerophosphatase A  32.43 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000141914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00370  hypothetical protein  32.43 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.63417  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1168  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0307718  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0454  phosphatidylglycerophosphatase A  32.32 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01424  phosphatidylglycerophosphatase A  32.19 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.449557  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0339  phosphatidylglycerophosphatase A  32.43 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.775727  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0489  phosphatidylglycerophosphatase A  32.43 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0449  phosphatidylglycerophosphatase A  32.43 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1029  phosphatidylglycerophosphatase A  33.33 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2580  phosphatidylglycerophosphatase  32.21 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1102  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0161628  normal  0.229912 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0500  phosphatidylglycerophosphatase A  32.32 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1279  phosphatidylglycerophosphatase  35.37 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0214485  unclonable  0.000000000064326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0805  phosphatidylglycerophosphatase A  32.21 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1102  phosphatidylglycerophosphatase  33.33 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0459736  normal  0.578587 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0928  phosphatidylglycerophosphatase A  30.92 
 
 		 167 aa  53.1  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0554  phosphatidylglycerophosphatase A  29.37 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0461  phosphatidylglycerophosphatase A  31.76 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3711  phosphatidylglycerophosphatase  29.37 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.741553  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0606  phosphatidylglycerophosphatase A  36.65 
 
 		 180 aa  53.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0863361  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0467  phosphatidylglycerophosphatase A  31.08 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>