More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5221 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5221  Bug family extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 347 aa  701    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.334182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3678  hypothetical protein  68.9 
 
 		 327 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1370  hypothetical protein  48.53 
 
 		 338 aa  325  6e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1913  hypothetical protein  50.67 
 
 		 333 aa  317  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0165718  hitchhiker  0.00808178 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1371  hypothetical protein  49.34 
 
 		 342 aa  302  6.000000000000001e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3359  hypothetical protein  46.41 
 
 		 331 aa  278  9e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1033  hypothetical protein  45.63 
 
 		 325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829997  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  46.49 
 
 		 328 aa  271  1e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3508  hypothetical protein  43.93 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.231435 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0710  hypothetical protein  46.45 
 
 		 328 aa  266  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0982  hypothetical protein  47.1 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160235  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3163  hypothetical protein  45.6 
 
 		 334 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000218374 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1184  hypothetical protein  45.25 
 
 		 356 aa  263  3e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000425301  normal  0.947085 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  44.77 
 
 		 324 aa  262  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  42.06 
 
 		 326 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  43.13 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0855  hypothetical protein  45.07 
 
 		 353 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.898803 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  45.87 
 
 		 328 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1070  hypothetical protein  39.74 
 
 		 332 aa  257  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.530289  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  44.44 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5244  hypothetical protein  42.17 
 
 		 322 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0784  hypothetical protein  44.74 
 
 		 328 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  45.42 
 
 		 335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  44.11 
 
 		 325 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  41.03 
 
 		 331 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  41.14 
 
 		 339 aa  253  3e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1292  hypothetical protein  45.03 
 
 		 325 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0982133  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3996  hypothetical protein  42.68 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.96574  normal  0.364357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3346  hypothetical protein  42.68 
 
 		 321 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0146351  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  39.51 
 
 		 328 aa  252  6e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  41.82 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2413  hypothetical protein  42.37 
 
 		 325 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.325014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  43.38 
 
 		 330 aa  251  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  43.93 
 
 		 323 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0483  hypothetical protein  42.9 
 
 		 334 aa  250  3e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  41.83 
 
 		 335 aa  249  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5205  hypothetical protein  42.76 
 
 		 321 aa  249  5e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.419234  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  41.42 
 
 		 322 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  41.27 
 
 		 322 aa  248  8e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2205  hypothetical protein  40.32 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0725118 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0521  hypothetical protein  41.81 
 
 		 326 aa  248  8e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  39.27 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  41.39 
 
 		 325 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0579  hypothetical protein  40.4 
 
 		 322 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1145  hypothetical protein  40.74 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  41.39 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3994  hypothetical protein  41.41 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.189336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  39.33 
 
 		 330 aa  247  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  42.48 
 
 		 325 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2106  hypothetical protein  48.06 
 
 		 337 aa  247  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.150501  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4611  hypothetical protein  41.97 
 
 		 332 aa  246  3e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.214044  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4645  extra-cytoplasmic solute receptor  47.15 
 
 		 348 aa  247  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5741  hypothetical protein  44.04 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.286317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  42.02 
 
 		 333 aa  246  6e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  40.83 
 
 		 336 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  40.66 
 
 		 318 aa  245  9e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  41.12 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  42.57 
 
 		 324 aa  244  9.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  43.14 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  41.06 
 
 		 335 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0116  hypothetical protein  39.2 
 
 		 331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1326  hypothetical protein  42.9 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.12583  hitchhiker  7.14872e-17 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0099  hypothetical protein  39.2 
 
 		 331 aa  243  3e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.361253  normal  0.47407 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  40.13 
 
 		 329 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0619  hypothetical protein  40.37 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3194  hypothetical protein  40.47 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2294  hypothetical protein  43.14 
 
 		 326 aa  243  3.9999999999999997e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000131413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5472  hypothetical protein  45.57 
 
 		 330 aa  242  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  43.09 
 
 		 333 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  40.58 
 
 		 339 aa  242  7e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  37.5 
 
 		 327 aa  242  7e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  37.88 
 
 		 328 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  39.05 
 
 		 336 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  37.88 
 
 		 328 aa  241  1e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  41.41 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  42.32 
 
 		 356 aa  241  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1625  hypothetical protein  40.49 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.354122  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  39.02 
 
 		 335 aa  241  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3809  hypothetical protein  39.87 
 
 		 310 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  42.81 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  38.46 
 
 		 328 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.08 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2249  hypothetical protein  40.18 
 
 		 325 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  37.35 
 
 		 328 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2123  hypothetical protein  43.86 
 
 		 326 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  37.8 
 
 		 332 aa  239  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0790  hypothetical protein  44.48 
 
 		 328 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0779  hypothetical protein  40.13 
 
 		 335 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  40.2 
 
 		 318 aa  239  5e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4323  hypothetical protein  40.06 
 
 		 344 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.957408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  44.41 
 
 		 332 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3827  hypothetical protein  42.54 
 
 		 330 aa  239  6.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.338181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4634  hypothetical protein  42.68 
 
 		 322 aa  238  8e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.898459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1312  hypothetical protein  38.46 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  40.12 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2429  hypothetical protein  39.94 
 
 		 326 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  40.6 
 
 		 330 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  41 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0646  hypothetical protein  38.1 
 
 		 334 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  40.33 
 
 		 338 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>