More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4516 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4516  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
310 aa  626  1e-178  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.320967  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  85.48 
 
 
317 aa  529  1e-149  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0170  alpha/beta hydrolase fold protein  45.08 
 
 
307 aa  267  1e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.37958  hitchhiker  0.00283274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3291  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
296 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1721  alpha/beta fold family hydrolase  27.7 
 
 
304 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0960045  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2137  alpha/beta hydrolase fold protein  30.77 
 
 
363 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198184  normal  0.0171478 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  27.95 
 
 
286 aa  94.7  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2212  putative lipase  29.27 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.799877  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25910  putative lipase  29.27 
 
 
315 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0600573 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18381  alpha/beta fold family hydrolase  26.91 
 
 
304 aa  92.8  6e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3158  alpha/beta hydrolase fold protein  27.98 
 
 
290 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.511657 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3757  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  28.05 
 
 
295 aa  92  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4708  Alpha/beta hydrolase fold  27.06 
 
 
295 aa  90.1  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00337944  normal  0.50622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
275 aa  89.7  5e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18201  alpha/beta fold family hydrolase  26.64 
 
 
304 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.392562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2705  alpha/beta hydrolase fold  29.23 
 
 
309 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.601677  normal  0.0914485 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  28.12 
 
 
292 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0198  alpha/beta hydrolase fold  30.24 
 
 
311 aa  85.5  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.593906 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2916  alpha/beta hydrolase fold protein  28.03 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0094  hypothetical protein  28.3 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  27.9 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  27.47 
 
 
302 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  28.33 
 
 
340 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  31.84 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18171  alpha/beta fold family hydrolase  24.73 
 
 
303 aa  83.2  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_35123  predicted protein  26.22 
 
 
348 aa  83.2  0.000000000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2912  alpha/beta hydrolase fold  32.84 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00287314  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  25.4 
 
 
504 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  27.14 
 
 
331 aa  82.4  0.000000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20491  alpha/beta superfamily hydrolase/acyltransferase  26 
 
 
303 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.79696 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1121  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
322 aa  81.6  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1174  alpha/beta fold family hydrolase  26 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0140  hypothetical protein  26.32 
 
 
281 aa  80.5  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1945  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3600  alpha/beta hydrolase fold  30.29 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  37.1 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  26.84 
 
 
297 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3961  alpha/beta hydrolase fold  29.51 
 
 
260 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.611478 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  24.09 
 
 
287 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
344 aa  77.4  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1793  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
291 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000234271  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1765  alpha/beta hydrolase fold protein  25.1 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0269  hypothetical protein  28.46 
 
 
293 aa  76.3  0.0000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  26.32 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  26.48 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
339 aa  75.9  0.0000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0829  alpha/beta hydrolase fold protein  25.59 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1970  alpha/beta hydrolase fold  26.19 
 
 
311 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000319634  normal  0.0578642 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2379  alpha/beta hydrolase fold protein  28.74 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.173076  normal  0.904893 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0837  alpha/beta fold family hydrolase  26.3 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2302  alpha/beta hydrolase fold  26.04 
 
 
329 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.83 
 
 
308 aa  75.5  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  24.91 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  26.16 
 
 
258 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  25.1 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1756  alpha/beta hydrolase fold  28.28 
 
 
260 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  25.18 
 
 
291 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 
287 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17551  alpha/beta fold family hydrolase  21.51 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.412462  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  27.49 
 
 
285 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  26.1 
 
 
343 aa  74.7  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  27.24 
 
 
285 aa  73.9  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  25.45 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0801  alpha/beta hydrolase fold protein  25.98 
 
 
305 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  25.48 
 
 
275 aa  73.2  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3452  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 
311 aa  73.2  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.156566  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0774  esterase  28.18 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.391328  normal  0.148596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  27.65 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0415  alpha/beta hydrolase fold protein  22.31 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5901  alpha/beta hydrolase fold protein  25.6 
 
 
273 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4241  hydrolase, alpha/beta fold family  20.7 
 
 
290 aa  72.4  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0213697  hitchhiker  0.0000000245564 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  24.16 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1120  alpha/beta fold family hydrolase  20.35 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00823936  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2572  alpha/beta hydrolase fold protein  26.61 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1464  alpha/beta hydrolase fold protein  25.86 
 
 
279 aa  71.6  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4250  alpha/beta hydrolase fold protein  27.1 
 
 
352 aa  71.6  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.2493  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  28.96 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2284  2-hydroxy-6-oxohepta-24-dienoate hydrolase  26.48 
 
 
303 aa  72.4  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.29683  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  24.53 
 
 
339 aa  72  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2918  alpha/beta hydrolase fold protein  27.84 
 
 
310 aa  72  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000917268  normal  0.0712608 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1186  hydrolase, alpha/beta fold family  21.32 
 
 
291 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000004858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1937  alpha/beta hydrolase fold protein  26.48 
 
 
299 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.926814 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1929  3-Oxoadipate enol-lactonase  24.54 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.878211  normal  0.500669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2863  alpha/beta hydrolase fold protein  37.76 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.334442  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0939  alpha/beta hydrolase fold family lipase  20.96 
 
 
291 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000150383  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0062  alpha/beta hydrolase fold protein  26.69 
 
 
301 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1057  hydrolase, alpha/beta fold family  20.96 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000161202  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  24.12 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  26.06 
 
 
453 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0940  alpha/beta hydrolase fold  20.35 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.178351  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0531  alpha/beta hydrolase fold protein  28.06 
 
 
273 aa  70.9  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  27.8 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  26.64 
 
 
255 aa  70.9  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5996  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)  26.32 
 
 
260 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>