More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2842 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1421  DNA repair protein RecN  68.4 
 
 		 559 aa  681    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.564129  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2583  DNA repair protein RecN  97.49 
 
 		 557 aa  1051    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0083659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2879  DNA repair protein RecN  80.51 
 
 		 557 aa  859    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2071  DNA repair protein RecN  81.47 
 
 		 557 aa  874    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240609  hitchhiker  0.00158855 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1377  DNA repair protein RecN  68.4 
 
 		 559 aa  682    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.183083  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1998  DNA repair protein RecN  67.63 
 
 		 558 aa  675    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2842  DNA repair protein RecN  100 
 
 		 557 aa  1099    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.049374  hitchhiker  0.0050611 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1753  DNA repair protein RecN  67.22 
 
 		 554 aa  672    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0938  DNA repair protein RecN  59.75 
 
 		 555 aa  621  1e-176  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000961269  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1289  DNA repair protein RecN  59.25 
 
 		 561 aa  608  1e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2347  DNA repair protein RecN  59.93 
 
 		 557 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.724371 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6694  DNA repair protein RecN  60.33 
 
 		 557 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.478556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6163  DNA repair protein RecN (recombination protein N)  61.12 
 
 		 557 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0430688 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4037  DNA repair protein RecN  60.21 
 
 		 562 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0331  DNA repair protein RecN  58.11 
 
 		 565 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.398153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3295  DNA repair protein RecN  58.72 
 
 		 561 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2007  DNA repair protein RecN  59.96 
 
 		 561 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.518502 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3497  DNA repair protein RecN  57.87 
 
 		 553 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.185224 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1061  DNA repair protein RecN  58.54 
 
 		 561 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.73431 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2954  DNA repair protein RecN  59.78 
 
 		 566 aa  580  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0217727 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7433  DNA repair protein RecN  61.07 
 
 		 557 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.146948  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3383  DNA repair protein RecN  59.61 
 
 		 561 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.342411  normal  0.0146677 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3180  DNA repair protein RecN  59.78 
 
 		 566 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3137  DNA repair protein RecN  59.35 
 
 		 565 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103261 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0700  DNA repair protein RecN  57.12 
 
 		 554 aa  554  1e-156  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.415077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2431  DNA repair protein RecN  52.6 
 
 		 557 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2118  DNA repair protein RecN  48.53 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513575  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1736  DNA repair protein RecN  47.41 
 
 		 554 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0149698  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0793  DNA repair protein RecN  48.53 
 
 		 546 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.628008 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3161  DNA repair protein RecN  46.95 
 
 		 570 aa  405  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.957491  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4729  DNA repair protein RecN  49.19 
 
 		 553 aa  399  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.574204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4484  DNA repair protein RecN  47.56 
 
 		 547 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0703  DNA repair protein RecN  48.16 
 
 		 546 aa  390  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0692  DNA repair protein RecN  45.14 
 
 		 549 aa  390  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0261152  decreased coverage  0.000301908 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2747  DNA repair protein RecN  44.52 
 
 		 549 aa  382  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0940  DNA repair protein RecN  47.03 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.693692  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2067  DNA repair protein RecN  45.57 
 
 		 565 aa  377  1e-103  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.614381 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0756  DNA repair protein RecN  47.87 
 
 		 559 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2413  DNA repair protein  46.89 
 
 		 553 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00688711  normal  0.675409 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3099  DNA repair protein RecN  45.84 
 
 		 564 aa  350  3e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.545519  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3364  DNA repair protein RecN  37.1 
 
 		 559 aa  349  9e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.276138  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0546  DNA repair protein RecN  47.06 
 
 		 556 aa  344  2e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.419857 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0775  DNA repair protein RecN  38.24 
 
 		 552 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000179189 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4197  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 557 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.312426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4507  DNA repair protein RecN  37.28 
 
 		 557 aa  341  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5483  DNA repair protein RecN  38.64 
 
 		 558 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.582199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1191  DNA repair protein RecN  36.45 
 
 		 559 aa  330  6e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4595  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 557 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.202375 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63010  DNA repair protein RecN  38.46 
 
 		 558 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4729  DNA repair protein RecN  37.86 
 
 		 557 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00366375 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4730  DNA repair protein RecN  37.81 
 
 		 557 aa  326  7e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1480  DNA repair protein RecN  39.82 
 
 		 556 aa  325  1e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2739  DNA repair protein recN  34.46 
 
 		 555 aa  320  3e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0998  DNA repair protein RecN  37.46 
 
 		 589 aa  319  9e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2877  DNA repair protein recN  34.11 
 
 		 555 aa  318  1e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0761  DNA repair protein RecN  36.79 
 
 		 557 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345087  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3096  DNA repair protein RecN  38.65 
 
 		 557 aa  318  1e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0703  DNA repair protein RecN  37.32 
 
 		 557 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.926549  hitchhiker  0.000359109 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1763  DNA repair protein RecN  38.87 
 
 		 560 aa  315  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137867  normal  0.0495571 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2735  alkylhydroperoxidase AhpD core  34.82 
 
 		 557 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0271976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42990  DNA repair protein RecN  36.45 
 
 		 557 aa  309  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1034  DNA repair protein RecN  37.3 
 
 		 576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1774  DNA repair protein RecN  36.3 
 
 		 556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3626  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 558 aa  307  3e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1376  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000100313  normal  0.0248594 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2976  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0819489  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3359  recombination and repair protein  34.77 
 
 		 553 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0341558 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2889  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000988342  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02270  DNA repair ATPase RecN  34.51 
 
 		 561 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0378  recombination and repair protein  33.33 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.116911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0903  DNA repair protein RecN  36.15 
 
 		 554 aa  304  3.0000000000000004e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2316  DNA repair protein RecN  32.86 
 
 		 573 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0866  DNA repair protein RecN  33.93 
 
 		 555 aa  302  9e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0832  DNA repair protein RecN  36.17 
 
 		 554 aa  301  2e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.013795  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2888  DNA repair protein RecN  39.26 
 
 		 568 aa  301  3e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3856  recombination and repair protein  32.92 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00344363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1281  recombination and repair protein  33.69 
 
 		 553 aa  299  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000117137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3686  recombination and repair protein  33.93 
 
 		 553 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00128842  normal  0.127979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3218  recombination and repair protein  32.8 
 
 		 553 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3335  putative DNA repair protein  38 
 
 		 573 aa  297  4e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0637  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  296  6e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2768  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  296  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00054696  normal  0.107417 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5421  DNA repair protein RecN  35.66 
 
 		 591 aa  296  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1059  DNA repair protein RecN  32.74 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0987529  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2774  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000103072  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0661  DNA repair protein RecN  37.7 
 
 		 549 aa  296  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1068  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0569436  normal  0.137036 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1597  DNA repair protein RecN  36.86 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3096  recombination and repair protein  32.14 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.316238  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0259  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255628  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0743  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.259434  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4026  DNA repair protein RecN  32.41 
 
 		 579 aa  295  1e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0028037  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02504  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0788874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3831  DNA repair protein RecN  36.45 
 
 		 549 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0713  DNA repair protein RecN  36.62 
 
 		 549 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.685992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02468  hypothetical protein  32.74 
 
 		 553 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.116899  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2482  DNA repair protein RecN  38.56 
 
 		 568 aa  295  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0950  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0157368  hitchhiker  0.0000335441 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4284  DNA repair protein RecN  32.46 
 
 		 579 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0425411  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3005  recombination and repair protein  32.74 
 
 		 553 aa  293  4e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000658292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>