More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3282 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3282  peptide chain release factor H  100 
 
 		 204 aa  421  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.434629  normal  0.0508518 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0345  peptide chain release factor-like protein  41.75 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.196976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0354  peptide chain release factor-like protein  41.75 
 
 		 204 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0356  peptide chain release factor-like protein  41.75 
 
 		 204 aa  134  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000967755 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0349  peptide chain release factor-like protein  41.26 
 
 		 204 aa  134  9e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0364  peptide chain release factor-like protein  40.78 
 
 		 204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.429875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0332  putative peptide chain release factor  37.09 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0290  peptide chain release factor-like protein  38.12 
 
 		 204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.127156 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3597  peptide chain release factor-like protein  37.81 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0268  peptide chain release factor-like protein  37.44 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0233  peptide chain release factor-like protein  37.44 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3439  peptide chain release factor-like protein  37.31 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0263  peptide chain release factor-like protein  37.44 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3456  peptide chain release factor-like protein  34.83 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0652118  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01750  peptide chain release factor-like protein  36.82 
 
 		 207 aa  115  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.132154  normal  0.46874 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2314  peptide chain release factor 2  36.18 
 
 		 375 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00391464  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00231  peptide chain release factor 2  39.76 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3371  peptide chain release factor H  39.39 
 
 		 178 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00234  hypothetical protein  39.76 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2459  peptide chain release factor H  35.82 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.321859  normal  0.956081 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1124  class I peptide chain release factor domain-containing protein  47.74 
 
 		 207 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3177  peptide chain release factor 2  35.53 
 
 		 375 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.482998  normal  0.204125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0281  peptide chain release factor-like protein  38.79 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.568314 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2039  class I peptide chain release factor  37.63 
 
 		 202 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0242  peptide chain release factor-like protein  34.48 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72200  peptide chain release factor-like protein  35.47 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0049  peptide chain release factor 2  35.64 
 
 		 291 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2366  peptide chain release factor 2  37.06 
 
 		 364 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0760  peptide chain release factor H  31.28 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1289  peptide chain release factor 2  35.53 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.631072 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1461  peptide chain release factor 2  35.18 
 
 		 364 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0982  hypothetical protein  34.83 
 
 		 364 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0653  peptide chain release factor 2  35.96 
 
 		 369 aa  106  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0194  peptide chain release factor 2  36.18 
 
 		 299 aa  106  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.109294  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1686  peptide chain release factor 2  33.67 
 
 		 323 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7272  peptide chain release factor-like protein  31.5 
 
 		 210 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000014386  normal  0.97905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2340  peptide chain release factor 2  34.47 
 
 		 343 aa  105  5e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538916  normal  0.0748941 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0864  peptide chain release factor 2  35.18 
 
 		 366 aa  105  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0550001  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0796  peptide chain release factor 2  36.18 
 
 		 354 aa  104  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.570581  normal  0.0161038 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2844  peptide chain release factor 2  34.67 
 
 		 325 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.247067 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0793  peptide chain release factor 2  36.95 
 
 		 331 aa  103  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1645  peptide chain release factor 2  34.17 
 
 		 289 aa  104  1e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0834  peptide chain release factor 2  34.98 
 
 		 349 aa  103  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004438  peptide chain release factor 2  35.82 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3902  peptide chain release factor H  33.64 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0189567 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16510  putative peptide chain release factor 2  35.32 
 
 		 332 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1620  peptide chain release factor 2  37.13 
 
 		 366 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00133375  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3371  peptide chain release factor 2  36.27 
 
 		 378 aa  102  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0518428  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39400  peptide chain release factor 2  35.32 
 
 		 280 aa  102  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4861  peptide chain release factor-like protein  36.32 
 
 		 204 aa  102  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0755731 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2879  hypothetical protein  35.82 
 
 		 367 aa  102  5e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0818313  normal  0.0522954 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0819  peptide chain release factor 2  33.99 
 
