More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6441 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012854  Rleg_6441  flavin reductase domain protein FMN-binding  100 
 
 
179 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0182942 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4641  flavin reductase domain protein FMN-binding  82.68 
 
 
179 aa  310  4.999999999999999e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1212  flavin reductase domain-containing protein  51.63 
 
 
185 aa  160  7e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1003  flavin reductase-like, FMN-binding  47.47 
 
 
173 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1106  flavin reductase-like, FMN-binding  47.47 
 
 
173 aa  143  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.321657  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5477  hypothetical protein  44.67 
 
 
182 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4357  flavin reductase domain-containing protein  48.45 
 
 
186 aa  137  8.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5060  flavin reductase domain protein FMN-binding  45 
 
 
190 aa  137  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.533074  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0686  flavin reductase-like, FMN-binding  43.23 
 
 
193 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520782  normal  0.880219 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4599  flavin reductase domain-containing protein  46.31 
 
 
191 aa  134  8e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0843412  normal  0.0587176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2880  flavin reductase domain protein FMN-binding  42.26 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5433  flavin reductase-like, FMN-binding  43.45 
 
 
174 aa  125  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1869  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  50.66 
 
 
165 aa  124  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15070  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, small subunit  38.12 
 
 
183 aa  114  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0341961  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0903  flavin reductase-like, FMN-binding  36.88 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000520403  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7128  flavoprotein oxidoreductase  37.42 
 
 
167 aa  109  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2385  flavin reductase-like, FMN-binding  33.33 
 
 
162 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289949  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1544  flavin reductase-like, FMN-binding  35.1 
 
 
174 aa  104  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.917406  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0995  flavin reductase-like  35.37 
 
 
178 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6111  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.09 
 
 
374 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.575038  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0934  flavin reductase domain-containing protein  35.9 
 
 
186 aa  102  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351151  normal  0.609948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3021  flavin reductase domain-containing protein  37.74 
 
 
172 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0740785  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3210  flavin reductase domain protein FMN-binding  39.04 
 
 
184 aa  102  4e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1289  flavin reductase-like, FMN-binding  36.08 
 
 
164 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3246  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.74 
 
 
172 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0855  flavin reductase family protein  32.7 
 
 
169 aa  101  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0181581  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0950  putative flavoprotein reductase  39.22 
 
 
177 aa  100  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3295  putative monooxygenase/flavin reductase-like, FMN-binding  32.93 
 
 
190 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.940039  normal  0.148638 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5770  flavin reductase-like, FMN-binding  38.51 
 
 
183 aa  99.4  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1955  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.67 
 
 
204 aa  99.8  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.925053  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2866  flavin reductase domain-containing protein  34.44 
 
 
175 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.567161  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1153  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  36.88 
 
 
180 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4843  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.57 
 
 
180 aa  96.7  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2575  flavin reductase domain-containing protein  36.2 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3898  flavin reductase-like, FMN-binding  34.15 
 
 
176 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.69994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8752  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.61 
 
 
162 aa  96.7  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.125188 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2053  flavin reductase domain protein FMN-binding  37.11 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.490233  normal  0.271048 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1830  flavin reductase domain-containing protein  35.85 
 
 
167 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0710863  normal  0.62797 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3189  flavin reductase domain-containing protein  34.34 
 
 
172 aa  95.5  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3755  flavin reductase-like, FMN-binding  34.93 
 
 
154 aa  95.5  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6241  flavin reductase domain-containing protein  34.39 
 
 
170 aa  95.5  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5034  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.03 
 
 
171 aa  95.1  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26130  conserved protein of DIM6/NTAB family  31.17 
 
 
179 aa  94.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.861848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3842  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.85 
 
 
190 aa  94.4  7e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1734  flavin reductase domain-containing protein  36.36 
 
 
202 aa  93.6  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.521212  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1380  putative oxygenase  40.46 
 
 
166 aa  94  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.436  normal  0.571719 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1415  flavin reductase-like, FMN-binding  32.68 
 
 
172 aa  92.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0331151  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2488  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  31.41 
 
 
181 aa  92.8  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2144  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.56 
 
 
162 aa  92  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.438455  normal  0.0344476 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1462  flavin reductase-like, FMN-binding  31.9 
 
 
172 aa  92  4e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194965  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4109  flavin reductase domain-containing protein  34 
 
