More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2738 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2738  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 205 aa  410  1e-114  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1819  beta-lactamase domain-containing protein  83.41 
 
 		 204 aa  346  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0368429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3706  beta-lactamase domain-containing protein  61.58 
 
 		 201 aa  258  3e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000121895  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  36.82 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.72 
 
 		 215 aa  103  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2125  putative hydrolase  38.17 
 
 		 203 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  33.87 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  33.17 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  33.17 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 213 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  33.17 
 
 		 215 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 		 210 aa  99.8  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2854  beta-lactamase domain protein  38.38 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0696867  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  33.17 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.16 
 
 		 207 aa  97.4  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.67 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 		 215 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2687  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 195 aa  96.3  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5335  beta-lactamase domain-containing protein  35.18 
 
 		 213 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.311932  normal  0.0822687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  32.18 
 
 		 215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1339  beta-lactamase-like protein  34.29 
 
 		 192 aa  95.1  7e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3296  putative hydrolase  36.61 
 
 		 229 aa  94.7  8e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1630  beta-lactamase-like  34.74 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 		 213 aa  94.4  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 		 215 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5856  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.518272  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2000  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.506851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2423  beta-lactamase domain protein  38.3 
 
 		 204 aa  93.2  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2184  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 		 215 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0861591  normal  0.0986326 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  29.56 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1108  beta-lactamase domain-containing protein  35.2 
 
 		 218 aa  94  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.789331  normal  0.46822 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  32.66 
 
 		 205 aa  93.6  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1755  beta-lactamase domain-containing protein  33.82 
 
 		 235 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.622383  normal  0.422321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3563  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 		 218 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0215  beta-lactamase domain-containing protein  29.95 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.755925 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  31.34 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 218 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  31.34 
 
 		 215 aa  92  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  31.34 
 
 		 215 aa  92  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  32.83 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  32.83 
 
 		 214 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2036  beta-lactamase domain protein  36.07 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0394  putative metallo-beta-lactamase family protein  30.92 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.69 
 
 		 214 aa  90.9  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3004  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 225 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.057062 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22660  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.2 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.662338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.19 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.19 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2189  beta-lactamase domain protein  35.68 
 
 		 221 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000613341  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2719  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.19 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.19 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2989  beta-lactamase-like protein  35.29 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  31.19 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  32.34 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3033  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  31.44 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3631  beta-lactamase domain protein  33.81 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10570  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.79 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.193193  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25780  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  35.11 
 
 		 225 aa  89  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  29.9 
 
 		 207 aa  89  5e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 		 208 aa  89  5e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  30.1 
 
 		 209 aa  88.6  5e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 209 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 		 215 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3549  beta-lactamase domain-containing protein  34.21 
 
 		 225 aa  88.6  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.744565  normal  0.256716 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 212 aa  88.2  7e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5486  beta-lactamase domain protein  36.79 
 
 		 225 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000686385  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  32.32 
 
 		 217 aa  88.2  9e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0811  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 214 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0715  Beta-lactamase-like  33 
 
 		 222 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  31.63 
 
 		 214 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 		 209 aa  87.8  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  29.23 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  29.23 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0134  beta-lactamase-like  30.81 
 
 		 222 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  31.5 
 
 		 214 aa  87  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6047  hydroxyacylglutathione hydrolase W  35.98 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0800591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  28.57 
 
 		 209 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  31.68 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 209 aa  85.5  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 209 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0198  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 		 210 aa  85.9  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0374  beta-lactamase-like  33.67 
 
 		 222 aa  85.9  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.834872 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  28.72 
 
 		 251 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  28.57 
 
 		 209 aa  85.5  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  32.99 
 
 		 213 aa  85.5  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2995  beta-lactamase domain protein  34.72 
 
 		 224 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00127096  decreased coverage  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 206 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1500  beta-lactamase domain-containing protein  29.76 
 
 		 214 aa  84.7  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.903392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2056  beta-lactamase domain-containing protein  34.07 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.193314  normal  0.542159 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3651  beta-lactamase domain-containing protein  34.02 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>