More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1173 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1173  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 266 aa  537  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.761417  normal  0.802826 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5426  two component transcriptional regulator  83.27 
 
 		 251 aa  421  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6809  two component transcriptional regulator  82.28 
 
 		 277 aa  421  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.867301 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5358  two component transcriptional regulator  82.14 
 
 		 272 aa  423  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296948 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1561  two component transcriptional regulator  85.77 
 
 		 239 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.932075  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5785  two component transcriptional regulator  84.1 
 
 		 239 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6268  two component transcriptional regulator  85.77 
 
 		 239 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.350192  normal  0.482642 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6757  two component transcriptional regulator  85.77 
 
 		 239 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.250889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5550  two component transcriptional regulator  83.68 
 
 		 239 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4496  two component transcriptional regulator, winged helix family  83.54 
 
 		 245 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0815  two component transcriptional regulator  85.71 
 
 		 248 aa  410  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.348891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1508  two component transcriptional regulator  74.15 
 
 		 237 aa  375  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0543  two component transcriptional regulator  73.44 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3071  two component transcriptional regulator  78.79 
 
 		 238 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.000985444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0307  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.79 
 
 		 242 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0295  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.79 
 
 		 242 aa  368  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2988  two component transcriptional regulator, winged helix family  73.98 
 
 		 242 aa  365  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0470  two component transcriptional regulator, winged helix family  72.15 
 
 		 239 aa  348  4e-95  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0260801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1374  two component transcriptional regulator  64.58 
 
 		 238 aa  306  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1007  two component transcriptional regulator  53.48 
 
 		 233 aa  249  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3703  two component transcriptional regulator  52.63 
 
 		 232 aa  243  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.230236  normal  0.0884672 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0987  two component transcriptional regulator, winged helix family  51.32 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195539  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  46.29 
 
 		 239 aa  209  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3419  two component transcriptional regulator  48.32 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0218  two component transcriptional regulator  45.73 
 
 		 239 aa  207  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 232 aa  207  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0485  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  43.83 
 
 		 244 aa  204  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0289  two component transcriptional regulator  43.28 
 
 		 243 aa  202  5e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.563834 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  42.31 
 
 		 237 aa  199  5e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0669  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.193178 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3278  two component transcriptional regulator  45.63 
 
 		 253 aa  198  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0104368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0651  DNA-binding response regulator  42.06 
 
 		 260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.53482  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.81 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2490  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.7 
 
 		 244 aa  194  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247926  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 239 aa  193  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1090  two component transcriptional regulator  47.81 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0839689 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  41.03 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.35 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  38.89 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  39.74 
 
 		 237 aa  192  6e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2918  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  40.87 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1197  response regulator receiver  46.49 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0458  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396749 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4786  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 229 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.15 
 
 		 223 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0978  two component transcriptional regulator  46.9 
 
 		 321 aa  188  8e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.323902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1903  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.85 
 
 		 229 aa  188  1e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  46.22 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1728  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.37 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4565  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0940  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.324642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4920  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.84 
 
 		 233 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4781  DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4803  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4400  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4417  DNA-binding response regulator  42.29 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2981  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000201285  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  45.45 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  41.92 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  44.74 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4692  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 232 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  185  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  185  6e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1288  two component transcriptional regulator  39.83 
 
 		 228 aa  185  6e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000128008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1897  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.29 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  40.79 
 
 		 233 aa  185  7e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 233 aa  185  8e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  46.55 
 
 		 236 aa  185  8e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3409  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.22 
 
 		 236 aa  185  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1618  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 254 aa  184  9e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.218753 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5010  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  40.35 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4991  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0249  two component transcriptional regulator  40.79 
 
 		 233 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0382139  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4963  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4745  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2219  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.78 
 
 		 240 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4583  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.510578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4605  DNA-binding response regulator  42.48 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000523811  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  42.8 
 
 		 235 aa  183  2.0000000000000003e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2657  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.350713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5106  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0827  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00211389  normal  0.244563 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3460  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.92 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>