More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3407 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0355  6-phosphofructokinase  83 
 
 
403 aa  692    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0054  phosphofructokinase  80 
 
 
402 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3407  6-phosphofructokinase  100 
 
 
404 aa  831    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0362  6-phosphofructokinase  76.98 
 
 
404 aa  644    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0041  6-phosphofructokinase  78.25 
 
 
404 aa  661    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.659514 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3557  6-phosphofructokinase  77.17 
 
 
406 aa  644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.792982  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1917  6-phosphofructokinase  66.91 
 
 
405 aa  560  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.010308  normal  0.94852 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3467  6-phosphofructokinase  45.5 
 
 
388 aa  312  6.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0347  6-phosphofructokinase  41.62 
 
 
415 aa  276  5e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000366711  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2223  6-phosphofructokinase  41.94 
 
 
415 aa  262  1e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000155584  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1767  phosphofructokinase  36.65 
 
 
407 aa  262  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1824  6-phosphofructokinase  41.83 
 
 
415 aa  256  4e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1401  6-phosphofructokinase  38.8 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.810197  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1671  6-phosphofructokinase  39.44 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.049134  normal  0.496528 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0679  phosphofructokinase  39.21 
 
 
404 aa  250  3e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1362  6-phosphofructokinase  35.45 
 
 
420 aa  239  8e-62  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1422  6-phosphofructokinase  35.45 
 
 
420 aa  238  1e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1877  6-phosphofructokinase  35.66 
 
 
414 aa  237  3e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2613  phosphofructokinase  35.25 
 
 
403 aa  236  7e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1888  6-phosphofructokinase  35.42 
 
 
414 aa  234  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3345  phosphofructokinase  38.93 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000105708  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3204  6-phosphofructokinase  36.45 
 
 
419 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.160372  normal  0.92885 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0971  6-phosphofructokinase  37.44 
 
 
414 aa  231  2e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00735846  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1234  6-phosphofructokinase  39.39 
 
 
409 aa  229  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02589  6-phosphofructokinase  38.21 
 
 
418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2846  6-phosphofructokinase  35.29 
 
 
421 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.583434  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0239  6-phosphofructokinase  36.02 
 
 
427 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3303  6-phosphofructokinase  37.56 
 
 
418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.707698 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0209  6-phosphofructokinase  35.78 
 
 
417 aa  216  4e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.439475  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0740  6-phosphofructokinase  34.46 
 
 
419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00564855  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2776  6-phosphofructokinase  35.42 
 
 
420 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1446  6-phosphofructokinase  34.27 
 
 
400 aa  212  7e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0430978  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1718  6-phosphofructokinase  34.02 
 
 
400 aa  212  1e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.841415  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1251  6-phosphofructokinase  34.86 
 
 
420 aa  210  3e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0440  6-phosphofructokinase  37.59 
 
 
421 aa  209  7e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.8095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1502  6-phosphofructokinase  34.94 
 
 
418 aa  206  4e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.746381  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0806  phosphofructokinase  37.53 
 
 
394 aa  206  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2402  6-phosphofructokinase  33.57 
 
 
420 aa  206  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911717  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1534  6-phosphofructokinase  34.12 
 
 
419 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0357  phosphofructokinase  34.03 
 
 
447 aa  196  5.000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2735  phosphofructokinase  34.87 
 
 
404 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1550  phosphofructokinase  36.27 
 
 
422 aa  192  9e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0356  phosphofructokinase  29.91 
 
 
460 aa  186  5e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.771355  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3211  6-phosphofructokinase  36.01 
 
 
417 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0085  phosphofructokinase  32.85 
 
 
421 aa  181  2e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1583  6-phosphofructokinase  30.95 
 
 
424 aa  177  3e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0282  6-phosphofructokinase  34.13 
 
 
419 aa  171  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.483435  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0935  6-phosphofructokinase  32.2 
 
