More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4433 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 327 aa  656    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3546  hypothetical protein  47.84 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2869  hypothetical protein  47.99 
 
 		 330 aa  296  3e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1121  hypothetical protein  49.16 
 
 		 325 aa  296  4e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.237862  normal  0.618143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1041  hypothetical protein  49.16 
 
 		 327 aa  295  5e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  47.32 
 
 		 339 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4821  hypothetical protein  47.81 
 
 		 330 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5112  hypothetical protein  47.18 
 
 		 325 aa  288  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.386337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1017  hypothetical protein  47.97 
 
 		 304 aa  287  2e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.221773 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5589  hypothetical protein  47.52 
 
 		 335 aa  286  2e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  44.16 
 
 		 331 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3937  hypothetical protein  47.19 
 
 		 328 aa  285  5.999999999999999e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178831  normal  0.0313351 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  44.2 
 
 		 327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5382  extra-cytoplasmic solute receptor  46.13 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.203559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  46.25 
 
 		 335 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3178  hypothetical protein  44.2 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000137109 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3664  hypothetical protein  47.37 
 
 		 324 aa  279  6e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6278  hypothetical protein  50.17 
 
 		 322 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000130922  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  50.67 
 
 		 323 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5565  hypothetical protein  47.74 
 
 		 335 aa  273  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3671  extra-cytoplasmic solute receptor  46.73 
 
 		 334 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  44.79 
 
 		 328 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0143  hypothetical protein  43.94 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.627963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0161  hypothetical protein  43.94 
 
 		 330 aa  269  5e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5547  hypothetical protein  46.86 
 
 		 325 aa  268  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0200  hypothetical protein  45.24 
 
 		 349 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3974  hypothetical protein  43.77 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.406148 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3324  hypothetical protein  43.77 
 
 		 328 aa  266  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.0025587  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3135  hypothetical protein  45.79 
 
 		 326 aa  264  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.82433  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0596  hypothetical protein  43.79 
 
 		 336 aa  264  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.642014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4004  hypothetical protein  44.78 
 
 		 339 aa  263  4e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.506172  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2991  hypothetical protein  46.86 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.36978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1026  hypothetical protein  46.39 
 
 		 333 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.346833  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  45.66 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  45.66 
 
 		 345 aa  262  6.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3801  extra-cytoplasmic solute receptor  42.15 
 
 		 330 aa  262  6.999999999999999e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.828068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2117  hypothetical protein  44.97 
 
 		 327 aa  261  8.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299705  normal  0.290671 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0843  hypothetical protein  44.3 
 
 		 323 aa  261  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0159621  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2114  hypothetical protein  47.62 
 
 		 325 aa  259  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00328294 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3983  extra-cytoplasmic solute receptor  43.64 
 
 		 328 aa  259  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0104878 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2025  hypothetical protein  45.72 
 
 		 324 aa  259  4e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1868  hypothetical protein  42.17 
 
 		 330 aa  258  8e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  45 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5574  extra-cytoplasmic solute receptor  46.1 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  42.68 
 
 		 327 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5108  extra-cytoplasmic solute receptor  43.87 
 
 		 326 aa  257  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000000351886  normal  0.964391 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  42.72 
 
 		 328 aa  256  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4271  hypothetical protein  42.02 
 
 		 339 aa  256  3e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  43.29 
 
 		 321 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  43 
 
 		 334 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  41.8 
 
 		 332 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0585  hypothetical protein  43.89 
 
 		 341 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.156752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3145  hypothetical protein  45.87 
 
 		 333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.261814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  40.79 
 
 		 322 aa  253  3e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  43 
 
 		 327 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2507  hypothetical protein  41.83 
 
 		 336 aa  252  7e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0847  hypothetical protein  45.1 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.318374  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0489  hypothetical protein  43.11 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0828  hypothetical protein  44.44 
 
 		 335 aa  251  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.136447  normal  0.157407 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4081  hypothetical protein  44.26 
 
 		 335 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4779  hypothetical protein  42.68 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5438  hypothetical protein  43.81 
 
 		 326 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4073  extra-cytoplasmic solute receptor  41.61 
 
 		 332 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000509768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1128  hypothetical protein  42.14 
 
 		 324 aa  249  5e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.794936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1018  twin-arginine translocation pathway signal  45.95 
 
 		 328 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3558  hypothetical protein  41.53 
 
 		 327 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4520  hypothetical protein  43.49 
 
 		 326 aa  249  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  39.56 
 
 		 325 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3745  hypothetical protein  41.56 
 
 		 330 aa  248  9e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0812255  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1912  hypothetical protein  40.07 
 
 		 335 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0797  hypothetical protein  47.12 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5894  extra-cytoplasmic solute receptor  43.79 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0257  hypothetical protein  41.61 
 
 		 334 aa  248  1e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3832  extra-cytoplasmic solute receptor  43.05 
 
 		 322 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1635  hypothetical protein  40 
 
 		 333 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.345549  normal  0.902401 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0179  hypothetical protein  42.68 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.303741 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  40.94 
 
 		 333 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  40.8 
 
 		 323 aa  247  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2293  hypothetical protein  39.68 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000010806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4047  extra-cytoplasmic solute receptor  38.77 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0364236  normal  0.64466 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5733  hypothetical protein  43.1 
 
 		 341 aa  247  2e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558781 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0145  hypothetical protein  42.47 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0127  hypothetical protein  42.47 
 
 		 325 aa  246  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  41.43 
 
 		 326 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  44.78 
 
 		 339 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.69 
 
 		 335 aa  246  4e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0779  hypothetical protein  42.86 
 
 		 360 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5895  hypothetical protein  43.84 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0219552  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5035  hypothetical protein  42.95 
 
 		 339 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.401942  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7860  hypothetical protein  39.08 
 
 		 324 aa  245  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.266797 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  42.62 
 
 		 337 aa  245  8e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5060  hypothetical protein  40.47 
 
 		 331 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4972  hypothetical protein  42.14 
 
 		 328 aa  245  8e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345918  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3966  hypothetical protein  38.56 
 
 		 356 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0682449  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2796  hypothetical protein  41.18 
 
 		 336 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.309219  normal  0.544833 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  41.64 
 
 		 336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4385  hypothetical protein  40.32 
 
 		 323 aa  244  1.9999999999999999e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.944912  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  43.04 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0795  hypothetical protein  40.5 
 
 		 346 aa  243  3e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  42.37 
 
 		 325 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>