120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3513 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3513  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.673151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4587  17 kDa surface antigen  100 
 
 		 241 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0957  17 kDa surface antigen  69.48 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.20991  normal  0.0647122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0892  17 kDa surface antigen  67.6 
 
 		 247 aa  251  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0492614 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1027  hypothetical protein  68.65 
 
 		 250 aa  222  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.58697  normal  0.732235 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7185  17 kDa surface antigen  45.97 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000025224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4766  17 kDa surface antigen  48.07 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000649517  hitchhiker  0.00211864 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1033  17 kDa surface antigen  45.53 
 
 		 234 aa  104  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.244609 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1560  hypothetical protein  38.98 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.24397  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3565  17 kDa surface antigen  46.15 
 
 		 225 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.221572 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1151  17 kDa surface antigen  39.57 
 
 		 240 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.588305  normal  0.100298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2572  17 kDa surface antigen  51.64 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0400083  normal  0.0109742 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0223  17 kDa surface antigen  64.81 
 
 		 269 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0152  17 kDa surface antigen  51.39 
 
 		 294 aa  72  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5451  17 kDa surface antigen  32.2 
 
 		 206 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.349423  normal  0.317102 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4902  17 kDa surface antigen  31.03 
 
 		 204 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.336046 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1451  17 kDa surface antigen  50 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.715937 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0170  17 kDa surface antigen  51.39 
 
 		 280 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0398625  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1003  17 kDa surface antigen  36.96 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0918  17 kDa surface antigen  36.96 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1882  hypothetical protein  49.52 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.899605  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0228  hypothetical protein  32.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.557986  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0957  SlyB protein  32.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1411  surface antigen family protein  32.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.895937  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1607  surface antigen family protein  32.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.962323  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2673  surface antigen family protein  32.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.110868  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2531  surface antigen family protein  32.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0265  surface antigen family protein  32.72 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5234  17 kDa surface antigen  29.22 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5625  17 kDa surface antigen  29.22 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220709  normal  0.0159802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3223  17 kDa surface antigen  28.71 
 
 		 272 aa  67  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.866673  normal  0.25243 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0066  outer membrane lipoprotein  36.21 
 
 		 216 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0175  17 kDa surface antigen  48.61 
 
 		 274 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0511  hypothetical protein  33.96 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4605  17 kDa surface antigen  36.21 
 
 		 216 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.109506  hitchhiker  0.000338876 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5425  outer membrane lipoprotein  53.77 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.83639  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5958  17 kDa surface antigen  52.78 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2119  17 kDa surface antigen  52.78 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2156  17 kDa surface antigen  52.78 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.66952  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2137  17 kDa surface antigen  52.78 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41636 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2029  17 kDa surface antigen  52.78 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1300  17 kDa surface antigen  45.05 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.843728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1330  17 kDa surface antigen  39.26 
 
 		 185 aa  62  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.841601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1701  hypothetical protein  51.39 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.13374  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2725  hypothetical protein  51.39 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3462  17 kDa surface antigen  32.67 
 
 		 259 aa  61.2  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2209  hypothetical protein  51.39 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2656  17 kDa surface antigen  38.14 
 
 		 173 aa  61.6  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.128557  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3110  hypothetical protein  51.39 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2592  surface antigen family protein  51.39 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2647  surface antigen family protein  51.39 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1481  hypothetical protein  51.39 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.285878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1189  17 kDa surface antigen  42.06 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.476114  normal  0.804966 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0501  17 kDa surface antigen  38.14 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.38892  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2792  putative outer membrane lipoprotein transmembrane  31.67 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00797712  normal  0.981386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3177  17 kDa surface antigen  38.97 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0840  17 kDa surface antigen  33.12 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0572265 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0169  hypothetical protein  52.7 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0769  17 kDa surface antigen  38.05 
 
 		 163 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.529266  normal  0.0236925 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0849  17 kDa surface antigen  41.82 
 
 		 172 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1769  outer membrane lipoprotein Pcp  40.35 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000141648  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2558  outer membrane lipoprotein Pcp  40.35 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000494181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1877  17 kDa surface antigen  40.35 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000817006  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1308  17 kDa surface antigen  35.63 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0899  outer membrane lipoprotein transmembrane  37.17 
 
 		 167 aa  52.8  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00272241  normal  0.678128 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2871  17 kDa surface antigen-like protein  41.54 
 
 		 155 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000441534  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0470  17 kDa surface antigen  39.73 
 
 		 150 aa  52.4  0.000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000215158  normal  0.945637 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1542  outer membrane lipoprotein pcp  36.43 
 
 		 155 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.318649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1729  outer membrane lipoprotein pcp  36.43 
 
 		 155 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0331047  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1898  outer membrane lipoprotein pcp  36.43 
 
 		 155 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.470796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1555  outer membrane lipoprotein pcp  36.43 
 
 		 155 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.949838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1615  outer membrane lipoprotein pcp  36.43 
 
 		 155 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.397211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2528  17 kDa surface antigen  30.28 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000371225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2016  hypothetical protein  45.28 
 
 		 179 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246184 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1838  17 kDa surface antigen  27.69 
 
 		 164 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000536943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01611  outer membrane lipoprotein  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1999  17 kDa surface antigen  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00005432  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1717  outer membrane lipoprotein SlyB  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.535204  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1851  outer membrane lipoprotein SlyB  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000135134  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1988  17 kDa surface antigen  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.636223  hitchhiker  0.00129397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1558  outer membrane lipoprotein SlyB  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2353  outer membrane lipoprotein SlyB  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00612536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01601  hypothetical protein  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1833  outer membrane lipoprotein SlyB  36.43 
 
 		 155 aa  49.3  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.520508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1807  17 kDa surface antigen  37.1 
 
 		 155 aa  49.3  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55882  hitchhiker  0.000926812 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2468  17 kDa surface antigen  33.86 
 
 		 156 aa  48.9  0.00007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000341658  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1890  17 kDa surface antigen  31.78 
 
 		 158 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.219648  hitchhiker  0.0000108744 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3439  17 kDa surface antigen  37.97 
 
 		 166 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.976253  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1927  hypothetical protein  56.1 
 
 		 178 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.339305  hitchhiker  0.00184616 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0151  hypothetical protein  36.96 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0134  17 kDa surface antigen  59.46 
 
 		 257 aa  48.5  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.227874  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01106  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2537  17 kDa surface antigen  43.4 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.014281  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1973  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.126955  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2157  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000013622 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1233  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1232  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0260587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2491  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000075989 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2213  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1311  hypothetical protein  43.4 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000260311 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>