More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3165 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 299 aa  586  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  89 
 
 		 299 aa  527  1e-149  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  60.87 
 
 		 305 aa  348  6e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  43.31 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.42 
 
 		 296 aa  192  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  44.36 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.08 
 
 		 295 aa  186  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  37.98 
 
 		 305 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  37.93 
 
 		 285 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  37.93 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.95 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  40.48 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  37.93 
 
 		 286 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  39.72 
 
 		 289 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  37.63 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  38.28 
 
 		 289 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  41.64 
 
 		 296 aa  175  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.3 
 
 		 290 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  37.5 
 
 		 325 aa  175  9e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  40.77 
 
 		 283 aa  174  9.999999999999999e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  38.25 
 
 		 289 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  38.25 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  38.06 
 
 		 289 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.9 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  42.44 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  41.22 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.55 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.88 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  40.88 
 
 		 307 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  42.16 
 
 		 292 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  38.01 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.44 
 
 		 291 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.35 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  41.1 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  42.61 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  37.24 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  36.97 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  33.22 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  42.16 
 
 		 292 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  37.55 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  35.19 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  41.84 
 
 		 317 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  35.31 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  38.4 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  38.79 
 
 		 293 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  38.73 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  38.73 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  38.73 
 
 		 291 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.48 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  31.58 
 
 		 289 aa  145  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  30.77 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  32.99 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  37.39 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  38.21 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  38.21 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  38.21 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  38.21 
 
 		 301 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  38.21 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  38.21 
 
 		 301 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  37.86 
 
 		 301 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  32.99 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  37.55 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  34.39 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.41 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  29.86 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.29 
 
 		 299 aa  116  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  32.87 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.62 
 
 		 302 aa  105  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  30.56 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  27.34 
 
 		 281 aa  91.7  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  30.13 
 
 		 310 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.51 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  29.29 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.64 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  29.9 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  27.65 
 
 		 312 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  29.55 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  29.97 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.78 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  27.53 
 
 		 298 aa  72.4  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.03 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.03 
 
 		 297 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  26.24 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 287 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  27.67 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  29 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  30.04 
 
 		 287 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  29.33 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  28.42 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  29 
 
 		 295 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  27.54 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  28.67 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  29.29 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  29.33 
 
 		 287 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  26.74 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1803  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.04 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  27.27 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>