 
162 aa  91.7  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2059  flavin reductase-like, FMN-binding  31.29 
 
 
170 aa  91.7  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000136887  normal  0.155549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2148  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.11 
 
 
181 aa  91.7  6e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2404  flavin reductase-like, FMN-binding  33.97 
 
 
197 aa  91.3  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0203545 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0697  flavin reductase-like, FMN-binding  33.54 
 
 
174 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.318628  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1079  flavin reductase domain protein FMN-binding  35.22 
 
 
202 aa  91.3  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.155431  normal  0.0275132 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1180  flavin reductase-like, FMN-binding  30.19 
 
 
165 aa  90.9  9e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669714  normal  0.14091 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2773  flavin reductase domain-containing protein  31.9 
 
 
204 aa  90.9  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.827464  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0922  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  34.21 
 
 
190 aa  90.9  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3806  flavin reductase domain-containing protein  38.65 
 
 
171 aa  90.5  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2213  flavin reductase domain-containing protein  34.16 
 
 
165 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4322  flavin reductase domain-containing protein  32.28 
 
 
156 aa  89.7  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.495347 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1331  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  35.76 
 
 
157 aa  90.1  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0131046  normal  0.0375915 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3173  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.08 
 
 
155 aa  89  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.213746  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4187  flavin reductase domain-containing protein  32.92 
 
 
156 aa  89  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.344162  hitchhiker  0.00000247222 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0712  flavin reductase-like, FMN-binding  30.72 
 
 
169 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.195047  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4430  flavin reductase domain protein FMN-binding  32.53 
 
 
170 aa  89  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2464  flavin reductase-like, FMN-binding  32.1 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2356  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.07 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2635  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  32.1 
 
 
164 aa  89  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2452  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  30.07 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1639  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  30.07 
 
 
165 aa  88.6  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1292  monooxygenase, putative  31.29 
 
 
173 aa  88.2  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2080  flavin reductase domain protein FMN-binding  31.61 
 
 
175 aa  88.6  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1255  putative monooxygenase  31.29 
 
 
210 aa  87.8  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.218566  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1486  flavin reductase domain-containing protein  30.72 
 
 
166 aa  87.8  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0134699 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1520  flavin reductase domain-containing protein  32.69 
 
 
164 aa  87.8  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.377691 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01010  predicted oxidoreductase, flavin:NADH component  31.48 
 
 
164 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01017  hypothetical protein  31.48 
 
 
164 aa  87  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5028  flavin reductase domain protein FMN-binding  33.33 
 
 
181 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.296353  normal  0.178556 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2588  flavin reductase domain-containing protein  31.48 
 
 
164 aa  87  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0976378 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1125  putative flavin reductase rutF  31.48 
 
 
164 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1122  putative flavin reductase rutF  31.48 
 
 
164 aa  87  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2118  putative flavin reductase rutF  31.48 
 
 
164 aa  87  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1244  putative flavin reductase rutF  31.48 
 
 
164 aa  87  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2625  flavin reductase domain-containing protein  33.77 
 
 
175 aa  87  1e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1781  flavin reductase domain protein FMN-binding  34.97 
 
 
170 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000326211 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3697  hypothetical protein  32.72 
 
 
168 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416114  normal  0.561141 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2506  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase component  29.01 
 
 
216 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.64515  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1893  flavin reductase domain-containing protein  29.88 
 
 
196 aa  85.1  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4906  flavin reductase-like, FMN-binding  29.49 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3257  flavin reductase domain-containing protein  29.49 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.347082 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3957  flavoprotein oxidoreductase  32.7 
 
 
175 aa  85.1  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1006  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase small chain  33.12 
 
 
170 aa  84.7  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4569  flavin reductase domain-containing protein  31.79 
 
 
168 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.168404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2341  flavin reductase-like, FMN-binding  31.61 
 
 
165 aa  84  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.236422  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1628  flavin reductase domain-containing protein FMN-binding protein  28.66 
 
 
191 aa  83.6  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.96202  normal  0.763872 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6600  Conserved protein/domain typically associated with flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family  34 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3609  4-hydroxyphenylacetate 3-monooxygenase, reductase subunit  28.4 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537664  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1916  flavin reductase domain protein FMN-binding  30.72 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>