More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0769 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0769  putative cytochrome c  100 
 
 		 199 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  39.18 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2414  putative cytochrome c  36.32 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.281547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0810  putative cytochrome c4 precursor  35.98 
 
 		 198 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0618  cytochrome c, class I  36.17 
 
 		 212 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0312  putative cytochrome c4 precursor  35.37 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717329 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  37.89 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5803  cytochrome c class I  35.8 
 
 		 179 aa  98.6  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.182127  normal  0.316784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2787  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 188 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0984  cytochrome c, class I  33.53 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.336073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  36.36 
 
 		 266 aa  88.2  6e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 202 aa  87  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  31.15 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4355  cytochrome c, class I  36.42 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  29.78 
 
 		 209 aa  84.7  7e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4453  cytochrome c class I  32.48 
 
 		 226 aa  84.3  9e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12029  normal  0.150095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5824  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.311103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0432  cytochrome c  32.14 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660944  normal  0.289813 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5036  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2739  cytochrome c, class I  35.22 
 
 		 218 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2995  cytochrome c, class I  29.9 
 
 		 213 aa  83.6  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000155734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  31.28 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5589  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 255 aa  83.6  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.6296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4366  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  32.92 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  32.7 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  31.41 
 
 		 318 aa  81.3  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72460  cytochrome c4 precursor  33.53 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.462993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6289  cytochrome c4 precursor  33.53 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.484546  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  31.35 
 
 		 200 aa  80.1  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1131  cytochrome c class I  29.1 
 
 		 222 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  31.25 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0053  cytochrome c, class I  33.72 
 
 		 203 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.301772 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0157  cytochrome c, class I  33.7 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6834  cytochrome c, class I  32.93 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166956  normal  0.221701 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  31.15 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5813  cytochrome c, class I  32.7 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  29.61 
 
 		 205 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0913  cytochrome c, class I  31.03 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.826925  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5047  cytochrome c, class I  32.7 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  34.67 
 
 		 168 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2656  cytochrome c, class I  31.93 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.964453  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0687  cytochrome c class I  29.71 
 
 		 225 aa  79  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5102  cytochrome c class I  32.2 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0768786 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  30.81 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0126  cytochrome c4  33.17 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.813624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0143  cytochrome c, class I  33.17 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.286683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0690  cytochrome c class I  32.69 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0729078  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0141  cytochrome c class I  32.68 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  30.73 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  33.14 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0394  cytochrome c class I  31.74 
 
 		 209 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.091013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3139  di-heme cytochrome c, class IC  30.06 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0710  cytochrome c, class I  32.69 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.272303 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  31.28 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  32.09 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1223  cytochrome c, class I  29.61 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153054  normal  0.842605 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  30.11 
 
 		 224 aa  77  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0064  putative cytochrome C precursor  31.98 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215607  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0664  cytochrome c, class I  29.7 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0074134 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1764  cytochrome c, class I  31.12 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000218169  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  32.18 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  31.76 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1779  cytochrome c family protein  30.95 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1095  cytochrome c553-like protein  30.24 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0572  cytochrome c, class I  30.68 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4839  cytochrome c, class I  29.09 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.173442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  29.28 
 
 		 203 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1469  cytochrome c, class I  31.72 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0501042 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0523  cytochrome c family protein  30.48 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0129  cytochrome c-type protein  31.4 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19667  normal  0.20244 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1404  cytochrome c, class I  32.67 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2356  cytochrome c, class I  30.62 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  30.17 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3152  cytochrome c552  29.15 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.720354  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0754  putative cytochrome c  31.32 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.161807  normal  0.0258714 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0772  cytochrome c, class I  30.91 
 
 		 223 aa  73.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0288  cytochrome c class I  48.57 
 
 		 107 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403292 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2750  cytochrome c class I  29.15 
 
 		 230 aa  73.2  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0318755  hitchhiker  0.00000419826 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  28.88 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2987  oxidoreductase cytochrome C-type signal peptide protein  30.72 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3265  cytochrome c class I  31.55 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.838246  normal  0.141063 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0159  cytochrome c, class I  30.5 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5446  putative cytochrome c4 precursor  32.81 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.712541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  31.61 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2918  cytochrome c class I  31.55 
 
 		 219 aa  72.4  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00059713 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  30.49 
 
 		 219 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  32.14 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  29.05 
 
 		 206 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  30.86 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  34.78 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  34.78 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0085  cytochrome c553-like protein  24.56 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0670  cytochrome c553  33.54 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.680454  normal  0.316567 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  30.29 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1673  cytochrome c, class I  30.6 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1322  putative cytochrome c  32.21 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  30.29 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  31.15 
 
 		 219 aa  71.2  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>