93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3963 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3963  ribokinase-like domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  544  1e-154  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312464 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1429  ribokinase-like domain-containing protein  77.94 
 
 		 272 aa  408  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1200  PfkB domain protein  50.79 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.460127  normal  0.0167419 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0143  ribokinase-like domain-containing protein  39.61 
 
 		 259 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000113671  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1424  PfkB domain protein  38.77 
 
 		 285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3082  PfkB domain protein  36.33 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.925823  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2985  carbohydrate kinase, PfkB  36.69 
 
 		 284 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0222551  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2948  ribokinase-like domain-containing protein  35.38 
 
 		 283 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.64332 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3183  PfkB domain protein  35.51 
 
 		 284 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5887  PfkB domain protein  26.43 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784103  hitchhiker  0.0014284 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1011  ribokinase-like domain-containing protein  31.76 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3268  PfkB domain protein  25.99 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.266121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2548  PfkB domain protein  24.01 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0505  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000868793  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3619  PfkB domain-containing protein  40 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  26.29 
 
 		 331 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0185  ribokinase  25.68 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00000069064  normal  0.0609987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 337 aa  52  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4848  ribokinase-like domain-containing protein  40.91 
 
 		 313 aa  50.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.247088  normal  0.684962 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1406  ribokinase-like domain-containing protein  26.45 
 
 		 302 aa  50.4  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0116  fructokinase  25.32 
 
 		 324 aa  50.4  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.393597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  33.65 
 
 		 424 aa  50.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  31.93 
 
 		 403 aa  50.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0597  ribokinase-like domain-containing protein  26.32 
 
 		 269 aa  50.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1743  kinase  30.26 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.11698 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1085  PfkB domain protein  37.5 
 
 		 294 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000428719  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0932  inosine-guanosine kinase / cytidine kinase  27.5 
 
 		 298 aa  48.9  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.934328  normal  0.0821037 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0716  rfaE bifunctional protein  38.57 
 
 		 333 aa  48.1  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.511736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0357  ribokinase-like domain-containing protein  24.89 
 
 		 308 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.135899  normal  0.412728 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3592  aminoimidazole riboside kinase  24.63 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000158875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2647  aminoimidazole riboside kinase  24.63 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3167  ribokinase  35.2 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  24.48 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  29.45 
 
 		 403 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  24.48 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  43.75 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  43.75 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  43.75 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  43.75 
 
 		 298 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1421  PfkB  34.36 
 
 		 284 aa  45.8  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0830137 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4766  ribokinase-like domain-containing protein  33.64 
 
 		 313 aa  45.8  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.417619 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  43.75 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0225  PfkB domain protein  24.52 
 
 		 319 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5591  ribokinase-like domain-containing protein  44.32 
 
 		 314 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1357  PfkB domain protein  28.49 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368195  normal  0.047324 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  43.75 
 
 		 298 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0261  PfkB domain protein  36.36 
 
 		 325 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  32.11 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  32.26 
 
 		 308 aa  45.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  27.97 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0252  PfkB domain protein  24.44 
 
 		 283 aa  44.7  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9147  Sugar kinase ribokinase family  33.33 
 
 		 288 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132132  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  35.16 
 
 		 339 aa  44.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  26.16 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2701  fructokinase  24.91 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000723148  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3538  PfkB domain protein  32.56 
 
 		 310 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000797657  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1165  PfkB domain-containing protein  40.51 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1201  ribokinase-like domain-containing protein  20.78 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3586  tagatose-6-phosphate kinase  43.16 
 
 		 326 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00711887  normal  0.431843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  30.32 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2905  aminoimidazole riboside kinase  35.71 
 
 		 306 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00998461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  28.52 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1539  ribokinase  33.77 
 
 		 320 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.385923  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0207  ribokinase-like domain-containing protein  23.44 
 
 		 319 aa  43.5  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000760585  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1734  ribokinase-like domain-containing protein  28.63 
 
 		 281 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.264913  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1195  ribokinase-like domain-containing protein  37.18 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17670  PfkB-family carbohydrate kinase  40.51 
 
 		 323 aa  43.5  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0565403  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0417  ribokinase-like domain-containing protein  42.65 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.994196  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2146  fructokinase protein  50 
 
 		 318 aa  43.5  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000404752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0349  putative ribokinase  42.65 
 
 		 309 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2683  PfkB  25.41 
 
 		 305 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000599884  normal  0.453356 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  35.37 
 
 		 317 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0859  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.826184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2674  PfkB  35.19 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.201136  normal  0.321692 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6290  ribokinase  33.77 
 
 		 320 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.631078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0612  ribokinase-like domain-containing protein  24.74 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.27452  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  39.44 
 
 		 328 aa  43.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1416  ribokinase-like domain-containing protein  23.97 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2351  ribokinase-like domain-containing protein  48.89 
 
 		 318 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000153207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1220  cytidine kinase / inosine-guanosine kinase  23.14 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.515057  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  26.4 
 
 		 339 aa  43.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0290  PfkB domain protein  37.35 
 
 		 325 aa  42.7  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2140  PfkB domain protein  26.97 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2634  PfkB  25.55 
 
 		 312 aa  42.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  37.35 
 
 		 299 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2556  PfkB domain protein  26.63 
 
 		 305 aa  42.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5568399999999999e-27 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2870  PfkB  35 
 
 		 315 aa  42.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0148576  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1657  PfkB domain protein  26.63 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.381316  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2938  ribokinase-like domain-containing protein  25.4 
 
 		 304 aa  42.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000021137  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0924  ribokinase-like domain-containing protein  43.4 
 
 		 305 aa  42.4  0.009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.108155  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3109  PfkB domain protein  35.29 
 
 		 306 aa  42  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0492  ribokinase-like domain-containing protein  23.36 
 
 		 302 aa  42  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0289  ribokinase-like domain-containing protein  30.71 
 
 		 315 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>