More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4012 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4012  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 285 aa  571  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0664049 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0512  transcriptional regulator LysR family  47.18 
 
 		 287 aa  254  8e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.440355  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1273  transcriptional regulator, LysR family  41.37 
 
 		 309 aa  203  3e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0230632  normal  0.266535 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1473  LysR family transcriptional regulator  40.49 
 
 		 283 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.551192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1438  LysR family transcriptional regulator  42.97 
 
 		 283 aa  192  7e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.371072  normal  0.234333 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1863  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0321846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3851  LysR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 283 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.522354  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5091  LysR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 295 aa  185  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0219442 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4825  transcriptional regulator, LysR family  42.31 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0864247  normal  0.0253512 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3993  LysR family transcriptional regulator  39 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1838  LysR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 296 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8381  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2309  putative transcriptional regulator  37.72 
 
 		 284 aa  182  7e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27280  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 284 aa  180  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0482  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 322 aa  178  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0438  transcriptional regulator, LysR family  36.68 
 
 		 322 aa  178  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4450  LysR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3624  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  37.01 
 
 		 296 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00214713  normal  0.293437 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0765  LysR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.144728  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0384  LysR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 316 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2995  LysR family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2346  transcriptional regulator, LysR family  35.9 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886093 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1319  transcriptional regulator, LysR family  39.69 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.232258  normal  0.131151 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1770  transcriptional regulator, LysR family  39.77 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6037  LysR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1284  LysR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32576  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1913  LysR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 290 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.980095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2133  LysR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 284 aa  165  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00732746  normal  0.30911 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5807  LysR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 283 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1479  LysR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 294 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0277632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0615  transcription regulator protein  36.06 
 
 		 289 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.528971 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1326  LysR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0433346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6632  LysR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 282 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.994606 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7706  LysR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 283 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5774  transcriptional regulator LysR family  35.91 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0405  LysR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 298 aa  161  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1608  LysR family transcriptional regulator  38.17 
 
 		 287 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5787  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6152  LysR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 282 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824926  normal  0.461056 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1806  LysR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 284 aa  160  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2477  LysR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 290 aa  159  5e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0185  LysR family transcriptional regulator  37.81 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1788  LysR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 298 aa  159  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00324618 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6020  LysR family transcriptional regulator  40.55 
 
 		 279 aa  158  8e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4785  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.285424  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4134  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.949354 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3382  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 291 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2821  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4357  transcriptional regulator, LysR family  35.88 
 
 		 283 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1647  LysR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 289 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4222  transcriptional regulator, LysR family  35.44 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5203  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 291 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.715781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3591  LysR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 292 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449761 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3317  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.176434 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0183  LysR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 319 aa  155  6e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5162  LysR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2391  transcriptional regulator, LysR family  35.91 
 
 		 293 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.586074 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0683  LysR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 283 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2046  LysR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 287 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.396353  normal  0.96684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1461  transcriptional regulator, LysR family  34.29 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4219  LysR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 283 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7267  transcriptional regulator, LysR family  37.79 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32360  lysR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 292 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0231568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0877  transcriptional regulator, LysR family  35.97 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.672229  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2951  transcriptional regulator, LysR family  35 
 
 		 304 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0070  LysR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 286 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2141  transcriptional regulator, LysR family  34.28 
 
 		 299 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.882286  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2980  LysR family transcriptional regulator  35 
 
 		 311 aa  153  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0695506  normal  0.804372 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2839  LysR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3636  transcriptional regulator, LysR family  33.33 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1867  LysR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 306 aa  152  5e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0745  LysR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 287 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0282  hypothetical protein  31.65 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5448  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1300  LysR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 299 aa  151  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.841181  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5053  transcriptional regulator, LysR family  36.36 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.426603  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2777  putative transcriptional regulator  34.74 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4653  LysR family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.519057 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2385  transcriptional regulator, LysR family  33.57 
 
 		 313 aa  150  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0284947  hitchhiker  0.00966213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0818  transcriptional regulator, LysR family  32.37 
 
 		 280 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0971009  normal  0.428032 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5238  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4898  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.552051 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5621  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 287 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0412955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0095  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 291 aa  149  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4609  LysR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 287 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46805  hitchhiker  0.000318313 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3829  LysR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.19019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5843  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3312  transcriptional regulator, LysR family  33.84 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6433  transcriptional regulator, LysR family  33.45 
 
 		 291 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00757839 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3226  LysR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60856 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0323  LysR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 283 aa  146  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4490  transcriptional regulator, LysR family  33.92 
 
 		 302 aa  145  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0277  hypothetical protein  30.22 
 
 		 283 aa  145  6e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2674  LysR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 294 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1559  LysR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.30474  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0795  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  33.09 
 
 		 291 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3167  LysR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 283 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2879  LysR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 284 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.624518 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1230  LysR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 284 aa  144  2e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69463  normal  0.27329 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3943  transcriptional regulator, LysR family  36.09 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  0.897444 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1911  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>