44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2689 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 
199 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  33.89 
 
 
193 aa  120  9.999999999999999e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  42.19 
 
 
194 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  41.79 
 
 
191 aa  114  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  37.04 
 
 
203 aa  113  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  36.22 
 
 
194 aa  112  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  43.1 
 
 
205 aa  107  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  35.33 
 
 
191 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  38.82 
 
 
193 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  38.82 
 
 
193 aa  104  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  39.68 
 
 
190 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  27.32 
 
 
199 aa  99.4  3e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  43.8 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  34.78 
 
 
191 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  30.59 
 
 
188 aa  94.7  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  30.41 
 
 
195 aa  90.9  1e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  29.95 
 
 
208 aa  85.1  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  39.68 
 
 
190 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  35.77 
 
 
206 aa  82  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  38.89 
 
 
190 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  28.85 
 
 
205 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  28.03 
 
 
172 aa  71.6  0.000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  37.37 
 
 
212 aa  71.2  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  37.61 
 
 
268 aa  68.2  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  32 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  35.43 
 
 
215 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  32.35 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  33.63 
 
 
220 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  31.36 
 
 
218 aa  58.5  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  25.84 
 
 
295 aa  58.2  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  24.72 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  29.92 
 
 
334 aa  56.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  33.33 
 
 
239 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  31.45 
 
 
215 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  23.35 
 
 
219 aa  53.9  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  31.63 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  38.14 
 
 
206 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  35.42 
 
 
229 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  35.45 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  24.53 
 
 
204 aa  49.3  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  23.67 
 
 
210 aa  48.5  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  29.25 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  24.26 
 
 
193 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  32.56 
 
 
211 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>