More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6192 on replicon NC_012852
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011371  Rleg2_6372  ABC transporter related  90 
 
 		 569 aa  1016    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.623258 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3249  peptide ABC transporter ATPase  67.56 
 
 		 557 aa  710    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6192  ABC transporter related  100 
 
 		 570 aa  1133    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512255  normal  0.802988 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3983  ABC transporter related  67.74 
 
 		 557 aa  713    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8183  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  46.54 
 
 		 596 aa  483  1e-135  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.474805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2031  ABC transporter ATP-binding protein  46.2 
 
 		 539 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00115375  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6678  ABC transporter related  46.34 
 
 		 562 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1446  ABC transporter related  43.76 
 
 		 597 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  43.84 
 
 		 613 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1749  ABC transporter related  42.86 
 
 		 599 aa  456  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.84058  normal  0.153665 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5559  ABC transporter related  43.87 
 
 		 570 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.153225  normal  0.0799333 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  43.16 
 
 		 615 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0021  ABC transporter related  42.86 
 
 		 610 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1648  ABC transporter related  44.12 
 
 		 538 aa  451  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2425  ABC transporter-like protein  46.25 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5697  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  44.36 
 
 		 568 aa  449  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.110547  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05094  hypothetical protein  43.14 
 
 		 543 aa  449  1e-125  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1323  glutathione transporter ATP-binding protein  43.75 
 
 		 623 aa  450  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  44.9 
 
 		 593 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2473  ABC transporter related  43.2 
 
 		 588 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146022  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1185  ABC transporter related  42.94 
 
 		 547 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0888  ABC transporter related  44.1 
 
 		 613 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1120  ABC transporter related  43.46 
 
 		 603 aa  448  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3002  ABC transporter related  46.38 
 
 		 531 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3317  ABC transporter related  44.53 
 
 		 545 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0279839  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  43.28 
 
 		 609 aa  446  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4108  ABC transporter related  42.24 
 
 		 612 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0021  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 601 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0011  ABC transporter related  43.33 
 
 		 553 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0129  ABC transporter related  46.17 
 
 		 539 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3805  ABC transporter related  43.8 
 
 		 611 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.503567  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.6 
 
 		 617 aa  444  1e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4582  ABC transporter related  45.36 
 
 		 619 aa  442  1e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2614  ABC transporter related  43.75 
 
 		 595 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7329  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  42.71 
 
 		 626 aa  441  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.148864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0978  glutathione transporter ATP-binding protein  43.56 
 
 		 623 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1478  ABC oligopeptide transporter, fused ATPase subunits  45.79 
 
 		 539 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0559812  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2226  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.993746  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  42.47 
 
 		 606 aa  440  9.999999999999999e-123  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0463  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 		 609 aa  442  9.999999999999999e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1490  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  44.27 
 
 		 633 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1550  ABC transporter-related protein  44.56 
 
 		 625 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1631  ABC transporter related  41.05 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1379  ABC transporter ATP-binding protein  42.01 
 
 		 627 aa  436  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0006  ABC transporter, ATP-binding protein  43.04 
 
 		 541 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0668  ABC transporter related  45.3 
 
 		 534 aa  436  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2887  ABC transporter related  46.17 
 
 		 539 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.873295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1252  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.81 
 
 		 629 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0894712  normal  0.866591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0403  ABC transporter related  44.73 
 
 		 550 aa  437  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0999  glutathione transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 623 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.666718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0916  glutathione transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 623 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4781  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 		 703 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0434  ABC transporter related  40.97 
 
 		 522 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0889  glutathione transporter ATP-binding protein  43.29 
 
 		 623 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.448185  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  44.67 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3570  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.71 
 
 		 633 aa  438  1e-121  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.15689 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001228  ABC transporter ATP-binding protein  42.36 
 
 		 543 aa  438  1e-121  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  44.28 
 
 		 546 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0949  glutathione transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 623 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2452  ABC transporter related  41.45 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000520728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0961  ABC transporter related protein  44.08 
 
 		 563 aa  433  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1927  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein, C-terminal  42.61 
 
 		 629 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.831202  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0006  ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 		 550 aa  435  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0296287  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0261  ABC transporter, ATP-binding protein  43.52 
 
 		 539 aa  435  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.854245  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3970  ABC transporter related  42.68 
 
 		 640 aa  432  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3377  ABC transporter related  43.79 
 
 		 575 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.169433  normal  0.0551648 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7226  ABC transporter related  41.55 
 
 		 624 aa  435  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0885974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0625  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.82 
 
 		 623 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5232  ABC transporter related  44.63 
 
 		 552 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1562  ABC peptide transporter, duplicated ATPase subunits  44.76 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1617  ABC transporter-related protein  43.43 
 
 		 547 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.683358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0147  ABC transporter related  42.68 
 
 		 624 aa  432  1e-120  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.888744  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0464  ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1510  ABC transporter related  44.34 
 
 		 539 aa  435  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2286  ABC transporter related  40.87 
 
 		 617 aa  433  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.411723 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2269  ABC transporter related  44.92 
 
 		 532 aa  434  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.973177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2721  ABC transporter related  42.29 
 
 		 564 aa  432  1e-120  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.496484  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5758  ABC transporter related  42.91 
 
 		 611 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5362  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  41.68 
 
 		 611 aa  434  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6474  ABC transporter related  42.4 
 
 		 624 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.506325  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2813  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 623 aa  431  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.666718  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0534  ABC transporter, ATP-binding protein  44.32 
 
 		 536 aa  430  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  42.83 
 
 		 633 aa  429  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2057  ABC transporter related  43.18 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0471715  normal  0.693771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1038  ABC transporter related  45.54 
 
 		 545 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  41.57 
 
 		 640 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4454  ABC transporter related  41.8 
 
 		 619 aa  431  1e-119  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00023315 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3602  ABC transporter related  43.31 
 
 		 534 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121107  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3988  ABC transporter related  45.27 
 
 		 547 aa  431  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2519  glutathione transporter ATP-binding protein  42.29 
 
 		 623 aa  430  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.503965  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0140  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.53 
 
 		 632 aa  432  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.403478 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2975  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.74 
 
 		 633 aa  432  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1318  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.18 
 
 		 629 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0144402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2991  ABC transporter related  43.06 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2651  ABC transporter related  42.34 
 
 		 593 aa  430  1e-119  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0447316  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0751  ABC transporter related  45.21 
 
 		 557 aa  431  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.14 
 
 		 632 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2823  ABC transporter related  41.65 
 
 		 619 aa  431  1e-119  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0582166  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3273  acetamidase/formamidase  45.45 
 
 		 592 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1657  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  43.29 
 
 		 631 aa  430  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>