229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2143 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  83.44 
 
 		 308 aa  536  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  53.18 
 
 		 310 aa  303  4.0000000000000003e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  43.71 
 
 		 307 aa  249  6e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  43.29 
 
 		 309 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  42.05 
 
 		 307 aa  196  5.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  43.84 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  34.65 
 
 		 319 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  39.11 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  37.08 
 
 		 312 aa  175  9e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  35.66 
 
 		 308 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  32.63 
 
 		 308 aa  169  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  36.9 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  40.07 
 
 		 305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  34.6 
 
 		 318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  34.84 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  33.11 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  36.09 
 
 		 337 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  29.65 
 
 		 323 aa  149  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  35.74 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  31.6 
 
 		 326 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  31.01 
 
 		 318 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  29.02 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  33.92 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  30.86 
 
 		 323 aa  142  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  30.86 
 
 		 326 aa  142  6e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  34.05 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 		 326 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  30.48 
 
 		 323 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  35.18 
 
 		 325 aa  136  5e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 301 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  36.04 
 
 		 361 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  29.61 
 
 		 307 aa  132  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.89 
 
 		 312 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.96 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  32.58 
 
 		 305 aa  126  4.0000000000000003e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  34.66 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  32.9 
 
 		 327 aa  125  9e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  35.9 
 
 		 316 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  34.04 
 
 		 304 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  32.84 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  32.6 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  31.06 
 
 		 330 aa  120  3e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  32.17 
 
 		 320 aa  119  7e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  31.22 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  30.83 
 
 		 297 aa  117  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  32.53 
 
 		 306 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  31.47 
 
 		 310 aa  115  8.999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  34.68 
 
 		 318 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  34.43 
 
 		 318 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  35.07 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  26.9 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 		 264 aa  95.9  7e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  27.9 
 
 		 266 aa  92.8  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  30.33 
 
 		 266 aa  90.5  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  29.33 
 
 		 267 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  27.62 
 
 		 307 aa  89.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  29.15 
 
 		 267 aa  87.8  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  32.97 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  29.2 
 
 		 259 aa  87.4  2e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  29.14 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  26.75 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  27.38 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  34.67 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 318 aa  58.9  0.00000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  29.44 
 
 		 337 aa  57.4  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  29.65 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  30.77 
 
 		 500 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  32.47 
 
 		 329 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  28.5 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  25.27 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  31.12 
 
 		 497 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  26.03 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1127  metallo-beta-lactamase superfamily protein  26.67 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0646  beta-lactamase domain protein  29.86 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 		 211 aa  52  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.343145 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05524  metallo-beta-lactamase domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G12940)  22.98 
 
 		 291 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 		 231 aa  51.6  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  29.7 
 
 		 214 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  25.12 
 
 		 221 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5004  beta-lactamase domain-containing protein  25.65 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  0.0887437 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  32.16 
 
 		 497 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  28.7 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  23.61 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  30.92 
 
 		 348 aa  50.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_10245  predicted protein  27.67 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00334407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  26.34 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  27.14 
 
 		 240 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  23.94 
 
 		 355 aa  50.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.73 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.17 
 
 		 257 aa  49.7  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.45 
 
 		 245 aa  49.7  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0775  beta-lactamase-like  25.57 
 
 		 302 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0033  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 		 209 aa  48.9  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000234295  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  29.58 
 
 		 212 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>