234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0188 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0282  AFG1-like ATPase  82.49 
 
 		 393 aa  653    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0649883 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0534  AFG1-like ATPase  85.03 
 
 		 393 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0188  AFG1-family ATPase  100 
 
 		 394 aa  812    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.176309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0195  AFG1-like ATPase  73.79 
 
 		 397 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0391  AFG1 family ATPase  67.09 
 
 		 393 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.310283  normal  0.309124 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0418  AFG1-like ATPase  68.7 
 
 		 394 aa  539  9.999999999999999e-153  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0205439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0546  AFG1-like ATPase  68.88 
 
 		 394 aa  530  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.420567  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1121  AFG1-family ATPase  57.92 
 
 		 416 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0133658  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2159  AFG1 family ATPase  56.1 
 
 		 397 aa  418  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.54766 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0870  AFG1-family ATPase  55.87 
 
 		 404 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0474  AFG1 family ATPase  55.75 
 
 		 395 aa  409  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.756994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0895  AFG1-family ATPase  55.08 
 
 		 404 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2673  AFG1 family ATPase  55.1 
 
 		 410 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00261734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3602  AFG1 family ATPase  52.84 
 
 		 390 aa  399  9.999999999999999e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.417048  normal  0.374924 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0934  AFG1 family ATPase  54.82 
 
 		 404 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.204607 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2500  AFG1-family ATPase  52.28 
 
 		 395 aa  394  1e-108  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.727024 
 
 
-
 
NC_004310  BR1929  hypothetical protein  52.14 
 
 		 387 aa  385  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0929  AFG1 family ATPase  51.07 
 
 		 387 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1857  hypothetical protein  51.87 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2945  AFG1 family ATPase  52.86 
 
 		 409 aa  380  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3975  AFG1-family ATPase  49.33 
 
 		 387 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4130  hypothetical protein  51.63 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3394  AFG1-like ATPase  52.27 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3686  AFG1-family ATPase  49.07 
 
 		 386 aa  362  5.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.894577 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1448  AFG1 family ATPase  52.6 
 
 		 373 aa  347  3e-94  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0021  AFG1 family ATPase  46.61 
 
 		 403 aa  330  2e-89  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2833  AFG1 family ATPase  44.27 
 
 		 381 aa  310  4e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2117  AFG1-family ATPase  44.16 
 
 		 404 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4843  AFG1 family ATPase  47.51 
 
 		 372 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.826609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1989  AFG1 family ATPase  43.96 
 
 		 368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1302  AFG1 family ATPase  46.3 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1626  AFG1 family ATPase  47.18 
 
 		 371 aa  290  2e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536704  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1349  hypothetical protein  42.23 
 
 		 358 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.765478  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0007  AFG1 family ATPase  41.85 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000720762 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0017  AFG1 family ATPase  41.96 
 
 		 358 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.761776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0056  AFG1-like ATPase  45.6 
 
 		 358 aa  282  9e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0112  AFG1-family ATPase  45 
 
 		 389 aa  282  9e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1208  AFG1-like ATPase  42.67 
 
 		 382 aa  281  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2232  AFG1-like ATPase  44.16 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.860244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2324  AFG1-like ATPase  43.08 
 
 		 377 aa  270  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0954  AFG1 family ATPase  43.7 
 
 		 360 aa  266  2.9999999999999995e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.31762  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2673  AFG1-like ATPase  42.15 
 
 		 354 aa  266  5.999999999999999e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0102  hypothetical protein  39.52 
 
 		 367 aa  263  4.999999999999999e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000023398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2541  AFG1-family ATPase  40.75 
 
 		 371 aa  262  8.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.538898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2856  AFG1-like ATPase  40.49 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.555037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0334  AFG1 family ATPase  40.32 
 
 		 372 aa  252  8.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00880  hypothetical protein  38.27 
 
 		 367 aa  251  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3245  AFG1 family ATPase  39.73 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.090067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1591  AFG1 family ATPase  37.94 
 
 		 360 aa  249  5e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.594153  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2174  AFG1-family ATPase  39.95 
 