 		 349 aa  101  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0281018 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4122  peptide chain release factor 2  35.78 
 
 		 304 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4227  peptide chain release factor 2  35.78 
 
 		 304 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358427  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1310  peptide chain release factor 2  35.64 
 
 		 329 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.496606  hitchhiker  0.00990577 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1100  peptide chain release factor 2  35.78 
 
 		 304 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0648  peptide chain release factor 2  33.67 
 
 		 365 aa  101  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2274  peptide chain release factor 2  35.03 
 
 		 310 aa  101  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00959  hypothetical protein  34.83 
 
 		 260 aa  101  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02770  Protein chain release factor B, RF-2  34.83 
 
 		 282 aa  101  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0501014  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2278  peptide chain release factor 2  35.53 
 
 		 372 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1500  hypothetical protein  35.15 
 
 		 293 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3275  peptide chain release factor 2  33.5 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.314712  normal  0.99195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1059  peptide chain release factor 2  36.1 
 
 		 280 aa  101  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304083  normal  0.661851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1360  peptide chain release factor 2  35.82 
 
 		 348 aa  100  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1707  peptide chain release factor 2  33.17 
 
 		 322 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2533  peptide chain release factor 2  31.16 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.123616 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2271  peptide chain release factor 2  35.18 
 
 		 310 aa  100  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1938  hypothetical protein  34 
 
 		 370 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.374727  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0479  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  36.36 
 
 		 365 aa  99.8  3e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5423  peptide chain release factor 2  35.03 
 
 		 391 aa  99.4  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3845  peptide chain release factor 2  31.98 
 
 		 375 aa  99.8  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1437  peptide chain release factor 2  34.83 
 
 		 382 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.33798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2135  peptide chain release factor 2  35.03 
 
 		 391 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.215067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1562  peptide chain release factor 2  34.67 
 
 		 280 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0271557  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5960  peptide chain release factor 2  35.03 
 
 		 391 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2117  peptide chain release factor 2  35.03 
 
 		 391 aa  99.4  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223622  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1963  peptide chain release factor 2  33.33 
 
 		 367 aa  98.6  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1742  hypothetical protein  34.17 
 
 		 335 aa  98.6  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0864  peptide chain release factor 2  33.17 
 
 		 365 aa  98.2  7e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3050  peptide chain release factor 2  32.66 
 
 		 365 aa  98.2  7e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02723  peptide chain release factor 2  33 
 
 		 365 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.139498  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1742  hypothetical protein  34.17 
 
 		 335 aa  98.2  8e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1213  peptide chain release factor 2  33.5 
 
 		 367 aa  98.2  8e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000166431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0818  peptide chain release factor 2  33 
 
 		 365 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3024  peptide chain release factor 2  33 
 
 		 365 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3297  hypothetical protein  33.83 
 
 		 365 aa  97.8  9e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1153  peptide chain release factor 2  34.52 
 
 		 248 aa  97.8  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449488  normal  0.0907567 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0599  peptide chain release factor 1  34.8 
 
 		 360 aa  97.8  9e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1479  peptide chain release factor 2, programmed  34.52 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3112  peptide chain release factor 2  34.52 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.826864  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1815  peptide chain release factor 2  35 
 
 		 402 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2206  peptide chain release factor 2, programmed  34.52 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2722  peptide chain release factor 2, programmed frameshift  34.52 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1172  peptide chain release factor 2  32.16 
 
 		 375 aa  97.8  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0421  hypothetical protein  33.83 
 
 		 365 aa  97.4  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0882  peptide chain release factor 2  33.67 
 
 		 365 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.989751  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0923  peptide chain release factor 2  33.67 
 
 		 310 aa  97.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.340647  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2027  peptide chain release factor 2  34.52 
 
 		 248 aa  97.4  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2644  peptide chain release factor 2  34.52 
 
 		 367 aa  96.7  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>