38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4788 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  933    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  86.24 
 
 		 462 aa  804    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  27.78 
 
 		 437 aa  152  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  26.81 
 
 		 429 aa  145  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  26.54 
 
 		 429 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  26.49 
 
 		 435 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  27.74 
 
 		 432 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  26.71 
 
 		 449 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  25.7 
 
 		 453 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  26.59 
 
 		 435 aa  117  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  27.08 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  25.67 
 
 		 511 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  25.79 
 
 		 431 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  29.67 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  25.71 
 
 		 477 aa  103  8e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  24.49 
 
 		 443 aa  98.2  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  25.91 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  25.91 
 
 		 473 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  25.44 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  26.11 
 
 		 468 aa  91.3  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  25.62 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  32.46 
 
 		 390 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 		 436 aa  57.4  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  27.22 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0543  hypothetical protein  33.33 
 
 		 518 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0399  hypothetical protein  27.56 
 
 		 566 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2052  hypothetical protein  27.56 
 
 		 566 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2394  hypothetical protein  30 
 
 		 456 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.600984  normal  0.360592 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  25 
 
 		 605 aa  52.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  30.92 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3558  hypothetical protein  25.15 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2418  hypothetical protein  31.96 
 
 		 483 aa  50.8  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00315022  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2267  hypothetical protein  26.85 
 
 		 553 aa  48.9  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.593229 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2204  hypothetical protein  25 
 
 		 409 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.843647 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4775  hypothetical protein  30.23 
 
 		 602 aa  44.3  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  25.62 
 
 		 549 aa  44.3  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3326  hypothetical protein  26.35 
 
 		 479 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  35.71 
 
 		 126 aa  43.1  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>