41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2786 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  100 
 
 
740 aa  1419    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  51.62 
 
 
841 aa  672    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4056  hypothetical protein  33.07 
 
 
1134 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.55653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  55.42 
 
 
363 aa  224  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3841  hypothetical protein  33.05 
 
 
1140 aa  209  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0865863  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2600  hypothetical protein  27.12 
 
 
797 aa  173  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000916945  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  25.08 
 
 
1061 aa  142  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2601  hypothetical protein  25.86 
 
 
704 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000676276  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3824  hypothetical protein  25.49 
 
 
726 aa  114  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.510661  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2365  hypothetical protein  26.69 
 
 
888 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1688  two component regulator propeller domain-containing protein  26.74 
 
 
597 aa  105  4e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.216388  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  30.61 
 
 
460 aa  98.6  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2050  hypothetical protein  28.35 
 
 
446 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.639352  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4234  hypothetical protein  23.49 
 
 
716 aa  89  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3856  hypothetical protein  23.88 
 
 
723 aa  87.4  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000936038  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3181  hypothetical protein  23.58 
 
 
687 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  27.78 
 
 
1991 aa  83.6  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1899  hypothetical protein  48.84 
 
 
89 aa  79.7  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00459901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2290  hypothetical protein  23.77 
 
 
726 aa  74.3  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0804  hypothetical protein  26 
 
 
1280 aa  70.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.169834  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5988  hypothetical protein  31.15 
 
 
381 aa  63.9  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.253106 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  29.03 
 
 
1565 aa  58.5  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2523  hypothetical protein  25.26 
 
 
385 aa  54.3  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2912  hypothetical protein  26.21 
 
 
1585 aa  53.9  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000198492 
 
 
-
 
NC_006686  CND03520  bud site selection-related protein, putative  25.58 
 
 
1376 aa  53.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  31.17 
 
 
1027 aa  53.1  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48888  predicted protein  25.71 
 
 
645 aa  51.2  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  31.77 
 
 
1916 aa  49.7  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1371  hypothetical protein  26.54 
 
 
1588 aa  48.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  29 
 
 
1009 aa  47.8  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1259  hypothetical protein  27.47 
 
 
734 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.331683  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4930  hypothetical protein  29.78 
 
 
396 aa  47.4  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0581  hypothetical protein  27.93 
 
 
403 aa  47.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  23.68 
 
 
425 aa  47.4  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1823  hypothetical protein  30.49 
 
 
646 aa  47.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000592634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  24.8 
 
 
409 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1427  hypothetical protein  27.59 
 
 
303 aa  45.8  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  26.94 
 
 
378 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1832  hypothetical protein  31.36 
 
 
661 aa  45.4  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0514384  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  30.15 
 
 
943 aa  44.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1165  hypothetical protein  30.43 
 
 
390 aa  44.7  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>