 
429 aa  169  7e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00814125 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1858  phosphofructokinase  35.34 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000203612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2588  6-phosphofructokinase  30.97 
 
 
378 aa  161  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.276959  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2318  6-phosphofructokinase  33.99 
 
 
422 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107599  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2633  6-phosphofructokinase  29.5 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1588  phosphofructokinase  32.53 
 
 
406 aa  143  6e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3234  6-phosphofructokinase  29.48 
 
 
343 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.179377  normal  0.0307534 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24790  6-phosphofructokinase  29.63 
 
 
342 aa  100  6e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.586564  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6053  6-phosphofructokinase  28.65 
 
 
342 aa  100  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.554738  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1832  6-phosphofructokinase  28.52 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.204219  normal  0.185841 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3085  6-phosphofructokinase  29.78 
 
 
341 aa  97.8  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1385  Diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.03 
 
 
346 aa  97.8  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2082  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  27.96 
 
 
349 aa  96.7  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1394  6-phosphofructokinase  29.72 
 
 
346 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350252  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1228  6-phosphofructokinase  25.84 
 
 
340 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.863123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3497  6-phosphofructokinase  28.77 
 
 
342 aa  94  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.947912  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3267  6-phosphofructokinase  28.77 
 
 
342 aa  94  5e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.630401  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3003  6-phosphofructokinase  26.61 
 
 
341 aa  93.6  6e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.113043  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2111  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.78 
 
 
444 aa  93.2  8e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000788263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2799  6-phosphofructokinase  29.5 
 
 
440 aa  92.4  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3043  phosphofructokinase  29.56 
 
 
341 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000111213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2426  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  28.1 
 
 
445 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618886  normal  0.364396 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2909  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30.36 
 
 
404 aa  90.9  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1037  6-phosphofructokinase  27.59 
 
 
341 aa  90.9  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2958  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.37 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1961  6-phosphofructokinase  26.17 
 
 
341 aa  89.7  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1326  phosphofructokinase  28.82 
 
 
341 aa  89.7  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  0.0388788 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1738  6-phosphofructokinase  29 
 
 
360 aa  89  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3319  phosphofructokinase  28.36 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2755  Diphosphate--fructose-6-phosphate1- phosphotransf erase  30 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1514  6-phosphofructokinase  24.79 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13025  6-phosphofructokinase  27.7 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.321975  normal  0.690613 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3121  phosphofructokinase  29.07 
 
 
341 aa  87.4  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0062  6-phosphofructokinase  28.22 
 
 
344 aa  87  5e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.970858  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1423  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  25.15 
 
 
435 aa  86.7  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.937372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4274  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.74 
 
 
461 aa  86.7  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20200  pyrophosphate-dependent phosphofructokinase  25.45 
 
 
341 aa  86.7  7e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.732763  normal  0.227707 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2843  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  26.69 
 
 
445 aa  86.3  8e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2657  diphosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  27.67 
 
 
429 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1116  6-phosphofructokinase  25.54 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17370  6-phosphofructokinase  26.93 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4245  6-phosphofructokinase  26.59 
 
 
343 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.241493  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2715  6-phosphofructokinase  25.55 
 
 
341 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000377285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11020  6-phosphofructokinase  25.41 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2609  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  30 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619674  normal  0.779768 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2871  phosphofructokinase  26.74 
 
 
345 aa  84.3  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1832  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  24.62 
 
 
418 aa  83.6  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0461281  normal  0.561309 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1794  6-phosphofructokinase  27.05 
 
 
342 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0860  6-phosphofructokinase  27.91 
 
 
365 aa  83.2  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000113477  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2681  phosphofructokinase  25.59 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1234  phosphofructokinase  26.83 
 
 
368 aa  82.8  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661938  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2869  pyrophosphate--fructose-6-phosphate 1-phosphotransferase  29.43 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3237  phosphofructokinase  25.07 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>