More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4067 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4067  extra-cytoplasmic solute receptor  100 
 
 		 325 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0118561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4503  extra-cytoplasmic solute receptor  39.93 
 
 		 366 aa  236  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.4554  normal  0.0615049 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4752  twin-arginine translocation pathway signal  38.67 
 
 		 333 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.417694  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4501  extra-cytoplasmic solute receptor  40.18 
 
 		 327 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.034407  normal  0.0507087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5824  extra-cytoplasmic solute receptor  40.41 
 
 		 330 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3548  hypothetical protein  38.7 
 
 		 334 aa  232  8.000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0576712  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3550  hypothetical protein  39.39 
 
 		 326 aa  225  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.615423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2776  hypothetical protein  38.91 
 
 		 332 aa  224  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.918758  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5443  hypothetical protein  39.09 
 
 		 337 aa  223  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0242  hypothetical protein  41.59 
 
 		 325 aa  219  6e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2904  hypothetical protein  39.73 
 
 		 332 aa  215  9e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.339964  normal  0.0116375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4458  hypothetical protein  37.79 
 
 		 332 aa  215  9.999999999999999e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.60746  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4641  hypothetical protein  39.66 
 
 		 327 aa  212  7.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.647286  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5801  hypothetical protein  38.38 
 
 		 330 aa  211  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744071  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1918  hypothetical protein  39.59 
 
 		 333 aa  209  5e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0256  hypothetical protein  38.96 
 
 		 327 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5777  hypothetical protein  36.77 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.228941  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0191  hypothetical protein  38.91 
 
 		 335 aa  206  3e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4214  hypothetical protein  40.14 
 
 		 324 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5113  extra-cytoplasmic solute receptor  36.98 
 
 		 330 aa  206  6e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000122246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0119  hypothetical protein  36.18 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5930  hypothetical protein  36.63 
 
 		 323 aa  205  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0102  hypothetical protein  36.18 
 
 		 328 aa  205  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.337169 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0842  hypothetical protein  38.82 
 
 		 325 aa  205  8e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3949  hypothetical protein  41.22 
 
 		 339 aa  205  1e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187886  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3792  extra-cytoplasmic solute receptor  37.42 
 
 		 326 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3216  hypothetical protein  38.14 
 
 		 332 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5503  extra-cytoplasmic solute receptor  36.17 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0843  hypothetical protein  35.96 
 
 		 324 aa  203  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.593129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2903  hypothetical protein  37 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1908  hypothetical protein  38.68 
 
 		 336 aa  203  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.781517  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4146  extra-cytoplasmic solute receptor  38.91 
 
 		 339 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00162583  normal  0.322023 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4278  hypothetical protein  40.27 
 
 		 332 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.239022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4957  hypothetical protein  36.89 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0102082  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0823  hypothetical protein  37.41 
 
 		 325 aa  202  8e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0213458 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0112  hypothetical protein  39.46 
 
 		 338 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.25815  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6131  hypothetical protein  38.23 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.554613  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4609  extra-cytoplasmic solute receptor  40.2 
 
 		 328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.636278 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4624  hypothetical protein  37.58 
 
 		 327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5278  extra-cytoplasmic solute receptor  37.88 
 
 		 331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.777708  normal  0.21823 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2828  hypothetical protein  39.38 
 
 		 328 aa  200  3e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.384643  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1726  hypothetical protein  37.31 
 
 		 337 aa  200  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2648  hypothetical protein  39.25 
 
 		 336 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.43635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3798  hypothetical protein  39.39 
 
 		 326 aa  199  3.9999999999999996e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.226331  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1992  hypothetical protein  41.61 
 
 		 317 aa  199  6e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.108122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2909  hypothetical protein  35.69 
 
 		 323 aa  199  7e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0462  hypothetical protein  39.27 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.170176 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1164  hypothetical protein  35.74 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0453  hypothetical protein  39.27 
 
 		 345 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.533416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1792  hypothetical protein  41.61 
 
 		 317 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3568  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2113  hypothetical protein  35.51 
 
 		 318 aa  197  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.723108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4082  hypothetical protein  35.17 
 
 		 331 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2752  hypothetical protein  35.28 
 
 		 325 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.299516 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0869  hypothetical protein  37.2 
 
 		 339 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5146  hypothetical protein  34.97 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0987531  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0801  hypothetical protein  41.36 
 
 		 323 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.618864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5273  extra-cytoplasmic solute receptor  36.69 
 
 		 322 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320147  normal  0.0608959 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2142  hypothetical protein  35.98 
 
 		 332 aa  196  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.980907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3537  hypothetical protein  34.81 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4433  extra-cytoplasmic solute receptor  37.29 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.318216 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3721  extra-cytoplasmic solute receptor  32.41 
 
 		 345 aa  195  9e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.31096 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0125  hypothetical protein  36.27 
 
 		 332 aa  195  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.232724  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3830  hypothetical protein  36.52 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.956859  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1019  hypothetical protein  36.88 
 
 		 330 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2871  hypothetical protein  36.18 
 
 		 305 aa  195  1e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276028  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3624  hypothetical protein  36.2 
 
 		 330 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.210677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6257  hypothetical protein  38.28 
 
 		 330 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3884  hypothetical protein  36.14 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6069  hypothetical protein  35.03 
 
 		 318 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4853  extra-cytoplasmic solute receptor  36.86 
 
 		 314 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0565268  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2668  hypothetical protein  34.57 
 
 		 336 aa  194  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0309  twin-arginine translocation pathway signal  36.06 
 
 		 328 aa  193  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0108  hypothetical protein  36.27 
 
 		 332 aa  193  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.251449 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4356  hypothetical protein  39.04 
 
 		 323 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2570  hypothetical protein  37.35 
 
 		 339 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052781 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3894  hypothetical protein  34.06 
 
 		 321 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0107663  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0719  hypothetical protein  37.08 
 
 		 326 aa  192  5e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.32495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1383  hypothetical protein  35.64 
 
 		 325 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1657  hypothetical protein  35.31 
 
 		 331 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.129303  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5038  extra-cytoplasmic solute receptor  35.87 
 
 		 348 aa  192  6e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.610861 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0228  hypothetical protein  34.81 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3017  hypothetical protein  37.35 
 
 		 326 aa  192  7e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0135549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4389  hypothetical protein  37.33 
 
 		 321 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4856  hypothetical protein  37.05 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.876948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1815  hypothetical protein  35.49 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00540737  normal  0.0160042 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1372  hypothetical protein  36.82 
 
 		 329 aa  192  9e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0038  hypothetical protein  38.64 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.914226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0693  hypothetical protein  37.37 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0060  hypothetical protein  36.21 
 
 		 322 aa  191  1e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5061  extra-cytoplasmic solute receptor  37.2 
 
 		 335 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000369607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2663  hypothetical protein  36.67 
 
 		 324 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1906  hypothetical protein  36.3 
 
 		 325 aa  191  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.375062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5751  hypothetical protein  37.77 
 
 		 327 aa  191  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0796477  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3798  hypothetical protein  35.79 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.366926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3862  hypothetical protein  36.21 
 
 		 339 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.915599  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1708  hypothetical protein  34.77 
 
 		 322 aa  190  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000467968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1607  hypothetical protein  34.59 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3311  hypothetical protein  36.36 
 
 		 324 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4543  hypothetical protein  36.36 
 
 		 323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00792277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2535  hypothetical protein  37.37 
 
 		 324 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.188346  normal  0.11919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>