 		 366 aa  249  6e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.393147  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2208  AFG1-like ATPase  37.98 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0336644  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004512  putative ATPase  38.54 
 
 		 367 aa  247  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000122216  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03176  ATPase, AFG1 family protein  38.44 
 
 		 365 aa  248  2e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1903  AFG1-family ATPase  38.11 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1825  AFG1 family ATPase  38.11 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3667  AFG1 family ATPase  36.9 
 
 		 374 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000159924  normal  0.189864 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3798  AFG1-family ATPase  37.07 
 
 		 376 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000375047  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3544  ATPase, AFG1 family  37.43 
 
 		 375 aa  243  5e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000306426  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1859  AFG1 family ATPase  38.48 
 
 		 367 aa  243  6e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03092  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  37.17 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00364755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0474  AFG1 family ATPase  37.17 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000625697  normal  0.126668 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03043  hypothetical protein  37.17 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00168064  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3421  AFG1 family ATPase  37.17 
 
 		 375 aa  242  7e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000090092  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3653  AFG1 family ATPase  38.03 
 
 		 370 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000093907  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1406  AFG1 family ATPase  37.03 
 
 		 372 aa  242  9e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0829352 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3496  AFG1 family ATPase  37.98 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.170583  normal  0.858132 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0731  AFG1 family ATPase  38.03 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000798254  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3072  hypothetical protein  38.13 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000740728  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0701  AFG1 family ATPase  38.03 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000196074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0722  AFG1-family ATPase  38.03 
 
 		 370 aa  240  4e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000182538  hitchhiker  0.000146709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2697  AFG1 family ATPase  36.59 
 
 		 377 aa  240  4e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.115237  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0474  AFG1-family ATPase  37.17 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000087327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4549  ATPase, AFG1 family  37.17 
 
 		 375 aa  239  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000104108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3715  AFG1 family ATPase  36.9 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000708287  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0843  AFG1 family ATPase  38.46 
 
 		 367 aa  239  6.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3528  AFG1 family ATPase  36.9 
 
 		 375 aa  239  6.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000142323  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13020  hypothetical protein  37.04 
 
 		 374 aa  239  9e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.643406  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0551  AFG1-like ATPase  37.1 
 
 		 368 aa  239  9e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000457757  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3537  ATPase, AFG1 family  37.27 
 
 		 374 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000892623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3706  AFG1 family ATPase  37.27 
 
 		 374 aa  237  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00969037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0895  AFG1 family ATPase  37.47 
 
 		 364 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0298  AFG1-family ATPase  36.53 
 
 		 383 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000565805  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3644  ATPase  37.27 
 
 		 374 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0298166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3609  ATPase, AFG1 family  37.27 
 
 		 374 aa  236  4e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000949089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5010  hypothetical protein  37.7 
 
 		 364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.991717  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3976  AFG1 family ATPase  38.18 
 
 		 371 aa  236  5.0000000000000005e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.605596  normal  0.0346423 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2401  AFG1 family ATPase  39.05 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0204  AFG1-family ATPase  37.4 
 
 		 366 aa  236  6e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.667612  normal  0.823216 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2318  AFG1-like ATPase  37.63 
 
 		 365 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.90089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57650  hypothetical protein  37.43 
 
 		 364 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.994085 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2880  AFG1 family ATPase  39.1 
 
 		 366 aa  235  1.0000000000000001e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.549688 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0995  AFG1-family ATPase  37.93 
 
 		 367 aa  235  1.0000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000410235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3941  hypothetical protein  37.23 
 
 		 370 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2665  hypothetical protein  36.83 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00155012  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4223  AFG1 family ATPase  36.51 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000201844  hitchhiker  0.000390213 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0746  AFG1 family ATPase  36.12 
 
 		 368 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000022417  normal  0.0814032 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0691  AFG1 family ATPase  37.23 
 
 		 388 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000890952  hitchhiker  0.0000137092 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_2542  predicted protein  34.52 
 
 		 417 aa  233  3e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3270  AFG1 family ATPase  36.97 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000167889  hitchhiker  0.000173764 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1094  AFG1-like ATPase  35.9 
 
 		 373 aa  233  6e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.432883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>