57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3193 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3193  Sporulation domain protein  100 
 
 		 545 aa  1068    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302036  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2794  sporulation related  58.93 
 
 		 535 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0614082  normal  0.0412667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2749  proline-rich region  57.78 
 
 		 505 aa  478  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.174945  normal  0.312279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1759  sporulation related  46.36 
 
 		 481 aa  334  3e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1806  proline-rich protein  43.03 
 
 		 470 aa  305  2.0000000000000002e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.321143  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2509  sporulation related  60.06 
 
 		 480 aa  300  4e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.218333 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4421  hypothetical protein  38.12 
 
 		 529 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.711547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4246  sporulation domain-containing protein  37.07 
 
 		 281 aa  149  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3588  Sporulation domain protein  30.51 
 
 		 474 aa  108  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.903239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3706  Sporulation domain protein  31.04 
 
 		 472 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0876978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3397  sporulation domain-containing protein  31.04 
 
 		 472 aa  96.7  9e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0891472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2350  sporulation domain-containing protein  29.44 
 
 		 993 aa  94  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.17698  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2674  hypothetical protein  31.27 
 
 		 911 aa  93.2  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0869  hypothetical protein  29.65 
 
 		 990 aa  91.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1159  sporulation domain-containing protein  26.78 
 
 		 966 aa  90.5  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_004310  BR0878  hypothetical protein  29.36 
 
 		 978 aa  89.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2179  Sporulation domain protein  29.91 
 
 		 468 aa  87.4  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89837  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0031  sporulation domain-containing protein  42.68 
 
 		 334 aa  81.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0817681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1681  Sporulation domain protein  41.18 
 
 		 1079 aa  78.2  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2481  sporulation domain-containing protein  30.77 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175577  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3023  sporulation domain-containing protein  43.53 
 
 		 276 aa  73.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.150433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1483  Sporulation domain protein  38.27 
 
 		 1108 aa  71.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.336559  normal  0.483391 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1778  hypothetical protein  35.79 
 
 		 356 aa  71.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2709  sporulation domain-containing protein  30.4 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40589 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1913  sporulation domain-containing protein  32.73 
 
 		 277 aa  67.4  0.0000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1812  sporulation related  41.77 
 
 		 727 aa  67  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.771345  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2766  sporulation domain-containing protein  41.98 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.170586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2353  tetratricopeptide TPR_4  39.73 
 
 		 533 aa  64.3  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0496  Sporulation domain protein  30.45 
 
 		 458 aa  60.5  0.00000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727905 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0748  sporulation and cell division repeat-containing protein  33.67 
 
 		 835 aa  56.6  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.198292  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1733  hypothetical protein  27.17 
 
 		 378 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.733482  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0614  sporulation domain-containing protein  33.68 
 
 		 282 aa  51.6  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0165  lytic transglycosylase catalytic  30.49 
 
 		 363 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1651  lytic transglycosylase catalytic  31.71 
 
 		 299 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0083  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 363 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3068  sporulation domain-containing protein  27.27 
 
 		 428 aa  48.9  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0743  hypothetical protein  34.83 
 
 		 243 aa  48.9  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000019481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0352  peptidase S11 D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  33.33 
 
 		 498 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1467  sporulation domain-containing protein  30.59 
 
 		 237 aa  48.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0998342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3156  lytic transglycosylase catalytic  30.38 
 
 		 321 aa  48.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0205593  normal  0.0158011 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2420  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  28.04 
 
 		 586 aa  47.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0202661  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1699  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  28.43 
 
 		 587 aa  47.4  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0899262  normal  0.827485 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1720  sporulation domain-containing protein  30.67 
 
 		 198 aa  47  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.15408  normal  0.157797 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1822  Lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 307 aa  47  0.0009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.725987 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0812  lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2207  Lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 328 aa  46.6  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1931  lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 328 aa  46.6  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.338077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5561  lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3051  lytic transglycosylase, catalytic  31.71 
 
 		 347 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1908  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 		 340 aa  45.8  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8692  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 340 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.570522  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2796  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  26 
 
 		 558 aa  44.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204271  normal  0.530411 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3554  Lytic transglycosylase catalytic  30.49 
 
 		 343 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.278452  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1371  peptidase S11, D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase 1  29.09 
 
 		 465 aa  44.3  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3321  lytic transglycosylase, catalytic  30.49 
 
 		 341 aa  43.5  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  26.09 
 
 		 2449 aa  43.5  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0790  Serine-type D-Ala-D-Ala carboxypeptidase  29.13 
 
 		 489 aa  43.5  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.143269 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>